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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G366910
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 90509834-90511860 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1669 bp · TkA03G366910|TK1151|cDNA

ACATTACTACGATATAAATCCCTTCCCGATGGACACTGTCCACTGTCTTAATTTCTTTGCATATCCCCAAAACCACAATCAAATTCTCTGAGTAATTTTCTAACAGCTTCAATCTAGGGTTTCTATCAGGGTATTCATGTTTCTTGATTCGCGTCCGCTCAACGAAAAATTCCTAAATTTGCTGTTTCTCTGTATAGAATTTCATTAAATCGAGTTTAATCGTCGCTGAATACTGGGATCTGTTATTTCTCTCGATTGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1110 bp · TkA03G366910|TK1151|CDS

ATGGATGACAAGGAAGATTCTAAACACCGACCCAGTTATGGTTTAAATCAAGGTTACGGTTCATTGCAGAATATAACATACACACAGTCTCAGATTGTCAAGTATGCTGACGAGGATGATGATGAAGTAGAAGAAGACGATGAAGAAGAACAAGAACAAGAACAAGAAGAAACAAATGTTGGTGATAATGACACTCAACAAAATGGCAATCATGAAAACAACGATAATCAATTTGACGATGATGAAGAAGATGAAGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

369 aa · TkA03G366910|TK1151|PROTEIN

MDDKEDSKHRPSYGLNQGYGSLQNITYTQSQIVKYADEDDDEVEEDDEEEQEQEQEETNVGDNDTQQNGNHENNDNQFDDDEEDEDDDNDDENRRKDSVNLQRHPKKRKLKSLLSSYAFAPRVPPPSMAPPPKSSFGGRNTLTDWSEHETFVLLDAWGERFFQCGRKSLRSEEWQEVADRVSQESKIERTDSQCRNRLDTLKKKYKKEKASLTGSRIVNTKWVYFKKIDMLLSGENVSLNPSSVHLNPANGVDDMRDSDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G366910
TK1151 IDTkA03G366910
OH-1004 IDLXL04_008489
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 86.417
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G366910
位置Chr03:90509834-90511860 (+)
描述Similar to ASIL1: Trihelix transcription factor ASIL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g05550 可能的转录调节因子（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At1g54060 能结合特定DNA序列的转录抑制因子，如AT2S3启动子中的GT-box样基序5'-CGTGATT-3'。
Repression of seed maturation genes by a trihelix transcriptional repressor in Arabidopsis seedlings.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.061309
MicroRNAs regulate the timing of embryo maturation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.171355
ASIL1 is required for proper timing of seed filling in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.4161/psb.6.12.18709
At3g11100 转录调节因子。
Interaction of Arabidopsis Trihelix-Domain Transcription Factors VFP3 and VFP5 with Agrobacterium Virulence Protein VirF.2015 · DOI: 10.1371/journal.pone.0142128
At3g14180 转录调控因子，可能在早期胚胎发生期间抑制成熟程序。
MicroRNAs regulate the timing of embryo maturation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.171355

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008489 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G54060
ath:AT3G11100
ath:AT3G14180
ath:AT5G05550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.984
排名 1 · TkA03G366910 · TK1151
细胞质0.063
排名 2 · TkA03G366910 · TK1151
细胞膜0.019
排名 3 · TkA03G366910 · TK1151
内质网0.012
排名 4 · TkA03G366910 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA03G366910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12722Hid119-107 aa
PF30130VID28_C27-108 aa
PF05432BSP_II28-150 aa
PF04006Mpp1029-106 aa
PF25184YxzE68-88 aa
PF13837Myb_DNA-bind_4144-231 aa
PF12776Myb_DNA-bind_3145-210 aa
PF04504GeBP-like_DBD145-215 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G366910PF12722Hid1191071.18.1
TkA03G366910PF30130VID28_C271088.25.8
TkA03G366910PF05432BSP_II281502.8e-0524.7
TkA03G366910PF04006Mpp10291060.005816.2
TkA03G366910PF25184YxzE68880.04115.6
TkA03G366910PF13837Myb_DNA-bind_41442311.4e-1971.0
TkA03G366910PF12776Myb_DNA-bind_31452100.00120.7
TkA03G366910PF04504GeBP-like_DBD1452150.004218.5
TkA03G366910PF10545MADF_DNA_bdg1662290.0001522.7
TkA03G366910PF13873Myb_DNA-bind_51672100.02715.1
TkA03G366910PF00249Myb_DNA-binding1671990.0913.6
TkA03G366910PF04006Mpp101783590.005816.2
TkA03G366910PF25184YxzE2542930.04115.6
TkA03G366910PF10545MADF_DNA_bdg3073330.0001522.7
TkA03G366910PF04504GeBP-like_DBD3103180.004218.5
TkA03G366910PF12776Myb_DNA-bind_33233280.00120.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FFG0拟南芥sp|Q9FFG0|ENAP2_ARATH Trihelix transcription factor ENAP236.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SYG2拟南芥sp|Q9SYG2|ASIL1_ARATH Trihelix transcription factor ASIL148.900%Swiss-Prot低置信
Q8VZI9拟南芥sp|Q8VZI9|ENAP1_ARATH Trihelix transcription factor ENAP141.600%Swiss-Prot低置信
Q9LJG8拟南芥sp|Q9LJG8|ASIL2_ARATH Trihelix transcription factor ASIL248.400%Swiss-Prot低置信

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