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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G079280
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 20196353-20200820 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2809 bp · TkA03G079280|TK1151|cDNA

ATACACTTCTGTGTGTGACTGTGTATGTATCGTACAGCTTGCAACGCTACATTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAAACTAGCAACAGTTGTGGCTTCTTCTTCTCCATTATTCTCGTCTGCTCTGCTTTTATTTTCTCCAGTAAATGCTCCCGTCGGTGCTCTGTTGACGGTTGACCGTCGGTTCTATGTGACTTGAGTTAACATATTATACAGCAAAAAGGCAATGGAACACAAGTCATGGCTATGGAAGAAAAAGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2280 bp · TkA03G079280|TK1151|CDS

ATGGAACACAAGTCATGGCTATGGAAGAAAAAGTCAATCGAGAAGACCATGTACGCAACCGACACACCCAACAGAGGGAATGAAGACGAGTTGCAGGGAATTCTAGCTTATGAAGCTGAACTCGAAAGAAACCTAAACATTTCAAACGAAAAGCTTTCATCCGCACTTGCAGAAATCAAAGCGAAAGACGACATCGCAAAGAAACAAACAAACATCGCACGTGAAGCCATTCAAGGATGGGAGAAGGCGGAATCGGAGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

759 aa · TkA03G079280|TK1151|PROTEIN

MEHKSWLWKKKSIEKTMYATDTPNRGNEDELQGILAYEAELERNLNISNEKLSSALAEIKAKDDIAKKQTNIAREAIQGWEKAESEVLSLKQELEKSTQQTISSEERLYGVDSALKECMQQLRFVREEQEKRIHDAVINTSREYEKSLISIEEKLSESNKKNSKLISENTHLTKSLLSKEKVIDELHAAMSRLHSELSSVTTRLESSQRDNASLSYEVRVMEKELEIRNEERDFNRRTADVAHKQHLASVKKIAHLETEA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G079280
TK1151 IDTkA03G079280
OH-1004 IDLXL04_006804
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G079280
位置Chr03:20196353-20200820 (-)
描述Similar to FPP7: Filament-like plant protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23360 纤维状植物蛋白7。 暂无已核实直接文献
At1g19835 类丝状植物蛋白 4。 暂无已核实直接文献
At1g47900 丝状植物蛋白 6。 暂无已核实直接文献
At3g05270 与COG2和FPP2/VETH2形成复合物，在木质部细胞次生细胞壁沉积过程中，通过招募EXO70A1，将胞吐复合体（exocyst）组分招募至皮层微管，确保正确的次生细胞壁（SCW）沉积模式。 暂无已核实直接文献
At1g77580 似丝状植物蛋白1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006804 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程
GO:0046785 microtubule polymerization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19835
ath:AT1G47900
ath:AT2G23360
ath:AT4G36120
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.490
排名 1 · TkA03G079280 · TK1151
细胞膜0.285
排名 2 · TkA03G079280 · TK1151
细胞核0.284
排名 3 · TkA03G079280 · TK1151
内质网0.058
排名 4 · TkA03G079280 · TK1151
高尔基体0.055
排名 5 · TkA03G079280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05911FPP62-344 aa
PF01166TSC22153-181 aa
PF01166TSC22183-197 aa
PF01166TSC22251-268 aa
PF01166TSC22297-326 aa
PF05911FPP348-389 aa
PF05911FPP382-492 aa
PF05911FPP489-657 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G079280PF05911FPP623444.3e-151505.7
TkA03G079280PF01166TSC221531811.49.9
TkA03G079280PF01166TSC221831971.49.9
TkA03G079280PF01166TSC222512681.49.9
TkA03G079280PF01166TSC222973261.49.9
TkA03G079280PF05911FPP3483894.3e-151505.7
TkA03G079280PF05911FPP3824924.3e-151505.7
TkA03G079280PF05911FPP4896574.3e-151505.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SLN1拟南芥sp|Q9SLN1|FPP7_ARATH Filament-like plant protein 733.500%Swiss-Prot中等置信
Q0WSY2拟南芥sp|Q0WSY2|FPP4_ARATH Filament-like plant protein 434.600%Swiss-Prot低置信
Q9C698拟南芥sp|Q9C698|FPP6_ARATH Filament-like plant protein 638.500%Swiss-Prot低置信
Q9MA92拟南芥sp|Q9MA92|FPP3_ARATH Filament-like plant protein 329.000%Swiss-Prot低置信
Q9CAP9拟南芥sp|Q9CAP9|FPP1_ARATH Filament-like plant protein 137.000%Swiss-Prot低置信

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