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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G010630
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 2687889-2695483 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2296 bp · TkA03G010630|TK1151|cDNA

CTCAGCGTTTTGAACTACGAAAGTTCAAAAGAGGTTAGGTGTATTTGCAAGAAATACACCATCAGCGCGTGTCTTTCACCTTCGCCATCTTCGTACTTGTATGTGTTCTTCTTCTTGAGTGTGAAGATACTATCGTTAGAGGGGCTTTCAGCAAAAGCTTCTCTTTCGATTTTTTTTCTGCATCTAAACCTAAATGTATATATATGTTACTCATATTTCTACAAGCTATCTTTCTGTGTATATATTTATGAGATTAAGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1803 bp · TkA03G010630|TK1151|CDS

ATGGTACTTTTTCATGGTGAGGTGGATGATATTGATGACATTGATTGGGATACAGAAGATGAACTTGAAATACAGAACATAGGATCATCTTCTTGTTCAACTTTAGTAACTAGCAATACTCAAACTGCTATTATCAGCAATGGGGAGGCAAGCTCATCAGCAAGCTCCTCAAACTCCAAGTTGCTACAGCATTTCCTAGGAATGGGGTTCTCTGACAAATTGATTATAAAAGCAATCGAAGAAAATGGGGAAGATAACCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

600 aa · TkA03G010630|TK1151|PROTEIN

MVLFHGEVDDIDDIDWDTEDELEIQNIGSSSCSTLVTSNTQTAIISNGEASSSASSSNSKLLQHFLGMGFSDKLIIKAIEENGEDNPESILETLLTYSALEEPQDGNFSCHTNSHQQQQENVNYDDFSSDYDETIPNELSEFDSLSDDEIPENYESLPKHEKTLLSLTKMGYSVEEASAAVERCPDAPIGDLTDFIDVARLAKTEAEFFEEEKPKPLFTLNPKLKRKKLLETYKTKKQKGQLTEEDDLIRLPNPMIGFGV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G010630
TK1151 IDTkA03G010630
OH-1004 IDLXL04_006134
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G010630
位置Chr03:2687889-2695483 (-)
描述Similar to DRM2: DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q9M548 参与新生DNA甲基化。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q9LXE5 参与新生DNA甲基化。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0110800 参与新生DNA甲基化。 暂无已核实直接文献
Os11g0109200 参与新生DNA甲基化。 暂无已核实直接文献
Os12g0108900 参与新生DNA甲基化。 暂无已核实直接文献
Os05g0133900 参与新生DNA甲基化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006134 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003886 DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity 分子功能
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0009008 DNA-methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G14620
ath:AT5G15380
dosa:Os03g0110800
dosa:Os05g0133900
dosa:Os12g0108900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.769
排名 1 · TkA03G010630 · TK1151
细胞质0.254
排名 2 · TkA03G010630 · TK1151
线粒体0.043
排名 3 · TkA03G010630 · TK1151
细胞膜0.039
排名 4 · TkA03G010630 · TK1151
内质网0.026
排名 5 · TkA03G010630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22562UBA_758-88 aa
PF23053UBA_N4BP159-93 aa
PF00627UBA59-79 aa
PF22567UBA_961-96 aa
PF22562UBA_7161-182 aa
PF00627UBA161-184 aa
PF23053UBA_N4BP1168-173 aa
PF22567UBA_9169-182 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G010630PF22562UBA_758880.01116.3
TkA03G010630PF23053UBA_N4BP159930.03914.4
TkA03G010630PF00627UBA59790.2112.2
TkA03G010630PF22567UBA_961960.0009119.8
TkA03G010630PF22562UBA_71611820.01116.3
TkA03G010630PF00627UBA1611840.2112.2
TkA03G010630PF23053UBA_N4BP11681730.03914.4
TkA03G010630PF22567UBA_91691820.0009119.8
TkA03G010630PF22567UBA_93673950.0009119.8
TkA03G010630PF00145DNA_methylase3794619.7e-1245.7
TkA03G010630PF23053UBA_N4BP13823900.03914.4
TkA03G010630PF00627UBA4284360.2112.2
TkA03G010630PF22562UBA_74304350.01116.3
TkA03G010630PF00145DNA_methylase4765909.7e-1245.7
TkA03G010630PF27849MAST4805680.08313.2
TkA03G010630PF23053UBA_N4BP15875920.03914.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M548拟南芥sp|Q9M548|DRM2_ARATH DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM255.700%Swiss-Prot高置信
Q9LXE5拟南芥sp|Q9LXE5|DRM1L_ARATH DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM154.600%Swiss-Prot高置信
Q10SU5水稻sp|Q10SU5|DRM2_ORYSJ DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM249.600%Swiss-Prot中等置信
Q2RBJ4水稻sp|Q2RBJ4|DRM1A_ORYSJ DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM1A40.900%Swiss-Prot中等置信
Q2QYR5水稻sp|Q2QYR5|DRM1B_ORYSJ Probable inactive DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM1B43.900%Swiss-Prot中等置信
Q6AUQ7水稻sp|Q6AUQ7|DRM3_ORYSJ Probable inactive DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM344.900%Swiss-Prot中等置信

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