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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G353910
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 87301747-87305367 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2191 bp · TkA03G353910|TK1151|cDNA

GTGACTTGCTAACAGGTTGTGGTGACCTGATAACCTACTAAATGGAGAATTTGACACAATTTGCCCAAATTTTGGGGTTATCCCCTAAGAAAACACATTTAGAGACAAATTGGTCGCTTTTACGACAAAAGGCCAAAAGAAAAGGGCACTTCATTTTCCTTCGCTTACCCCGCGTCTTTCTTCGATCTCATTTTCCATATGCCGTGGAATGCCCGCCTCTCCAAATCTTGATTTTCCGGTGATCATAACTATACTTCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

633 bp · TkA03G353910|TK1151|CDS

ATGTCCACGTTGCCGGAGCACCCAAATATAGTGAAGCTTCGTGCTACATATGAGGATCATGAAGCTGTTCATTTGGTGATGGAGCTCTGCGAGGGTGGAGAGCTGTTTGACAGAATCGTTGCTAGAGGGCAATACAGTGAACGAGCTGCCGCCGAAATCGCCAAGACGGTGGCGGAGGTGGTGAAGATGTGCCATGAAAATGGGGTAATTCATAGAGACTTGAAGCCGGAGAACTTTTTGTTTGCTAATAAGAAAGAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

210 aa · TkA03G353910|TK1151|PROTEIN

MSTLPEHPNIVKLRATYEDHEAVHLVMELCEGGELFDRIVARGQYSERAAAEIAKTVAEVVKMCHENGVIHRDLKPENFLFANKKENSAALKVIDFGLSVFWKPGQKFSEIGGSPYYTAPEVLRRNYGPEVDIWSAGVILYILLCGVPPFWAETEQGVTLSILRGVIDFKREPWPQISENAKSLVKQMLEPNPKKRLTAQQVLEHPWGIE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G353910
TK1151 IDTkA03G353910
OH-1004 IDLXL04_008604
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.524 / OH-1004 36.174
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G353910
位置Chr03:87301747-87305367 (-)
描述Similar to CPK30: Calcium-dependent protein kinase 30
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g74740 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g18890 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Two genes that encode Ca(2+)-dependent protein kinases are induced by drought and high-salt stresses in Arabidopsis thaliana.1994 · DOI: 10.1007/bf00286684
At2g41860 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g51850 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0568600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008604 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18890
ath:AT1G74740
dosa:Os01g0832300
dosa:Os03g0688300
dosa:Os07g0568600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.593
排名 1 · TkA03G353910 · TK1151
细胞核0.582
排名 2 · TkA03G353910 · TK1151
细胞膜0.075
排名 3 · TkA03G353910 · TK1151
线粒体0.049
排名 4 · TkA03G353910 · TK1151
内质网0.047
排名 5 · TkA03G353910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1-204 aa
PF00069Pkinase6-207 aa
PF06293Kdo24-97 aa
PF01163RIO124-85 aa
PF03109ABC125-104 aa
PF01636APH44-100 aa
PF14531Kinase-like46-196 aa
PF07914DUF167946-107 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G353910PF07714PK_Tyr_Ser-Thr12042.7e-2280.0
TkA03G353910PF00069Pkinase62071e-64219.2
TkA03G353910PF06293Kdo24971.6e-0731.7
TkA03G353910PF01163RIO124850.01315.9
TkA03G353910PF03109ABC1251048.8e-0625.8
TkA03G353910PF01636APH441000.001519.1
TkA03G353910PF14531Kinase-like461965.7e-0523.2
TkA03G353910PF07914DUF1679461070.002917.3
TkA03G353910PF10707YrbL-PhoP_reg47950.02315.1
TkA03G353910PF17667Pkinase_fungal631250.08812.2
TkA03G353910PF01636APH1631700.001519.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SSF8拟南芥sp|Q9SSF8|CDPKU_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3083.600%Swiss-Prot高置信
Q9M9V8拟南芥sp|Q9M9V8|CDPKA_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1082.600%Swiss-Prot高置信
P93759拟南芥sp|P93759|CDPKE_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1475.800%Swiss-Prot高置信
Q8W4I7拟南芥sp|Q8W4I7|CDPKD_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1378.300%Swiss-Prot高置信
Q84SL0水稻sp|Q84SL0|CDPKK_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2076.800%Swiss-Prot高置信

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