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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G146570
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 37350820-37354182 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3291 bp · TkA03G146570|TK1151|cDNA

ATGGCGACTATTGTTTTGCTCTTCTTTCTCCTCCTCACGTCCGCCACTTTGCAAACGTACGCTGATAGTTCTCCGGAAACTCAATCAGAGATAGATGCACTTGTGGATTTCAAGCTTAAGCTTTATGATCCGCTTGGTGCGCTTACTAGCTGGGACCGAGCAACTGCGTCGGCGCCATGCGACTGGCGCGGTGTCGGTTGCTCCGATGGCCACGTCAGTGATATTCGACTTCCTCGTCTTCAGCTACGCGGTATTCTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

3291 bp · TkA03G146570|TK1151|CDS

ATGGCGACTATTGTTTTGCTCTTCTTTCTCCTCCTCACGTCCGCCACTTTGCAAACGTACGCTGATAGTTCTCCGGAAACTCAATCAGAGATAGATGCACTTGTGGATTTCAAGCTTAAGCTTTATGATCCGCTTGGTGCGCTTACTAGCTGGGACCGAGCAACTGCGTCGGCGCCATGCGACTGGCGCGGTGTCGGTTGCTCCGATGGCCACGTCAGTGATATTCGACTTCCTCGTCTTCAGCTACGCGGTATTCTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1096 aa · TkA03G146570|TK1151|PROTEIN

MATIVLLFFLLLTSATLQTYADSSPETQSEIDALVDFKLKLYDPLGALTSWDRATASAPCDWRGVGCSDGHVSDIRLPRLQLRGILSRKLGDLRMLRRLSLRSNSFNGSIPSSLGKCDLLQYAFLQDNSFSGHIPPEISNLNELLIFNVAGNNISGEVPKNIPLSLRYLDLSSNSLSGELPGNLADLAGLQLINLSYNLFTGAIPERYGALQKLQFLWLDHNQLQGTLPSAIANCTSLVHFSADGNAIGGVIPAGIGSLP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G146570
TK1151 IDTkA03G146570
OH-1004 IDLXL04_007247
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.996 / OH-1004 98.316
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G146570
位置Chr03:37350820-37354182 (+)
描述Similar to At4g36180: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g36180 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g36180。 暂无已核实直接文献
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403
At2g33170 推测的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶At2g33170。 暂无已核实直接文献
At1g01540 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0576900 在器官发育的早期阶段通过调节细胞分裂速率发挥功能。
XIAO is involved in the control of organ size by contributing to the regulation of signaling and homeostasis of brassinosteroids and cell cycling in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04877.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007247 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090696 post-embryonic plant organ development 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程
GO:2000067 regulation of root morphogenesis 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G36180
ath:AT5G07280
ath:AT5G44700
dosa:Os04g0576900
osa:4336741
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.874
排名 1 · TkA03G146570 · TK1151
内质网0.079
排名 2 · TkA03G146570 · TK1151
细胞质0.064
排名 3 · TkA03G146570 · TK1151
细胞核0.042
排名 4 · TkA03G146570 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA03G146570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_228-68 aa
PF29594LRR_SKP272-151 aa
PF23598LRR_1488-152 aa
PF23211LRR_LRWD190-119 aa
PF13855LRR_891-129 aa
PF13516LRR_694-106 aa
PF00560LRR_196-117 aa
PF13855LRR_896-154 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G146570PF08263LRRNT_228683.4e-1040.7
TkA03G146570PF29594LRR_SKP2721510.006716.4
TkA03G146570PF23598LRR_14881524.1e-43148.2
TkA03G146570PF23211LRR_LRWD1901199.8e-0522.9
TkA03G146570PF13855LRR_8911293e-55184.5
TkA03G146570PF13516LRR_6941063.1e-0627.5
TkA03G146570PF00560LRR_1961171.2e-72224.6
TkA03G146570PF13855LRR_8961543e-55184.5
TkA03G146570PF12799LRR_4961229.8e-45150.3
TkA03G146570PF24758LRR_At5g56370991498.9e-1349.1
TkA03G146570PF00560LRR_11201411.2e-72224.6
TkA03G146570PF12799LRR_41201559.8e-45150.3
TkA03G146570PF25019LRR_R13L1-DRL211391951.5e-0835.3
TkA03G146570PF25013LRR_Zer-11391750.001319.6
TkA03G146570PF13855LRR_81401993e-55184.5
TkA03G146570PF00560LRR_11441621.2e-72224.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGS2拟南芥sp|C0LGS2|Y4361_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3618072.000%Swiss-Prot低置信
Q9ZWC8拟南芥sp|Q9ZWC8|BRL1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 138.800%Swiss-Prot低置信
O49318拟南芥sp|O49318|Y2317_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g3317035.900%Swiss-Prot低置信
Q3EDL4拟南芥sp|Q3EDL4|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g0154035.400%Swiss-Prot低置信
G9LZD7水稻sp|G9LZD7|XIAO_ORYSJ Probable inactive leucine-rich repeat receptor kinase XIAO65.600%Swiss-Prot低置信

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