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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G315480
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 77469286-77471226 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1274 bp · TkA03G315480|TK1151|cDNA

CGGCAAAGAGGAAAAACCATGACCAATTTAAAACAAAAATGACAAGCTTATGATATTTATGCACTGGCTTGAAGAAAAAGAAAAGCCCCTCCTTAACCCTCGCAAGAGTTCATCGCACAAACGAACACCCACACACTCACCAACAGAGGGAGCGTTTTCCGATTGAAAATATTATTTGATCAGTAAAGATGTTTAGAAACCAGTACGACACCGACGTCACAACATGGTCGCCGGCGGGGCGGTTGTTTCAGGTAGAGTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

813 bp · TkA03G315480|TK1151|CDS

ATGTTTAGAAACCAGTACGACACCGACGTCACAACATGGTCGCCGGCGGGGCGGTTGTTTCAGGTAGAGTACGCCATGGAGGCTGTAAAGCAAGGATCGGCGGCCATTGGTCTCCGATCTAAGACGCACGTTGTTCTCGCTTGCGTCAACAAATCCAATTCGGAACTCTCATCGCATCAGAAAAAGATCTTCAAGGTCGACGACCACATCGGCGTCGCCATCGCTGGTCTCACCGCTGACGGCCGTGTTCTGTCCCGGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

270 aa · TkA03G315480|TK1151|PROTEIN

MFRNQYDTDVTTWSPAGRLFQVEYAMEAVKQGSAAIGLRSKTHVVLACVNKSNSELSSHQKKIFKVDDHIGVAIAGLTADGRVLSRYMRSECINYGYTYESPLPVGRLVVQLADKAQVCTQRSWKRPYGVGLLVAGLDESGAHLYYNCPSGNYFEYQAFAIGSRSQAAKTYLERKFEKFTESSRDDLIKDALFAIRETLQGEKLTSSVCTVAVVGVGEAFSILDQATVQGLINEFEVSGEEGGAAVAAGGGGAAEEGGAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G315480
TK1151 IDTkA03G315480
OH-1004 IDLXL04_008891
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G315480
位置Chr03:77469286-77471226 (-)
描述Similar to PAF2: Proteasome subunit alpha type-1-B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g47250 蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物，其特点是能够在中性或微碱性 pH 条件下裂解与离去基团相邻的 Arg、Phe、Tyr、Leu 和 Glu 肽。
ARS5 is a component of the 26S proteasome complex, and negatively regulates thiol biosynthesis and arsenic tolerance in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03914.x
At5g42790 蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物，其特点是能够在中性或微碱性 pH 条件下裂解与离去基团相邻的 Arg、Phe、Tyr、Leu 和 Glu 肽。
ARS5 is a component of the 26S proteasome complex, and negatively regulates thiol biosynthesis and arsenic tolerance in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03914.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0133800 蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物，其特点是能够在中性或微碱性 pH 条件下裂解与离去基团相邻的 Arg、Phe、Tyr、Leu 和 Glu 肽。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008891 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002376 immune system process 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0046685 response to arsenic-containing substance 生物过程
GO:0061136 regulation of proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0000502 proteasome complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G47250
ath:AT5G42790
ddi:DDB_G0282363
dosa:Os02g0133800
mmu:26440
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.641
排名 1 · TkA03G315480 · TK1151
细胞核0.628
排名 2 · TkA03G315480 · TK1151
线粒体0.055
排名 3 · TkA03G315480 · TK1151
细胞膜0.048
排名 4 · TkA03G315480 · TK1151
内质网0.039
排名 5 · TkA03G315480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10584Proteasome_A_N6-28 aa
PF00227Proteasome29-214 aa
PF12213Dpoe2NT164-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G315480PF10584Proteasome_A_N6284.4e-1452.5
TkA03G315480PF00227Proteasome292142.9e-57194.1
TkA03G315480PF12213Dpoe2NT1642140.212.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O23712拟南芥sp|O23712|PSA1B_ARATH Proteasome subunit alpha type-1-B84.600%Swiss-Prot高置信
P34066拟南芥sp|P34066|PSA1A_ARATH Proteasome subunit alpha type-1-A83.800%Swiss-Prot高置信
P52428水稻sp|P52428|PSA1_ORYSJ Proteasome subunit alpha type-173.900%Swiss-Prot高置信

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