TkA03G359280 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G359280

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 88624595-88627546 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1503 bp · TkA03G359280|TK1151|cDNA

GCAGTGAGCAGTGAAATCAATGGGAATTTCAAATTTAAAATCAAAATCGTACAACATAAGATGCTTTTGAATTCTGCTCCTTTCTTGTCAATTAACATAAACAAACAAAAACCGTATTCACTTTGTGAATTATTGTTTCCAGGTTTTTATTATTATGTCTCTGTTTTACCCTATTCATACCCATGTTGTTCTTGAATCTTGATTATTGAAAGTCATCCATGGTAATGATGATAAGTTAGACGCTTGAACTTCACTTTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

768 bp · TkA03G359280|TK1151|CDS

ATGTCGAAGATGAGTTATTCAAGTGCTTCAATGGGTTCCGGTAGTAGAACCGCTAGGAGAACCGTTGAATTTGGAAGGACATATGTTGTGAGGCCAAAAGCAAAACACCAAGCAACTATAGTTTGGTTGCATGGACTTGGCGATAATGGTTCAAGCTGGTCACAACTCTTGGACAATCTTCCTCTTCCAAATATAAAATGGATATGCCCAACTGCTCCTACTCGCCCAGTGAGCGCGCTTGGTGGATTCCCTTGTGCTGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

255 aa · TkA03G359280|TK1151|PROTEIN

MSKMSYSSASMGSGSRTARRTVEFGRTYVVRPKAKHQATIVWLHGLGDNGSSWSQLLDNLPLPNIKWICPTAPTRPVSALGGFPCAAWFDEGELSEDGPNDVEGLDASIAHIANLLSTEPSDVKLGIGGFSMGAACALYSAACFAQGKYGNGNPYPINLKAVVGLSGWLPGARNLRNKIGGSNEAARRAASLPILLCHGLCDEVVPYTYGERSSQMMSSAGFRYVTFKTYQGLGHYTVPKEMEEVCQWLNGRLAA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G359280`
TK1151 ID	TkA03G359280
OH-1004 ID	LXL04_008557
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA03G359280`
位置	Chr03:88624595-88627546 (-)
描述	Similar to Lypla2: Acyl-protein thioesterase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_008557` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0002084 protein depalmitoylation 生物过程 GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程 GO:0015908 fatty acid transport 生物过程 GO:0042997 negative regulation of Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程 GO:0046464 acylglycerol catabolic process 生物过程 GO:1905336 negative regulation of aggrephagy 生物过程 GO:1905344 prostaglandin catabolic process 生物过程 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005795 Golgi stack 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	hsa:10434 hsa:11313 mmu:26394 pon:100172358 rno:83510 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.645

排名 1 · TkA03G359280 · TK1151

细胞质0.343

排名 2 · TkA03G359280 · TK1151

质体0.084

排名 3 · TkA03G359280 · TK1151

细胞膜0.054

排名 4 · TkA03G359280 · TK1151

内质网0.043

排名 5 · TkA03G359280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02230Abhydrolase_228-250 aa

PF04083Abhydro_lipase33-54 aa

PF12146Hydrolase_435-65 aa

PF00561Abhydrolase_139-61 aa

PF12697Abhydrolase_640-158 aa

PF03959FSH164-220 aa

PF01738DLH109-235 aa

PF01764Lipase_3111-148 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G359280	`PF02230`	Abhydrolase_2	28	250	5.5e-42	144.8
TkA03G359280	`PF04083`	Abhydro_lipase	33	54	0.31	11.3
TkA03G359280	`PF12146`	Hydrolase_4	35	65	1.9e-06	28.1
TkA03G359280	`PF00561`	Abhydrolase_1	39	61	0.078	13.3
TkA03G359280	`PF12697`	Abhydrolase_6	40	158	0.0001	23.7
TkA03G359280	`PF03959`	FSH1	64	220	1.2e-09	38.9
TkA03G359280	`PF01738`	DLH	109	235	0.0011	19.3
TkA03G359280	`PF01764`	Lipase_3	111	148	0.077	13.6
TkA03G359280	`PF12146`	Hydrolase_4	112	139	1.9e-06	28.1
TkA03G359280	`PF03583`	LIP	117	149	0.0011	19.1
TkA03G359280	`PF00326`	Peptidase_S9	124	139	0.0053	17.0
TkA03G359280	`PF00561`	Abhydrolase_1	124	143	0.078	13.3
TkA03G359280	`PF00561`	Abhydrolase_1	149	230	0.078	13.3
TkA03G359280	`PF12697`	Abhydrolase_6	178	236	0.0001	23.7
TkA03G359280	`PF04083`	Abhydro_lipase	181	202	0.31	11.3
TkA03G359280	`PF12146`	Hydrolase_4	186	237	1.9e-06	28.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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