TkA03G046860 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G046860

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 12364561-12367230 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

957 bp · TkA03G046860|TK1151|cDNA

ATGCCTGTGAAGCTTGAAGAGCTTATCGAACGACTTAATGGAATTGATGATGGTGAGAATGTTACGTGCATTGTGGCTGATATTTGTATGGGTTGGGCGTTTGAAGTTGCAGAGAAGATGAAGATAAGAAAAGCCGCCTTTTGGCCTGCAGCGGCTACAACATTAGTGTCGCTATTTTGCATCCCGAAGTTGCTTGAAGATGGAATCATAGATAACAAAGGGACTCCCATGAAGAAGCAAATGGTTCAATTATCACCGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

957 bp · TkA03G046860|TK1151|CDS

ATGCCTGTGAAGCTTGAAGAGCTTATCGAACGACTTAATGGAATTGATGATGGTGAGAATGTTACGTGCATTGTGGCTGATATTTGTATGGGTTGGGCGTTTGAAGTTGCAGAGAAGATGAAGATAAGAAAAGCCGCCTTTTGGCCTGCAGCGGCTACAACATTAGTGTCGCTATTTTGCATCCCGAAGTTGCTTGAAGATGGAATCATAGATAACAAAGGGACTCCCATGAAGAAGCAAATGGTTCAATTATCACCGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

318 aa · TkA03G046860|TK1151|PROTEIN

MPVKLEELIERLNGIDDGENVTCIVADICMGWAFEVAEKMKIRKAAFWPAAATTLVSLFCIPKLLEDGIIDNKGTPMKKQMVQLSPTIPSISSSEFTWLGIGDLNTQEILFNLMVKANEYVKLTDRTICNSAFELETEAWSVIYVAFGSFTLFDQRQFDELVLGLEMTNRPFLWVVREDMKNEGFINGTKSRGKIVGWAPQQKVLKHPSVGCFVTHCGWNSVLEGVSSGLPFICWPYFSDQFVNRMYICDVWKTGLEFDK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G046860`
TK1151 ID	TkA03G046860
OH-1004 ID	LXL04_006541
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	66.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.371 / OH-1004 75.847 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G046860

位置 Chr03:12364561-12367230 (-)

描述 Similar to UGT83A1: UDP-glycosyltransferase 83A1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g02100`	UDP-糖基转移酶 83A1。	暂无已核实直接文献
`At3g21560`	芥子酸葡萄糖基转移酶（SGT），是葡萄糖酯芥子酰葡萄糖（sinapoylglucose）及后续芥子酰苹果酸（sinapoylmalate）、芥子酰胆碱（sinapoylcholine）生物合成所必需的。	Arabidopsis glucosyltransferases with activities toward both endogenous and xenobiotic substrates.2003 · DOI: 10.1007/s00425-002-0969-0 The hyper-fluorescent trichome phenotype of the brt1 mutant of Arabidopsis is the result of a defect in a sinapic acid: UDPG glucosyltransferase.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02984.x Two glycosyltransferases involved in anthocyanin modification delineated by transcriptome independent component analysis in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04779.x Ectopic expression of UGT84A2 delayed flowering by indole-3-butyric acid-mediated transcriptional repression of ARF6 and ARF8 genes in Arabidopsis.2017 · DOI: 10.1007/s00299-017-2225-x
`At3g11340`	糖基化氨基酸相关分子异亮氨酸和戊酸。	The Arabidopsis glucosyltransferase UGT76B1 conjugates isoleucic acid and modulates plant defense and senescence.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.088443

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006541 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分

GO:0015020 glucuronosyltransferase activity 分子功能

GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0050057 linamarin synthase activity 分子功能

GO:0050403 trans-zeatin O-beta-D-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0050502 cis-zeatin O-beta-D-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0080043 quercetin 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0080044 quercetin 7-O-glucosyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:AEO45781

ag:AEO45782

ath:AT1G22360

ath:AT1G22400

ath:AT3G02100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.695

排名 1 · TkA03G046860 · TK1151

细胞核0.164

排名 2 · TkA03G046860 · TK1151

过氧化物酶体0.106

排名 3 · TkA03G046860 · TK1151

内质网0.078

排名 4 · TkA03G046860 · TK1151

质体0.059

排名 5 · TkA03G046860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00201UDPGT141-291 aa

PF06722EryCIII-like_C195-296 aa

PF04101Glyco_tran_28_C214-284 aa

PF13405EF-hand_6257-273 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G046860	`PF00201`	UDPGT	141	291	1e-22	81.4
TkA03G046860	`PF06722`	EryCIII-like_C	195	296	0.0018	19.0
TkA03G046860	`PF04101`	Glyco_tran_28_C	214	284	0.26	12.0
TkA03G046860	`PF13405`	EF-hand_6	257	273	0.096	13.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SGA8`	拟南芥	sp\|Q9SGA8\|U83A1_ARATH UDP-glycosyltransferase 83A1	40.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LVF0`	拟南芥	sp\|Q9LVF0\|U84A2_ARATH UDP-glycosyltransferase 84A2	39.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9C768`	拟南芥	sp\|Q9C768\|U76B1_ARATH UDP-glycosyltransferase 76B1	42.600%	Swiss-Prot	中等置信

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