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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G086090
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 21949699-21963790 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3128 bp · TkA03G086090|TK1151|cDNA

GAAAGTTGACTTTTCTTTTAAAACAACCCAAAGGGTGACGACCGAAGAACTAACATCGCTAATTGTCAATGGACATCCGCTGCACAATAGCGACGAAACACAAGAACCAGTCAACAATCGAAATTCAATCGACCACTGCCGCAATTCTGAAGGTATTCTTTGGATACAATAGATATAGATATTGTAAATAATCAAAGGCCCAATTACGAGAAAAATCTACCGGATGATGTTACCCACAGCTATCAAGGACACCGATTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1986 bp · TkA03G086090|TK1151|CDS

ATGATGTTACCCACAGCTATCAAGGACACCGATTCATCTTCCTCTTCCTCCTCTGTACTACCAGACCAGACATGTCGACGTTTTACCTTTCCTGAAATTCAATCGGCAACCAATAATTTCGATGAGAATTTAGTGATTGGCCGTGGAGGATTCGGCAACGTGTATAAATGTTCCACGATCGGATCCGCCAGAGAAGTTGCAGTTAAACGATTGCATGCCATGTCCAACCAAGGAGCCCATGAATTCGAGGCGGAAGTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

661 aa · TkA03G086090|TK1151|PROTEIN

MMLPTAIKDTDSSSSSSSVLPDQTCRRFTFPEIQSATNNFDENLVIGRGGFGNVYKCSTIGSAREVAVKRLHAMSNQGAHEFEAEVEVLSKLRHGNLVSLLGYCNEEKEMALIYEFMPNGTLEDHLLKPELSLSWLQLLKISIGAARGLDYLHTGTSTQHGVIHRDVKSSNILLDANFDAKIADFGLARIGLIERTHVSTAVKGTFGYMDPSYFYTGKLTTSSDVYAFGVVLFEVLTGKKAVDSTLDDEQWSLAAWALHQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G086090
TK1151 IDTkA03G086090
OH-1004 IDLXL04_006904
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.915 / OH-1004 37.283
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G086090
位置Chr03:21949699-21963790 (-)
描述Similar to CRK: CDPK-related protein kinase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g19100 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g50530 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At2g41140 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。
The calmodulin-binding protein kinase 3 is part of heat-shock signal transduction in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03544.x
At3g56760 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0366200 在体外具备激酶活性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006904 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41140
ath:AT3G50530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.447
排名 1 · TkA03G086090 · TK1151
细胞膜0.369
排名 2 · TkA03G086090 · TK1151
细胞核0.286
排名 3 · TkA03G086090 · TK1151
内质网0.058
排名 4 · TkA03G086090 · TK1151
高尔基体0.054
排名 5 · TkA03G086090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase44-308 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr45-310 aa
PF03109ABC146-73 aa
PF01636APH64-121 aa
PF12330Haspin_kinase87-145 aa
PF01633Choline_kinase107-154 aa
PF01636APH157-192 aa
PF03109ABC1158-189 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G086090PF00069Pkinase443089e-116386.6
TkA03G086090PF07714PK_Tyr_Ser-Thr453101.9e-85287.0
TkA03G086090PF03109ABC146733e-1040.4
TkA03G086090PF01636APH641212.1e-0628.4
TkA03G086090PF12330Haspin_kinase871450.0002520.9
TkA03G086090PF01633Choline_kinase1071540.1212.4
TkA03G086090PF01636APH1571922.1e-0628.4
TkA03G086090PF03109ABC11581893e-1040.4
TkA03G086090PF01163RIO11581850.004517.3
TkA03G086090PF14531Kinase-like1591991.3e-0525.3
TkA03G086090PF06293Kdo1601800.0003320.9
TkA03G086090PF12330Haspin_kinase1631960.0002520.9
TkA03G086090PF01633Choline_kinase1631790.1212.4
TkA03G086090PF00069Pkinase3826409e-116386.6
TkA03G086090PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3836351.9e-85287.0
TkA03G086090PF03109ABC13944173e-1040.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJL9拟南芥sp|Q9LJL9|CAMK2_ARATH CDPK-related kinase 281.200%Swiss-Prot低置信
Q9SCS2拟南芥sp|Q9SCS2|CAMK5_ARATH CDPK-related kinase 578.200%Swiss-Prot低置信
O80673拟南芥sp|O80673|CAMK1_ARATH CDPK-related kinase 177.600%Swiss-Prot低置信
Q9LET1拟南芥sp|Q9LET1|CAMK7_ARATH CDPK-related kinase 764.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SCZ4拟南芥sp|Q9SCZ4|FERON_ARATH Receptor-like protein kinase FERONIA52.600%Swiss-Prot高置信
Q10KY3水稻sp|Q10KY3|CAMK1_ORYSJ Calcium/calmodulin-dependent serine/threonine-protein kinase 177.600%Swiss-Prot低置信

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