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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G050250
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 13220356-13221942 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

672 bp · TkA03G050250|TK1151|cDNA

ATGGGCAAGTCGACGGCGACGACGAAAGATGATGCGCAAGCTCTTTTTTGCTCTCTGCATTCTGCTTATTCAGCTATTCCCACTAATCTCAAGGCAGAACTTGCTTCCATTTGTGCTTCATTAGGAGACCCATTTTTACCTATTATGCAGATTGAGTCAGGTAGTTTGACTAAAGAACTTGCAGCCATTTTTCCACAAGTGGAAATGATGCAGAAGAAGAAAAACGAGAGGAAGGTTCAGTTCATAGAAGTTTTGGAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

672 bp · TkA03G050250|TK1151|CDS

ATGGGCAAGTCGACGGCGACGACGAAAGATGATGCGCAAGCTCTTTTTTGCTCTCTGCATTCTGCTTATTCAGCTATTCCCACTAATCTCAAGGCAGAACTTGCTTCCATTTGTGCTTCATTAGGAGACCCATTTTTACCTATTATGCAGATTGAGTCAGGTAGTTTGACTAAAGAACTTGCAGCCATTTTTCCACAAGTGGAAATGATGCAGAAGAAGAAAAACGAGAGGAAGGTTCAGTTCATAGAAGTTTTGGAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

223 aa · TkA03G050250|TK1151|PROTEIN

MGKSTATTKDDAQALFCSLHSAYSAIPTNLKAELASICASLGDPFLPIMQIESGSLTKELAAIFPQVEMMQKKKNERKVQFIEVLEQIQNLSKELSTSTEDKSCFPILDESDLSLRRLEELKIELHTLEKEKSDRLKQVMEYLASLDSLCGVLGMNVKNTIIGIHPNLENPGTKKSISLDTIERMQRLSVKSANRNRDLIICKENVLKMKDYGKFRGSSSTNP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G050250
TK1151 IDTkA03G050250
OH-1004 IDLXL04_007503
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)83.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G050250
位置Chr03:13220356-13221942 (+)
描述Similar to MAP65-3: 65-kDa microtubule-associated protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g51600 微管相关蛋白，在所有植物器官早期和晚期有丝分裂期间组织有丝分裂微管阵列中发挥关键作用。
The plant microtubule-associated protein AtMAP65-3/PLE is essential for cytokinetic phragmoplast function.2004 · DOI: 10.1016/j.cub.2004.02.032
MAP65-3 microtubule-associated protein is essential for nematode-induced giant cell ontogenesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.057422
At5g62250 65 kDa微管相关蛋白9。 暂无已核实直接文献
At5g55230 微管相关蛋白，可捆绑并稳定细胞皮质的相邻微管。
In vivo dynamics and differential microtubule-binding activities of MAP65 proteins.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.051623
Two microtubule-associated proteins of the Arabidopsis MAP65 family function differently on microtubules.2005 · DOI: 10.1104/pp.104.052456
Dynamic interaction of NtMAP65-1a with microtubules in vivo.2005 · DOI: 10.1242/jcs.02433
Modulated targeting of GFP-AtMAP65-1 to central spindle microtubules during division.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02464.x
Control of the AtMAP65-1 interaction with microtubules through the cell cycle.2006 · DOI: 10.1242/jcs.03051
AtMAP65-1 binds to tubulin dimers to promote tubulin assembly.2007 · DOI: 10.5483/bmbrep.2007.40.2.218
Two microtubule-associated proteins of Arabidopsis MAP65s promote antiparallel microtubule bundling.2008 · DOI: 10.1091/mbc.e08-04-0341
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746
At1g14690 65 kDa 微管相关蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At4g26760 稳定微管 的微管相关蛋白。
Arabidopsis microtubule-associated protein AtMAP65-2 acts as a microtubule stabilizer.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9426-1

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007503 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0000280 nuclear division 生物过程
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0007020 microtubule nucleation 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0031116 positive regulation of microtubule polymerization 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0046785 microtubule polymerization 生物过程
GO:0048528 post-embryonic root development 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0052096 formation of syncytium involving giant cell for nutrient acquisition 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14690
ath:AT2G01910
ath:AT5G51600
ath:AT5G55230
ath:AT5G62250
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.568
排名 1 · TkA03G050250 · TK1151
细胞核0.446
排名 2 · TkA03G050250 · TK1151
线粒体0.067
排名 3 · TkA03G050250 · TK1151
细胞膜0.041
排名 4 · TkA03G050250 · TK1151
内质网0.034
排名 5 · TkA03G050250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17190RecG_N6-29 aa
PF03999MAP65_ASE129-196 aa
PF22365PfNDH2_hel_ins57-89 aa
PF03081Exo70_C64-120 aa
PF17190RecG_N66-94 aa
PF17190RecG_N117-149 aa
PF03081Exo70_C131-159 aa
PF22365PfNDH2_hel_ins136-147 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G050250PF17190RecG_N6290.05314.9
TkA03G050250PF03999MAP65_ASE1291962.5e-1660.2
TkA03G050250PF22365PfNDH2_hel_ins57890.5311.0
TkA03G050250PF03081Exo70_C641200.02814.2
TkA03G050250PF17190RecG_N66940.05314.9
TkA03G050250PF17190RecG_N1171490.05314.9
TkA03G050250PF03081Exo70_C1311590.02814.2
TkA03G050250PF22365PfNDH2_hel_ins1361470.5311.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FHM4拟南芥sp|Q9FHM4|MA653_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 340.100%Swiss-Prot中等置信
Q4PSA3拟南芥sp|Q4PSA3|MA659_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 939.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FLP0拟南芥sp|Q9FLP0|MA651_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 138.000%Swiss-Prot中等置信
Q8L836拟南芥sp|Q8L836|MA657_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 736.700%Swiss-Prot中等置信
Q8LEG3拟南芥sp|Q8LEG3|MA652_ARATH 65-kDa microtubule-associated protein 234.800%Swiss-Prot中等置信

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