基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA03G355420
当前版本: TK1151
染色体: Chr03
坐标: 87671198-87673131
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1092 bp · TkA03G355420|TK1151|cDNA
ATGCAGTACTTGTATCATCAAAGACAACGACCTGCTGATAATAGTATTGCATACTGGAGGAAGTTTGTAGCGGAGTATTATTCTCCACGTGCGAAAAAAAGATGGGATGCATGGCATTGTGAGATTTGTGGGTCAAAGTCAGGAAGAGTTGGTTTTGAGGCAACATTTGAAGTACTTCCAAGACTTAATGAGATAAAATTCAGCAGTGGTGTGATTGATGAGCTTTTGTTTCTTGACTTACCACGTGAGAGTCGATTTCC...
CDS
下载 CDS FASTA1092 bp · TkA03G355420|TK1151|CDS
ATGCAGTACTTGTATCATCAAAGACAACGACCTGCTGATAATAGTATTGCATACTGGAGGAAGTTTGTAGCGGAGTATTATTCTCCACGTGCGAAAAAAAGATGGGATGCATGGCATTGTGAGATTTGTGGGTCAAAGTCAGGAAGAGTTGGTTTTGAGGCAACATTTGAAGTACTTCCAAGACTTAATGAGATAAAATTCAGCAGTGGTGTGATTGATGAGCTTTTGTTTCTTGACTTACCACGTGAGAGTCGATTTCC...
363 aa · TkA03G355420|TK1151|PROTEIN
MQYLYHQRQRPADNSIAYWRKFVAEYYSPRAKKRWDAWHCEICGSKSGRVGFEATFEVLPRLNEIKFSSGVIDELLFLDLPRESRFPSGIMMLNTGRQFKKVYMNMHVLFAKILTWEFCARRHEELLPRRLVAPQVNQLLQVAQKCQSTISEGDLMGFSARSANKQVVTAWRQLARSLELQSLNDLGFSKRYVRCLQISEVVSSMKELIDFCQVNKVGPIEGLKSYPRVGPAKMEMGQVSGSQMVNNRGASSPQSALTLM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA03G355420 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA03G355420 |
| OH-1004 ID | LXL04_011932 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 52.900 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 74.380 / OH-1004 46.914覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA03G355420 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:87671198-87673131 (-) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to SLK1: Probable transcriptional regulator SLK1 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0001666 response to hypoxia 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006974 DNA damage response 生物过程 GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程 GO:0009617 response to bacterium 生物过程 GO:0009620 response to fungus 生物过程 GO:0009624 response to nematode 生物过程 GO:0009733 response to auxin 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0009909 regulation of flower development 生物过程 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G43850 ath:AT4G25515 ath:AT4G25520 ath:AT5G62090 mgr:MGG_01057 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.800
细胞质0.235
细胞膜0.035
线粒体0.034
内质网0.022
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01803LIM_bind1-224 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA03G355420 | PF01803 | LIM_bind | 1 | 224 | 5.4e-46 | 157.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q94BP0 | 拟南芥 | sp|Q94BP0|SLK2_ARATH Probable transcriptional regulator SLK2 | 52.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
F4JT98 | 拟南芥 | sp|F4JT98|SLK3_ARATH Probable transcriptional regulator SLK3 | 51.100% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q0WVM7 | 拟南芥 | sp|Q0WVM7|SLK1_ARATH Probable transcriptional regulator SLK1 | 54.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q8W234 | 拟南芥 | sp|Q8W234|SEUSS_ARATH Transcriptional corepressor SEUSS | 47.900% | Swiss-Prot | 中等置信 |