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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G399740
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 99376924-99382438 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1649 bp · TkA03G399740|TK1151|cDNA

TAGTAAGCGAGCATTGCTTTAGAAAATCACATCATCGCTGACGAGAGTTTCTTGCGGGAAAAGATAATTGGGGTTCTATTTATCATACTATTCCAATCCAATACGTAGAGATTGTCGACGAATTTGGTTACCGGCGGAGCTCCGTCAATTGTGTTTCCATCATCTGGTTCGAATTGTTTAGTTTCTTACAGCAATAGCAGGTGAAGGAGTTCTCCACCATGGATCTCAATGATCTCAACAAAGTCTGGGAAGTGAAACCT...

CDS

下载 CDS FASTA

822 bp · TkA03G399740|TK1151|CDS

ATGCGAAAGCACAATTGGAAAGTCAACATCCTCTCTGAATTCTGCCCTCCAAATCCCGCTCTTCTTGGCCTAAACATAAACGGAGGGGCAGAAGTAAAACTCAGACTTCGTAGACAAAACAACGAATGGGACTTCTTCCCATTTGAACAAATCCTTGACACCATGCTTCATGAGCTTTGCCACAACCAGTATGGCCCACACAATGCTGACTTCTACAACCTTCTAGATGAAATCAGAAAGGAATGTGAAGAATTGATGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

273 aa · TkA03G399740|TK1151|PROTEIN

MRKHNWKVNILSEFCPPNPALLGLNINGGAEVKLRLRRQNNEWDFFPFEQILDTMLHELCHNQYGPHNADFYNLLDEIRKECEELMAKGITGTGRGFDLPGRRLGGYNRPQTSSSLRQKALSAAQNRAQMGIVMPAGPHRLGGDSSLRTALSPIQAAAMAAERRLHDDLWCASKSSQSLELSGSSEPSVSISSSEESLSLWECDTCTLLNQALVLTCEACGNPRKEGKKKMKIWSCKFCTLQNLEGKERCVACGEWRYSY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G399740
TK1151 IDTkA03G399740
OH-1004 IDLXL04_009121
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 81.493
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G399740
位置Chr03:99376924-99382438 (-)
描述Similar to WSS1: DNA-dependent metalloprotease WSS1 (Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009121 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0016925 protein sumoylation 生物过程
GO:0019985 translesion synthesis 生物过程
GO:0036205 histone catabolic process 生物过程
GO:0106300 protein-DNA covalent cross-linking repair 生物过程
GO:1990414 replication-born double-strand break repair via sister chromatid exchange 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003690 double-stranded DNA binding 分子功能
GO:0003697 single-stranded DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
sce:YHR134W
spo:2538751
spo:2543468
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.725
排名 1 · TkA03G399740 · TK1151
细胞质0.382
排名 2 · TkA03G399740 · TK1151
细胞膜0.040
排名 3 · TkA03G399740 · TK1151
线粒体0.039
排名 4 · TkA03G399740 · TK1151
内质网0.035
排名 5 · TkA03G399740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08325WLM1-165 aa
PF01863YgjP-like55-84 aa
PF15811SVIP111-129 aa
PF15811SVIP149-166 aa
PF03408Foamy_virus_ENV189-257 aa
PF00641Zn_ribbon_RanBP201-225 aa
PF28755DUF8455202-221 aa
PF12773DZR203-254 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G399740PF08325WLM11652.7e-50171.8
TkA03G399740PF01863YgjP-like55840.001719.2
TkA03G399740PF15811SVIP1111290.009616.8
TkA03G399740PF15811SVIP1491660.009616.8
TkA03G399740PF03408Foamy_virus_ENV1892570.0213.4
TkA03G399740PF00641Zn_ribbon_RanBP2012251.8e-0937.4
TkA03G399740PF28755DUF84552022214.18.1
TkA03G399740PF12773DZR2032540.7510.7
TkA03G399740PF00641Zn_ribbon_RanBP2342541.8e-0937.4
TkA03G399740PF28755DUF84552452604.18.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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