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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G309510
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 76094784-76096526 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

576 bp · TkA03G309510|TK1151|cDNA

ATGTCAAGCCGAACCGAAGTGCCGAAACATGTCAAGTTGAACCGAAGTAGCGGACCATGTCAAGCCGAACCGAAGTGCCAAACCATGTCAAGCCGAACCGAAGTGTCGAACCATGTCAAGTTAAACCGTACCATTATTGCCAAACCATGGTGGACGGCATGCCCCAAGCTCAACACTCTGAACTTGTCAAGAAACTTGATTGATTTTAATGGTGGTTTGAAACCGATTGGAATTTCTTTTCAGGTTATTGATCTGTCTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

576 bp · TkA03G309510|TK1151|CDS

ATGTCAAGCCGAACCGAAGTGCCGAAACATGTCAAGTTGAACCGAAGTAGCGGACCATGTCAAGCCGAACCGAAGTGCCAAACCATGTCAAGCCGAACCGAAGTGTCGAACCATGTCAAGTTAAACCGTACCATTATTGCCAAACCATGGTGGACGGCATGCCCCAAGCTCAACACTCTGAACTTGTCAAGAAACTTGATTGATTTTAATGGTGGTTTGAAACCGATTGGAATTTCTTTTCAGGTTATTGATCTGTCTTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

191 aa · TkA03G309510|TK1151|PROTEIN

MSSRTEVPKHVKLNRSSGPCQAEPKCQTMSSRTEVSNHVKLNRTIIAKPWWTACPKLNTLNLSRNLIDFNGGLKPIGISFQVIDLSYNRISWGKPNVVRWILSNGCRELRHLSLKGNKVAEELPEFDCPNLEHIDLSVRVSDSLTSPRNILPARYHLFRSTATSSFCIYPTIISTVGFLHTSSIYAQFSWN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G309510
TK1151 IDTkA03G309510
OH-1004 IDLXL04_007580
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 45.550 / OH-1004 7.585
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G309510
位置Chr03:76094784-76096526 (-)
描述Similar to Systemin receptor SR160
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743
Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247
The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903
The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007580 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010268 brassinosteroid homeostasis 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G13380
ath:AT4G39400
dosa:Os01g0718300
sly:101261320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.452
排名 1 · TkA03G309510 · TK1151
细胞质0.418
排名 2 · TkA03G309510 · TK1151
线粒体0.139
排名 3 · TkA03G309510 · TK1151
细胞膜0.079
排名 4 · TkA03G309510 · TK1151
内质网0.054
排名 5 · TkA03G309510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_452-69 aa
PF13855LRR_852-68 aa
PF13516LRR_654-68 aa
PF00560LRR_156-71 aa
PF00560LRR_180-96 aa
PF12799LRR_481-91 aa
PF13855LRR_881-118 aa
PF13516LRR_681-91 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G309510PF12799LRR_452696.9e-1039.6
TkA03G309510PF13855LRR_852686.1e-0626.6
TkA03G309510PF13516LRR_654680.0001422.3
TkA03G309510PF00560LRR_156710.0002221.4
TkA03G309510PF00560LRR_180960.0002221.4
TkA03G309510PF12799LRR_481916.9e-1039.6
TkA03G309510PF13855LRR_8811186.1e-0626.6
TkA03G309510PF13516LRR_681910.0001422.3
TkA03G309510PF13516LRR_61061190.0001422.3
TkA03G309510PF12799LRR_41081376.9e-1039.6
TkA03G309510PF13855LRR_81091366.1e-0626.6
TkA03G309510PF00560LRR_11091250.0002221.4
TkA03G309510PF13516LRR_61281370.0001422.3
TkA03G309510PF00560LRR_11301370.0002221.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22476拟南芥sp|O22476|BRI1_ARATH Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 146.100%Swiss-Prot低置信

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