TkA03G274130 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G274130

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 67643088-67646120 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2222 bp · TkA03G274130|TK1151|cDNA

CTTAGTCAAATTCCGGGTCAAAAAGGAAATATAAATAGTGAAGTAGATTATCGTTTGTCAGTCTCTTGAAGTTCAACAAAACACCATCATGCCCTCGTGACACCACTTGTCTTTTGCTCTTTCTCTCTCTAATTACCCCTCCCAGATGCCCGCCATTTTCTCCGTAATCGCACTATAATGATACACCGTAAGCACGATTGAAGCTGTAAGTTCTACCATTAACAATGCAGGAGCTACGATTCCAAGATCACAAAAGTAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1707 bp · TkA03G274130|TK1151|CDS

ATGCAGGAGCTACGATTCCAAGATCACAAAAGTAGCCTCACCAGTAGCCACTCTAGATCCAGCTACGGCGGAAGTGGTGTTGGTGGTAGTCCTGACTCTGTAATATTCTCCAATTTCAGCCTGTTCTCCACTTCCGCTTCTGCTAGCGTTGAACGATGTTCTTCTGCGTCCGATGTTCTTGATCGAGAATCTATCGTCTCCGAAATGTCTCTGCATTTGTCGGGACGTGGTTTCCGTGATTCCTCCTTCGCGAGGGGTCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

568 aa · TkA03G274130|TK1151|PROTEIN

MQELRFQDHKSSLTSSHSRSSYGGSGVGGSPDSVIFSNFSLFSTSASASVERCSSASDVLDRESIVSEMSLHLSGRGFRDSSFARGPDPDPNNNSTVLRSGGQHLLSKKAEKAKAIIEVSDAETHGEKNQTLDSARSSFSQAIKDCQNRKSRSEILLRKSDRRRPTSLDLNNQPINVTTSVSPRLAMKTSVSSRRNSMFPSPVTPNYRPATSTMKGWSSERVPSHTNTTRRQVSSGLMSYNSGRTLPSKWEDAERWICSP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G274130`
TK1151 ID	TkA03G274130
OH-1004 ID	LXL04_008146
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	96.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.303 / OH-1004 81.057 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA03G274130`
位置	Chr03:67643088-67646120 (+)
描述	Similar to REM4.1: Remorin 4.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_008146` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程 GO:0010555 response to mannitol 生物过程 GO:0051607 defense response to virus 生物过程 GO:0051665 membrane raft localization 生物过程 GO:1900458 negative regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ath:AT2G41870 ath:AT3G57540 ath:AT3G61260 dosa:Os07g0569100 sot:102577743 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.424

排名 1 · TkA03G274130 · TK1151

细胞膜0.396

排名 2 · TkA03G274130 · TK1151

细胞核0.365

排名 3 · TkA03G274130 · TK1151

内质网0.044

排名 4 · TkA03G274130 · TK1151

高尔基体0.039

排名 5 · TkA03G274130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03763Remorin_C108-140 aa

PF25528DUF7917108-144 aa

PF23159WHD_Rok449-478 aa

PF03763Remorin_C452-534 aa

PF05549Allexi_40kDa461-546 aa

PF23159WHD_Rok480-522 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G274130	`PF03763`	Remorin_C	108	140	4e-24	85.2
TkA03G274130	`PF25528`	DUF7917	108	144	0.049	14.3
TkA03G274130	`PF23159`	WHD_Rok	449	478	1.1	10.0
TkA03G274130	`PF03763`	Remorin_C	452	534	4e-24	85.2
TkA03G274130	`PF05549`	Allexi_40kDa	461	546	3.4	7.9
TkA03G274130	`PF23159`	WHD_Rok	480	522	1.1	10.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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