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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G030210
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 8109444-8117007 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4689 bp · TkA03G030210|TK1151|cDNA

CCACACCGTCTGCCCCCCAATCTTGTACCACCGTTACGATACACGTTCTCTAGCATTAGTTTTTTAACCTTTTTTTGTCATATATTTTTAGGGCTTTTTTTTTTTGTTAACAAAAACCCACCATTTGGTTTCTCTCTCATCGCCTTCTTTCTCTCTCTACACACATCCAGGTCTTCTTGTTCGTTTTGGACCTGGTACATGCCCACTTTTTAGTTTACACCCATCTCCTCAAAATTAAAAAAAAAAGGCGTCCATTCGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

4038 bp · TkA03G030210|TK1151|CDS

ATGCAAGTGCTTCCCTGTAACGGCCCAGATCAGGGTTCTGAAAAGCCTTTTGTGTATGATGGAGGGTCAAACAATGTCAAACACGAACTAGCTGATGGAACTGGAATCGGAATCGGAATCACGGAAGCATCTGATGATGACCAAAAACTGTCTTCCAACACTCATGATTCCGGAGTTGATAGTCTGGAATTGGCAAGTGGGAATCAGGAATGTGAGTCTGAACCCAAATGGCTCGAACAAGATCAACCCATTGCTGTTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1345 aa · TkA03G030210|TK1151|PROTEIN

MQVLPCNGPDQGSEKPFVYDGGSNNVKHELADGTGIGIGITEASDDDQKLSSNTHDSGVDSLELASGNQECESEPKWLEQDQPIAVWVKWRGKWQAGIRCARSDWPLSTIRAKPTHERKQYLVIFFPRKRNYSWADVLLLRPINEYPEPIAYRSHNIGVKIVKDLTVARRFIMQKIAVSMINTIEQLTTEALRETARSVVMWKEFALEASRCKDYTDLGNMLLKLEEMILQQFLDPFWLEHSKATWVQKCQNAQTSESIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G030210
TK1151 IDTkA03G030210
OH-1004 IDLXL04_000174
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)32.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 22.082 / OH-1004 33.675
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G030210
位置Chr03:8109444-8117007 (-)
描述Similar to SUVH1: Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23740 组蛋白甲基转移酶与其结合伙伴 LDL1/SWP1 一起发挥作用，作为拟南芥花期的调节因子之一。
The SET-domain protein SUVR5 mediates H3K9me2 deposition and silencing at stimulus response genes in a DNA methylation-independent manner.2012 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1002995

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000174 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005694 chromosome 细胞组分
GO:0001228 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003690 double-stranded DNA binding 分子功能
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0010385 double-stranded methylated DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17770
ath:AT1G73100
ath:AT2G24740
ath:AT5G04940
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.955
排名 1 · TkA03G030210 · TK1151
细胞质0.080
排名 2 · TkA03G030210 · TK1151
细胞膜0.033
排名 3 · TkA03G030210 · TK1151
内质网0.018
排名 4 · TkA03G030210 · TK1151
质体0.016
排名 5 · TkA03G030210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26734SUVR5_N81-162 aa
PF31066DUF8799221-257 aa
PF11722zf-TRM13_CCCH400-427 aa
PF18868zf-C2H2_3rep410-442 aa
PF08879WRC411-429 aa
PF23102Zf-C2H2_ZNF451_2nd422-437 aa
PF17123zf-RING_11451-463 aa
PF08879WRC459-475 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G030210PF26734SUVR5_N811625.9e-42142.3
TkA03G030210PF31066DUF87992212575.2e-0523.7
TkA03G030210PF11722zf-TRM13_CCCH4004274.17.8
TkA03G030210PF18868zf-C2H2_3rep4104424.4e-45154.1
TkA03G030210PF08879WRC4114299.26.8
TkA03G030210PF23102Zf-C2H2_ZNF451_2nd4224378.77.1
TkA03G030210PF17123zf-RING_114514632.38.7
TkA03G030210PF08879WRC4594759.26.8
TkA03G030210PF11722zf-TRM13_CCCH4604744.17.8
TkA03G030210PF08879WRC5455629.26.8
TkA03G030210PF23320Zn_SUZ126737016.87.2
TkA03G030210PF23107Zf-C2H2_ZNF451_C6756960.02815.7
TkA03G030210PF05605zf-Di196767340.004817.8
TkA03G030210PF12756zf-C2H2_26766990.006517.4
TkA03G030210PF17003Actin_micro6767030.08612.8
TkA03G030210PF13894zf-C2H2_46786988e-0833.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64827拟南芥sp|O64827|SUVR5_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase SUVR544.600%Swiss-Prot中等置信

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