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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G383110
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 94593768-94594175 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

408 bp · TkA03G383110|TK1151|cDNA

ATGGAAATGAGTGTTTTGAGCTTCAACCTACCGTTATCCTTCGGATCTGTTCAAGGACTTGATGCTAAGACGATCTATACTCCGATCTGCTATACGACGAGAGCAACAAGATGTCAGAGGGCTTCAGTTATTGCGAACGGGATAGGAGGAGGATCGGCCAAGTACAAAGGAACACAGATGAGAGAGAAAAAGCTGACGGAGTTGATCGAGTCAAAAATCGCTGAAGCTACGCAAGTTTGTGAGGGGGATCGTGACTCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

408 bp · TkA03G383110|TK1151|CDS

ATGGAAATGAGTGTTTTGAGCTTCAACCTACCGTTATCCTTCGGATCTGTTCAAGGACTTGATGCTAAGACGATCTATACTCCGATCTGCTATACGACGAGAGCAACAAGATGTCAGAGGGCTTCAGTTATTGCGAACGGGATAGGAGGAGGATCGGCCAAGTACAAAGGAACACAGATGAGAGAGAAAAAGCTGACGGAGTTGATCGAGTCAAAAATCGCTGAAGCTACGCAAGTTTGTGAGGGGGATCGTGACTCCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

135 aa · TkA03G383110|TK1151|PROTEIN

MEMSVLSFNLPLSFGSVQGLDAKTIYTPICYTTRATRCQRASVIANGIGGGSAKYKGTQMREKKLTELIESKIAEATQVCEGDRDSDECKVAWDEVEEVSQAKADLRRKLDENKDPLQSFCEENPETDECRIYED

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G383110
TK1151 IDTkA03G383110
OH-1004 IDLXL04_008321
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.296 / OH-1004 67.010
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G383110
位置Chr03:94593768-94594175 (-)
描述Similar to CP12-3: Calvin cycle protein CP12-3, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g76560 在 PRK/GAPDH 核心复合物的组装中充当必需的连接子。
In vitro characterization of Arabidopsis CP12 isoforms reveals common biochemical and molecular properties.2010 · DOI: 10.1016/j.jplph.2010.02.008
At3g62410 在 PRK/GAPDH 核心复合物的组装中充当必需的连接子。
In vitro characterization of Arabidopsis CP12 isoforms reveals common biochemical and molecular properties.2010 · DOI: 10.1016/j.jplph.2010.02.008
At2g47400 在 PRK/GAPDH 核心复合物的组装中充当必需的连接子。
In vitro characterization of Arabidopsis CP12 isoforms reveals common biochemical and molecular properties.2010 · DOI: 10.1016/j.jplph.2010.02.008

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008321 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0018316 peptide cross-linking via L-cystine 生物过程
GO:0019253 reductive pentose-phosphate cycle 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0065003 protein-containing complex assembly 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:0071454 cellular response to anoxia 生物过程
GO:0080153 negative regulation of reductive pentose-phosphate cycle 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G76560
ath:AT2G47400
ath:AT3G62410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.981
排名 1 · TkA03G383110 · TK1151
线粒体0.029
排名 2 · TkA03G383110 · TK1151
细胞质0.018
排名 3 · TkA03G383110 · TK1151
细胞核0.016
排名 4 · TkA03G383110 · TK1151
细胞膜0.009
排名 5 · TkA03G383110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06404PSK45-89 aa
PF26829ValRS_modifier55-90 aa
PF02672CP1265-134 aa
PF06404PSK104-130 aa
PF26829ValRS_modifier105-134 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G383110PF06404PSK45893.79.4
TkA03G383110PF26829ValRS_modifier55900.3411.6
TkA03G383110PF02672CP12651343.5e-2486.0
TkA03G383110PF06404PSK1041303.79.4
TkA03G383110PF26829ValRS_modifier1051340.3411.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C9K2拟南芥sp|Q9C9K2|CP123_ARATH Calvin cycle protein CP12-3, chloroplastic71.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LZP9拟南芥sp|Q9LZP9|CP122_ARATH Calvin cycle protein CP12-2, chloroplastic45.900%Swiss-Prot中等置信
O22914拟南芥sp|O22914|CP121_ARATH Calvin cycle protein CP12-1, chloroplastic47.300%Swiss-Prot中等置信

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