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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G325090
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 79843181-79846582 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3330 bp · TkA03G325090|TK1151|cDNA

ATGCCAACGGTCACTTTTCTTATACTTGCATTTCTCGCCACCGTGCTATTCTGCGCCACTCTCTCCACCACCGCTACAACGACGGAGATAGATGCTCTAACATCCTTCAAAGAAAATGTACGCGATCCACTCGGCGCGTTGGATGCCTGGAATACTTCTACGCCGGCTGCCCCGTGTGACTGGCGTGGGATTTCCTGTACAGACGGCAGAGTTCGTGAAATTCGTTTAGCTCGGCTTGGTTTATCTGGCCGGCTGAGTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

3330 bp · TkA03G325090|TK1151|CDS

ATGCCAACGGTCACTTTTCTTATACTTGCATTTCTCGCCACCGTGCTATTCTGCGCCACTCTCTCCACCACCGCTACAACGACGGAGATAGATGCTCTAACATCCTTCAAAGAAAATGTACGCGATCCACTCGGCGCGTTGGATGCCTGGAATACTTCTACGCCGGCTGCCCCGTGTGACTGGCGTGGGATTTCCTGTACAGACGGCAGAGTTCGTGAAATTCGTTTAGCTCGGCTTGGTTTATCTGGCCGGCTGAGTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1109 aa · TkA03G325090|TK1151|PROTEIN

MPTVTFLILAFLATVLFCATLSTTATTTEIDALTSFKENVRDPLGALDAWNTSTPAAPCDWRGISCTDGRVREIRLARLGLSGRLSSRISELSQLRTLSLHTNNFNGSIPSALSQCSLLRVVYLQYNYFSGVLPPAFGNLTNLLVLNVAHNFLSGELPANLPPKVRYLDVSSNAVSGNIPANLSVSSEIQLINLSFNALSGQVPPVIGDFQNLQYLFLDSNNLYGTLPSAIANCSSLIHLSADNNQLQGLIPASIGNLLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G325090
TK1151 IDTkA03G325090
OH-1004 IDLXL04_008831
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G325090
位置Chr03:79843181-79846582 (+)
描述Similar to At4g36180: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g36180 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g36180。 暂无已核实直接文献
At2g33170 推测的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶At2g33170。 暂无已核实直接文献
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0576900 在器官发育的早期阶段通过调节细胞分裂速率发挥功能。
XIAO is involved in the control of organ size by contributing to the regulation of signaling and homeostasis of brassinosteroids and cell cycling in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04877.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008831 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0090696 post-embryonic plant organ development 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G73080
ath:AT4G36180
ath:AT5G46330
dosa:Os04g0576900
dosa:Os04g0618700
osa:4336741
osa:4337016
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.874
排名 1 · TkA03G325090 · TK1151
内质网0.079
排名 2 · TkA03G325090 · TK1151
细胞质0.064
排名 3 · TkA03G325090 · TK1151
细胞核0.047
排名 4 · TkA03G325090 · TK1151
溶酶体／液泡0.022
排名 5 · TkA03G325090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_228-67 aa
PF12799LRR_476-110 aa
PF23598LRR_1484-149 aa
PF29594LRR_SKP284-121 aa
PF25013LRR_Zer-190-109 aa
PF24758LRR_At5g5637092-148 aa
PF00560LRR_194-116 aa
PF13855LRR_894-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G325090PF08263LRRNT_228671.3e-0938.8
TkA03G325090PF12799LRR_4761101.6e-46156.0
TkA03G325090PF23598LRR_14841493e-40138.8
TkA03G325090PF29594LRR_SKP2841213.4e-0627.2
TkA03G325090PF25013LRR_Zer-1901091.1e-0629.5
TkA03G325090PF24758LRR_At5g56370921481.1e-1042.3
TkA03G325090PF00560LRR_1941161.4e-71221.5
TkA03G325090PF13855LRR_8941513.2e-58194.1
TkA03G325090PF00560LRR_11191401.4e-71221.5
TkA03G325090PF13855LRR_81191733.2e-58194.1
TkA03G325090PF12799LRR_41191531.6e-46156.0
TkA03G325090PF13516LRR_61401512e-1246.8
TkA03G325090PF00560LRR_11421611.4e-71221.5
TkA03G325090PF23211LRR_LRWD11491935.1e-0627.0
TkA03G325090PF24048LRR_NXF1-51601750.00916.4
TkA03G325090PF13855LRR_81631993.2e-58194.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGS2拟南芥sp|C0LGS2|Y4361_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3618067.600%Swiss-Prot低置信
O49318拟南芥sp|O49318|Y2317_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g3317037.100%Swiss-Prot低置信
Q9ZWC8拟南芥sp|Q9ZWC8|BRL1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 140.000%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393039.200%Swiss-Prot低置信
G9LZD7水稻sp|G9LZD7|XIAO_ORYSJ Probable inactive leucine-rich repeat receptor kinase XIAO61.500%Swiss-Prot低置信

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