TkA03G011480 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G011480

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 2964184-2975545 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2838 bp · TkA03G011480|TK1151|cDNA

GCCAGCGAGAATAGCATCCTAGACTTTTGGGATCCAAAATCCAACGAGCATTTTTTGAGAGATTGGGATCACCTGCAACCGATTCATAGACGCCATTATCTGTCCCCATTTATCGAATAATTAACGGCGAAGATTCGATCCCCCACAAGCTGTAGACCACAGCTGTTTGTGTGTGAATTGTGATTCTCCTTTACACATCATCTATGGCGGATTGATTACTCCAAAACTCCAAGGCACAAGGGATAATCAAATCAAATCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1974 bp · TkA03G011480|TK1151|CDS

ATGGAAGCTAAAAAAAAGAAGTACCCTCTTGATGCAAAGGATTACAAGCTATATGAGGAAATTGGTGAAGGAGTCAGTGCCTCTGTGTACAGAGCTCTTTGTGTTCCACTAAATGAGACGGTTGCAATCAAGGTTCTTGATTTGGAAAAGTGTAATAATGATCTGGATGGAATTCGTAGAGAGGTACAAACCATGAGTTTAATCGAGCACCCAAATTTACTACGTGCATATTGCTCTTTCACAACTGGTCAAAGCCTTTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

657 aa · TkA03G011480|TK1151|PROTEIN

MEAKKKKYPLDAKDYKLYEEIGEGVSASVYRALCVPLNETVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMSLIEHPNLLRAYCSFTTGQSLWVVTPYMAAGSCLHIMKSSYQEGFEEPVIATLLREVLKALVYLHNHGHIHRDVKAGNILVDFNGCIKLADFGVSACMFDTGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDYERDKKFSKSFKDLVAACLLKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G011480`
TK1151 ID	TkA03G011480
OH-1004 ID	LXL04_031992
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	47.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.630 / OH-1004 99.324 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G011480

位置 Chr03:2964184-2975545 (-)

描述 Similar to fray2: Serine/threonine-protein kinase fray2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g14480`	Ser/Thr蛋白激酶，在保卫细胞光受体信号传导的初步步骤中起作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031992 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006611 protein export from nucleus 生物过程

GO:0006884 cell volume homeostasis 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程

GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0038116 chemokine (C-C motif) ligand 21 signaling pathway 生物过程

GO:0038146 chemokine (C-X-C motif) ligand 12 signaling pathway 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0070294 renal sodium ion absorption 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ddi:DDB_G0276577

hsa:9943

mmu:108737

pon:100174028

ssc:397618

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.657

排名 1 · TkA03G011480 · TK1151

细胞核0.239

排名 2 · TkA03G011480 · TK1151

细胞膜0.218

排名 3 · TkA03G011480 · TK1151

高尔基体0.096

排名 4 · TkA03G011480 · TK1151

溶酶体／液泡0.060

排名 5 · TkA03G011480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase10-67 aa

PF00069Pkinase15-276 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr16-272 aa

PF03109ABC127-46 aa

PF03109ABC1102-171 aa

PF01636APH108-150 aa

PF17667Pkinase_fungal118-199 aa

PF14531Kinase-like122-220 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G011480	`PF12330`	Haspin_kinase	10	67	0.027	14.2
TkA03G011480	`PF00069`	Pkinase	15	276	2.4e-60	204.9
TkA03G011480	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	16	272	7.5e-46	157.2
TkA03G011480	`PF03109`	ABC1	27	46	0.0003	20.8
TkA03G011480	`PF03109`	ABC1	102	171	0.0003	20.8
TkA03G011480	`PF01636`	APH	108	150	0.17	12.3
TkA03G011480	`PF17667`	Pkinase_fungal	118	199	0.0016	18.0
TkA03G011480	`PF14531`	Kinase-like	122	220	0.0086	16.1
TkA03G011480	`PF07387`	Seadorna_VP7	123	157	0.15	11.8
TkA03G011480	`PF12330`	Haspin_kinase	136	160	0.027	14.2
TkA03G011480	`PF07351`	DUF1480	152	200	0.3	12.0
TkA03G011480	`PF06156`	YabA	298	327	0.74	11.2
TkA03G011480	`PF26095`	CC_Bre1	299	327	0.24	12.4
TkA03G011480	`PF06005`	ZapB	300	327	2.0	9.7
TkA03G011480	`PF04977`	DivIC	302	331	0.76	10.3
TkA03G011480	`PF14531`	Kinase-like	303	359	0.0086	16.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O23304`	拟南芥	sp\|O23304\|BLUS1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BLUS1	47.100%	Swiss-Prot	中等置信

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