TkA03G387360 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G387360

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 95834775-95837264 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1347 bp · TkA03G387360|TK1151|cDNA

CTTTTTCTTGGTAGGTACGCGAGTAACCATTTGCAAGTTTTCCTTGTAGGTCCCTGGTCCCCTGTCACCCTGTGCAACCCCTACTAATATCCAGATCCCAATCCTGATCCAATTACGATTCACTAAACTTGCCGATTGACTTCGTTATCCTAATTCACCAATTTCTAGGTTATTTTATGTTACGTTATTCCACTAATGCGTGTACGAAATCTTGATATTCGTGTTTACGGATGCATTTGAACTAGAAATTACCACAATAA...

CDS

下载 CDS FASTA

759 bp · TkA03G387360|TK1151|CDS

ATGGGTGCGGCGGCGAGCTCGTCATCCTCGAGATCGAGCTCGCTGACGGTGGGGGAAAAAGTATGTGCGGCGTTCATACCGTGTGCGGTTATAGTTGAAGTTCTGATCTACAGCTTATTGTCCTGTTTCAATGCTCAGCGCAGCCGTCTGGTTAAACATGTGCAGACTTTTGACGAAGTTAGTCGTCTCGCTCGTAATTCTCCATTTTCGGTTAACGAAGTGGAAGCATTACGCGAATTGTTCAATAAGTTGAGCAATTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

252 aa · TkA03G387360|TK1151|PROTEIN

MGAAASSSSSRSSSLTVGEKVCAAFIPCAVIVEVLIYSLLSCFNAQRSRLVKHVQTFDEVSRLARNSPFSVNEVEALRELFNKLSNSIIMDGLIHKEELQLALFNSAGGENLFLNRVFDLFDEKQNGVIEFEEFVHVLSIFHPNAPMEQKIDFAFRLYDLRRTGYIEREEVREMIVATLKETGMVLSEEILEQIIDKTFMDADADMDGRISKDEWRNFVIYRPQLLKNMTLPSLRDVTTAFPSFIFNTGVDD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G387360`
TK1151 ID	TkA03G387360
OH-1004 ID	LXL04_008302
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	91.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G387360

位置 Chr03:95834775-95837264 (+)

描述 Similar to CBL10: Calcineurin B-like protein 10

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g33000`	充当钙传感器。	SCABP8/CBL10, a putative calcium sensor, interacts with the protein kinase SOS2 to protect Arabidopsis shoots from salt stress.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.042291 The calcium sensor CBL10 mediates salt tolerance by regulating ion homeostasis in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03249.x Calcineurin B-like protein CBL10 directly interacts with AKT1 and modulates K+ homeostasis in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12123

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0579600`	充当钙传感器。	暂无已核实直接文献
`Os01g0711500`	充当钙传感器。	暂无已核实直接文献
`Os12g0162400`	充当钙传感器。	暂无已核实直接文献
`Os12g0597000`	充当钙传感器。	A gibberellin-regulated calcineurin B in rice localizes to the tonoplast and is implicated in vacuole function.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.062703

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008302 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程

GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程

GO:0043266 regulation of potassium ion transport 生物过程

GO:0050801 monoatomic ion homeostasis 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005768 endosome 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分

GO:0032578 aleurone grain membrane 细胞组分

GO:0005509 calcium ion binding 分子功能

GO:0019900 kinase binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G33000

dosa:Os01g0711500

dosa:Os12g0162400

dosa:Os12g0597000

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.256

排名 1 · TkA03G387360 · TK1151

细胞质0.248

排名 2 · TkA03G387360 · TK1151

内质网0.214

排名 3 · TkA03G387360 · TK1151

溶酶体／液泡0.179

排名 4 · TkA03G387360 · TK1151

高尔基体0.169

排名 5 · TkA03G387360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14883GHL1355-120 aa

PF13499EF-hand_764-81 aa

PF12763EH73-138 aa

PF25825SAPC2_N74-87 aa

PF13405EF-hand_677-103 aa

PF20743DUF5580_C79-90 aa

PF10591SPARC_Ca_bdg81-135 aa

PF13202EF-hand_590-100 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G387360	`PF14883`	GHL13	55	120	0.0098	15.7
TkA03G387360	`PF13499`	EF-hand_7	64	81	1.3e-14	55.0
TkA03G387360	`PF12763`	EH	73	138	0.00021	21.9
TkA03G387360	`PF25825`	SAPC2_N	74	87	0.34	11.5
TkA03G387360	`PF13405`	EF-hand_6	77	103	7.3e-15	53.9
TkA03G387360	`PF20743`	DUF5580_C	79	90	0.12	13.1
TkA03G387360	`PF10591`	SPARC_Ca_bdg	81	135	0.0034	18.4
TkA03G387360	`PF13202`	EF-hand_5	90	100	2.5e-13	49.5
TkA03G387360	`PF00036`	EF-hand_1	91	103	2.2e-17	62.0
TkA03G387360	`PF13499`	EF-hand_7	91	138	1.3e-14	55.0
TkA03G387360	`PF13833`	EF-hand_8	96	138	2.2e-05	24.8
TkA03G387360	`PF30347`	RSA-1_C	101	177	0.0015	19.5
TkA03G387360	`PF23564`	EF-hand_FSTL1	109	138	7.3e-06	27.1
TkA03G387360	`PF23564`	EF-hand_FSTL1	110	139	7.3e-06	27.1
TkA03G387360	`PF30624`	EF_SSP120	113	135	3.9e-06	28.1
TkA03G387360	`PF00036`	EF-hand_1	114	139	2.2e-17	62.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q7FRS8`	拟南芥	sp\|Q7FRS8\|CNBLA_ARATH Calcineurin B-like protein 10	65.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q3HRN8`	水稻	sp\|Q3HRN8\|CNBL9_ORYSJ Calcineurin B-like protein 9	57.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q3HRN7`	水稻	sp\|Q3HRN7\|CNBLA_ORYSJ Calcineurin B-like protein 10	58.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q3HRP1`	水稻	sp\|Q3HRP1\|CNBL6_ORYSJ Calcineurin B-like protein 6	61.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q3HRP5`	水稻	sp\|Q3HRP5\|CNBL2_ORYSJ Calcineurin B-like protein 2	59.400%	Swiss-Prot	高置信

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