TkA03G039360 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G039360

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 10346287-10356726 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

6863 bp · TkA03G039360|TK1151|cDNA

TGGTACAGCTCTGCTGTCGTCATCAATGGTGAAAAAGGCTACAAATTTGCAGTTGATTTTTGATTAAAACTATTTTTGAGCTTTCGGGATCACATGGACAGAGAGGAAGGAGTAGTTACAGAGCTCCTGGGAAACGAGAAGAATATCTTGTAGGCGAAAGTCTGTGATTCTTCTTTTAGGGCTTTTTCAGGATCACAAGTTTGATTATGAAGTGAAGACTGCTCAGTTCGAGGTAAAAGAAGCAGAAATTGATAGCTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3675 bp · TkA03G039360|TK1151|CDS

ATGCTGGGCCGAAAACCCGTATTCCGTCTCCACTACCTAAAATACATCGACGAAACCACCCGACTAATCTCCACATCCCCACTCGAATCCTTCCAAGAACTCCAACCCCTCCGGTACTCCCTCGCCTGTGTCCTCCGGTCCCTCGCGCCCGAATTCGTCGAATCAAAGTCCGAAAAATTCGACCCCAAAACCCGCAAACGTCTCTTCGACCTCCTCTTATCCTGGTGCGACGAGTCCGGGTCCACATGGAGCCAAGATAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1224 aa · TkA03G039360|TK1151|PROTEIN

MLGRKPVFRLHYLKYIDETTRLISTSPLESFQELQPLRYSLACVLRSLAPEFVESKSEKFDPKTRKRLFDLLLSWCDESGSTWSQDSASDYRREVERYKSSQHSRSKDSVDKISFDKEVTEQVEAIQWASMNAMASLLYGPCFDDNARKMSGRVISWINSLFIEPAPRAPFGYSPVDPRTPSYSKYGGDGGRAGTGRERNRGGHLRVSLAKMALKNLLLTNLDLFPACIDQCYYSDAAIADGYFSVLAEVYMRQEIPKCE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G039360`
TK1151 ID	TkA03G039360
OH-1004 ID	LXL04_006461
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 55.998 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA03G039360`
位置	Chr03:10346287-10356726 (-)
描述	Similar to FRYL: Protein furry homolog-like
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_006461` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000902 cell morphogenesis 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0045860 positive regulation of protein kinase activity 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0051012 microtubule sliding 生物过程 GO:0071902 positive regulation of protein serine/threonine kinase activity 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005938 cell cortex 细胞组分 GO:0030427 site of polarized growth 细胞组分 GO:0044297 cell body 细胞组分 GO:0045177 apical part of cell 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	dme:Dmel_CG32045 hsa:285527 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.584

排名 1 · TkA03G039360 · TK1151

细胞核0.234

排名 2 · TkA03G039360 · TK1151

高尔基体0.158

排名 3 · TkA03G039360 · TK1151

细胞膜0.136

排名 4 · TkA03G039360 · TK1151

溶酶体／液泡0.130

排名 5 · TkA03G039360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14228MOR2-PAG1_mid1-837 aa

PF23271HEAT_GCN148-81 aa

PF14225MOR2-PAG1_C281-324 aa

PF23271HEAT_GCN1635-706 aa

PF14225MOR2-PAG1_C650-709 aa

PF23271HEAT_GCN1795-850 aa

PF14225MOR2-PAG1_C803-851 aa

PF14225MOR2-PAG1_C862-1116 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G039360	`PF14228`	MOR2-PAG1_mid	1	837		1727.3
TkA03G039360	`PF23271`	HEAT_GCN1	48	81	0.057	14.2
TkA03G039360	`PF14225`	MOR2-PAG1_C	281	324	1.4e-58	199.2
TkA03G039360	`PF23271`	HEAT_GCN1	635	706	0.057	14.2
TkA03G039360	`PF14225`	MOR2-PAG1_C	650	709	1.4e-58	199.2
TkA03G039360	`PF23271`	HEAT_GCN1	795	850	0.057	14.2
TkA03G039360	`PF14225`	MOR2-PAG1_C	803	851	1.4e-58	199.2
TkA03G039360	`PF14225`	MOR2-PAG1_C	862	1116	1.4e-58	199.2
TkA03G039360	`PF23271`	HEAT_GCN1	1050	1122	0.057	14.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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