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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G287510
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 70968302-70971447 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2423 bp · TkA03G287510|TK1151|cDNA

GAGAGAACGAGGATGATTATGATGATGATGATGGTGGTGATATAATCGTGTGCCTTACTTCATAATAACATGGAGGAAACAAACGTCTCAATTGGCAATTTCAAATGTTGACATAATGGTAGTAAACGCGACGACTCTTCAACCACACAATCCTGAATTTCTACAACTTCTCCGATCATCATTTTCGTAAAACATTTGGCTATTTTGGTTGCGAATTAGGTTGATCATGGGCAAATTCTTCAAAAAAAGGAGGTTTCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1293 bp · TkA03G287510|TK1151|CDS

ATGGCAAGGACAGAAAGCAACAACGCTAATGTTCATCCTCTTCCCAGGCCTCCGAGACATGTGTCTACTCCTCGAAGCTTAGATAAATCAGATGCGCAATGGACAAAAGGACAATGGCAGAAAGGGAAGCTCCTGGGACGTGGTACTTACGGTAGTGTATATGAAGCAATTAATCGTGAGACTGGAGGTTTGTGCGCCATGAAAGAAGTTGACATCATTCCAGACGATACCAAATCAGCTGAATGTATACGGCAGTTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

430 aa · TkA03G287510|TK1151|PROTEIN

MARTESNNANVHPLPRPPRHVSTPRSLDKSDAQWTKGQWQKGKLLGRGTYGSVYEAINRETGGLCAMKEVDIIPDDTKSAECIRQLEQEIRVLRTLEHPNIVQYLGSEMIEDRFCIYLEYVHPGAINKYVKEHCGAVTEPVVRNFTRHILSGLAYLHSKKTVHRDIKGANLLVDASGVVKLADFGLAKHLSSYSNDLSLKGSPHWMAPEVLQAVLRKGANMEVTCTMDIWSLGCTVIEMLTGKPPWNEFNAGQVMFNVLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G287510
TK1151 IDTkA03G287510
OH-1004 IDLXL04_008209
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)95.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.279 / OH-1004 57.123
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G287510
位置Chr03:70968302-70971447 (-)
描述Similar to MAPKKK5: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g66850 丝裂原激活蛋白激酶 参与宿主细胞表面几丁质受体复合物 CERK1-LYK5 和细胞内 MAPK 级联之间的信号转导，从而导致几丁质诱导的免疫。
The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation.2016 · DOI: 10.15252/embj.201694248
At1g53570 丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶 3。 暂无已核实直接文献
At1g63700 在 MAP 激酶级联反应中发挥作用，作为分子开关调节受精卵和早期胚胎的第一次细胞命运决定。 暂无已核实直接文献
At3g06030 通过调控MAP65-1等微管相关蛋白的磷酸化状态，参与皮层微管的组织和稳定。
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746
At4g08500 MEKK1、MKK1/MKK2 和 MPK4 在信号通路中发挥作用，调节响应生物和非生物胁迫的基因表达，并通过负向调节先天免疫在病原体防御中发挥重要作用。
MAP kinase signalling cascade in Arabidopsis innate immunity.2002 · DOI: 10.1038/415977a
The MKK2 pathway mediates cold and salt stress signaling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1016/j.molcel.2004.06.023
Phosphorylation of Arabidopsis thaliana MEKK1 via Ca(2+) signaling as a part of the cold stress response.2013 · DOI: 10.1007/s10265-013-0576-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008209 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010098 suspensor development 生物过程
GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09000
ath:AT1G53570
ath:AT1G63700
ath:AT3G06030
ath:AT5G66850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.552
排名 1 · TkA03G287510 · TK1151
细胞核0.352
排名 2 · TkA03G287510 · TK1151
细胞膜0.239
排名 3 · TkA03G287510 · TK1151
高尔基体0.048
排名 4 · TkA03G287510 · TK1151
内质网0.045
排名 5 · TkA03G287510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase39-300 aa
PF14531Kinase-like40-94 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr42-295 aa
PF03109ABC180-193 aa
PF07387Seadorna_VP7143-184 aa
PF17667Pkinase_fungal149-212 aa
PF14531Kinase-like153-269 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G287510PF00069Pkinase393004e-68230.4
TkA03G287510PF14531Kinase-like40945.2e-0729.9
TkA03G287510PF07714PK_Tyr_Ser-Thr422951.3e-46159.8
TkA03G287510PF03109ABC1801930.0002121.3
TkA03G287510PF07387Seadorna_VP71431840.0812.7
TkA03G287510PF17667Pkinase_fungal1492120.05512.9
TkA03G287510PF14531Kinase-like1532695.2e-0729.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C5H5拟南芥sp|Q9C5H5|M3K5G_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 557.400%Swiss-Prot高置信
F4HRJ4拟南芥sp|F4HRJ4|M3K3A_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 350.000%Swiss-Prot中等置信
Q9CAD5拟南芥sp|Q9CAD5|YODA_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA51.100%Swiss-Prot中等置信
O22042拟南芥sp|O22042|M3K3_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 344.200%Swiss-Prot中等置信
Q39008拟南芥sp|Q39008|M3K1_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 147.300%Swiss-Prot中等置信

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