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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G067220
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 17311813-17312610 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

678 bp · TkA03G067220|TK1151|cDNA

ATGGATCGAATCAAAGGTCCATGGAGTCCTGAAGAAGACGAGATGCTCCAGCAACTCGTCGAGAAACACGGCCCGAGAAACTGGTCTCTCGTCAGCAAAACCATCCCCGGTAGATCCGGGAAATCGTGCCGGTTGCGGTGGTGCAACCAGCTTTCGCCGCAGGTGGAGCACCGGGCGTTTACGCCGGAAGAAGATGAAACGATTCTCAGGGCTCATGCGAGGTTTGGTAACAAATGGGCCACGATTGCCCGATTGTTGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

678 bp · TkA03G067220|TK1151|CDS

ATGGATCGAATCAAAGGTCCATGGAGTCCTGAAGAAGACGAGATGCTCCAGCAACTCGTCGAGAAACACGGCCCGAGAAACTGGTCTCTCGTCAGCAAAACCATCCCCGGTAGATCCGGGAAATCGTGCCGGTTGCGGTGGTGCAACCAGCTTTCGCCGCAGGTGGAGCACCGGGCGTTTACGCCGGAAGAAGATGAAACGATTCTCAGGGCTCATGCGAGGTTTGGTAACAAATGGGCCACGATTGCCCGATTGTTGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

225 aa · TkA03G067220|TK1151|PROTEIN

MDRIKGPWSPEEDEMLQQLVEKHGPRNWSLVSKTIPGRSGKSCRLRWCNQLSPQVEHRAFTPEEDETILRAHARFGNKWATIARLLSGRTDNAIKNHWNSTLKRKCSSMTNEEFNEFSIQQPSLKRSVSAGSPSGSDVSDSSVHVYRPVPRPVAPVNDPQTSLSLSLPGAESFEASSMAHPPPQPEKGLPPFSAEFLSVMQEMVRMEVRNYITGVEMQQATNGGG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G067220
TK1151 IDTkA03G067220
OH-1004 IDLXL04_013573
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)59.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.000 / OH-1004 93.994
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G067220
位置Chr03:17311813-17312610 (+)
描述Similar to MYB44: Transcription factor MYB44
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g67300 转录因子。
Overexpression of AtMYB44 enhances stomatal closure to confer abiotic stress tolerance in transgenic Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.110981
Two novel MYB homologues with changed expression in late embryogenesis-defective Arabidopsis mutants.1998 · DOI: 10.1023/a:1006011002499
At4g37260 在盐胁迫反应中发挥作用的转录因子。
Loss of the R2R3 MYB, AtMyb73, causes hyper-induction of the SOS1 and SOS3 genes in response to high salinity in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1016/j.jplph.2013.05.011
At3g50060 参与生长素反应的转录因子。
The Arabidopsis transcription factor MYB77 modulates auxin signal transduction.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050963
At3g09230 转录因子MYB1。 暂无已核实直接文献
At2g39880 对雄配子体（花粉）发育是必需的。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013573 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010929 positive regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G39880
ath:AT3G09230
ath:AT3G50060
ath:AT4G37260
ath:AT5G67300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.914
排名 1 · TkA03G067220 · TK1151
细胞质0.196
排名 2 · TkA03G067220 · TK1151
线粒体0.022
排名 3 · TkA03G067220 · TK1151
细胞膜0.019
排名 4 · TkA03G067220 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkA03G067220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding5-51 aa
PF15963Myb_DNA-bind_77-46 aa
PF23082Myb_DNA-binding_27-40 aa
PF13921Myb_DNA-bind_68-66 aa
PF09111SLIDE8-35 aa
PF08914Myb_Rap19-55 aa
PF20222DUF658127-49 aa
PF09111SLIDE52-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G067220PF00249Myb_DNA-binding5511.1e-38131.8
TkA03G067220PF15963Myb_DNA-bind_77460.00218.6
TkA03G067220PF23082Myb_DNA-binding_27400.00617.4
TkA03G067220PF13921Myb_DNA-bind_68666.8e-29100.6
TkA03G067220PF09111SLIDE8350.002718.4
TkA03G067220PF08914Myb_Rap19550.03215.3
TkA03G067220PF20222DUF658127490.05413.1
TkA03G067220PF09111SLIDE521040.002718.4
TkA03G067220PF00249Myb_DNA-binding591011.1e-38131.8
TkA03G067220PF13921Myb_DNA-bind_6601086.8e-29100.6
TkA03G067220PF08914Myb_Rap160770.03215.3
TkA03G067220PF15963Myb_DNA-bind_7611100.00218.6
TkA03G067220PF23082Myb_DNA-binding_2771080.00617.4
TkA03G067220PF20222DUF6581781100.05413.1
TkA03G067220PF09111SLIDE871220.002718.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FDW1拟南芥sp|Q9FDW1|MYB44_ARATH Transcription factor MYB4452.600%Swiss-Prot高置信
O23160拟南芥sp|O23160|MYB73_ARATH Transcription factor MYB7351.600%Swiss-Prot高置信
Q9SN12拟南芥sp|Q9SN12|MYB77_ARATH Transcription factor MYB7749.600%Swiss-Prot中等置信
Q42575拟南芥sp|Q42575|MYB1_ARATH Transcription factor MYB165.400%Swiss-Prot低置信
O04192拟南芥sp|O04192|MYB25_ARATH Transcription factor MYB2554.300%Swiss-Prot中等置信

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