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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G043450
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 11414826-11425889 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2600 bp · TkA03G043450|TK1151|cDNA

CCAACACACTCTTTAAACACCGAGTAAACTTTCGGTTCATCAACATGTTCTTCATATAAAGTAACTTGATTAATTCTTTAAGTTCTTATAACATATTTTCTGCAAGTTAATGGTTTAAGTTATTGCGAAATCTTATGTTTGATAAGATTAAGGGGCTTTGTGAATCTTGTGAAATGGGGAACAAGAAACATTTGGATTGGACAAGCCGGTCGATTATGTTCAAAGGAGGATTTTCCTTCGTGAAGAAAGATGGTTTATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2076 bp · TkA03G043450|TK1151|CDS

ATGTTTGATAAGATTAAGGGGCTTTGTGAATCTTGTGAAATGGGGAACAAGAAACATTTGGATTGGACAAGCCGGTCGATTATGTTCAAAGGAGGATTTTCCTTCGTGAAGAAAGATGGTTTATTGAAATCTTGTGAAATGGGGAAGAAAAAGCATTTGGATTGGACAAGCCGATCGATCATCTCGTCTGGAGGTGATAGAGTTCCTCTAATCAGAAAAGAGGTCAAGAGAAATGATAATGAAATCGGGTCGTCAAATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

691 aa · TkA03G043450|TK1151|PROTEIN

MFDKIKGLCESCEMGNKKHLDWTSRSIMFKGGFSFVKKDGLLKSCEMGKKKHLDWTSRSIISSGGDRVPLIRKEVKRNDNEIGSSNGPATDLEYGDAVQAANVGFSRVLLLAKPDAGRLVIATIALLIASTSSLLIPSFGGRIIDIVSRDIKTPEEQTEALNAVKDTILAVVLVVVVGSLSTALRAWLFSSASERVVARLRKDLFSHLMQQEIAFYDVTRTGELLSRLSEDTQIIKNAATTNLSEALRNLTTAFIGLCFM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G043450
TK1151 IDTkA03G043450
OH-1004 IDLXL04_006505
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.698 / OH-1004 99.846
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G043450
位置Chr03:11414826-11425889 (-)
描述Similar to ABCB25: ABC transporter B family member 25
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g39040 可能涉及内化铝的重新分配。
Arabidopsis ALS1 encodes a root tip and stele localized half type ABC transporter required for root growth in an aluminum toxic environment.2007 · DOI: 10.1007/s00425-006-0452-4

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0755100 金属转运蛋白参与将铝封存在液泡中，这是铝的细胞解毒所必需的。
A tonoplast-localized half-size ABC transporter is required for internal detoxification of aluminum in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04837.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006505 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006783 heme biosynthetic process 生物过程
GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程
GO:0006935 chemotaxis 生物过程
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0010044 response to aluminum ion 生物过程
GO:0034514 mitochondrial unfolded protein response 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0070455 positive regulation of heme biosynthetic process 生物过程
GO:0090374 oligopeptide export from mitochondrion 生物过程
GO:0140982 detoxification of aluminum ion 生物过程
GO:0170037 export from the mitochondrion 生物过程
GO:1902602 aluminum ion transmembrane transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G39040
ddi:DDB_G0293416
dosa:Os03g0755100
hsa:23456
mmu:56199
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.182
排名 1 · TkA03G043450 · TK1151
质体0.162
排名 2 · TkA03G043450 · TK1151
内质网0.151
排名 3 · TkA03G043450 · TK1151
过氧化物酶体0.121
排名 4 · TkA03G043450 · TK1151
线粒体0.107
排名 5 · TkA03G043450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane119-394 aa
PF18895T4SS_pilin153-184 aa
PF13401AAA_22181-211 aa
PF02463SMC_N217-250 aa
PF18895T4SS_pilin241-261 aa
PF00005ABC_tran275-309 aa
PF09818ABC_ATPase336-361 aa
PF00005ABC_tran462-612 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G043450PF00664ABC_membrane1193942.8e-61208.3
TkA03G043450PF18895T4SS_pilin1531840.02515.5
TkA03G043450PF13401AAA_221812110.0116.9
TkA03G043450PF02463SMC_N2172502.2e-0524.7
TkA03G043450PF18895T4SS_pilin2412610.02515.5
TkA03G043450PF00005ABC_tran2753099.5e-33114.4
TkA03G043450PF09818ABC_ATPase3363610.02414.4
TkA03G043450PF00005ABC_tran4626129.5e-33114.4
TkA03G043450PF00270DEAD4716290.01815.5
TkA03G043450PF13521AAA_284744950.1313.2
TkA03G043450PF13401AAA_224756380.0116.9
TkA03G043450PF09818ABC_ATPase4754940.02414.4
TkA03G043450PF07728AAA_54754980.1412.9
TkA03G043450PF00004AAA4764920.01316.7
TkA03G043450PF13604AAA_304765040.06713.7
TkA03G043450PF02463SMC_N5416552.2e-0524.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WML0拟南芥sp|Q0WML0|AB27B_ARATH ABC transporter B family member 2778.700%Swiss-Prot高置信
Q9FNU2水稻sp|Q9FNU2|AB25B_ORYSJ ABC transporter B family member 2577.100%Swiss-Prot高置信

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