TkA02G610290 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G610290

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 157458645-157462630 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2823 bp · TkA02G610290|TK1151|cDNA

CCTATTTGAACTTTTAGTTGTCCAATACTCCAATATCATATGCGTCGAGTTTTTAGAAAGAATAGTCTCCTCACCAATTCGATAGTCGGCACTGAGTTCTCCGATCCTATTTCCAAATTCGTCAACGTGTGGGAACTTTTGCCGATCACAAAATCGTATCTTTTCTGAGGTTCGATTCGGTTTTCATAAGTTTTTGCATGCTTATCTTCTAATTACAGCAGTGTTTCATCAACAAATCGATTTGCGAGGGGTTTTATGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2289 bp · TkA02G610290|TK1151|CDS

ATGCAATCGGGTGAAAATAAGAAGTTGAAATACTCCAATATCACTTGCAAGATGCCTCAGCCAGACAGTTGTGTAGATGACCAGATTCCTTTTTCAGTTGAGAAGATAGTGCAGTTCCCGTTACCTGGTTGTGGTTCTCCAGCTTCAGTTAATTTTAGTCCTGATGATAATCTTGTATCTTACTTGTTTAGTCCCGATCAAACATTAAACAGAAAAGTATTCATCTTTGATCTCACAACCTGTAAGCAAGAAGTGTTTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

762 aa · TkA02G610290|TK1151|PROTEIN

MQSGENKKLKYSNITCKMPQPDSCVDDQIPFSVEKIVQFPLPGCGSPASVNFSPDDNLVSYLFSPDQTLNRKVFIFDLTTCKQEVFFSPPDGGLDEDNLSEEEKLRRERSRERGLGVTRYEWVKTSPKKTTIMVPLPAGIYFMDRSLQPQLKLPCDSSPIIDPHLSPDGTMLAYVRNHELHALDLLYNRSKRLTSGANGTTKTHAVAEYIAQEEMDRRNGYWWSPDSKCIAFTEVDSSEIPLYRIMHQGKNTVGSDAQEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G610290`
TK1151 ID	TkA02G610290
OH-1004 ID	LXL04_011823
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 99.869 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G610290`
位置	Chr02:157458645-157462630 (-)
描述	Similar to dap4: Dipeptidyl aminopeptidase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_011823` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0006955 immune response 生物过程 GO:0043069 negative regulation of programmed cell death 生物过程 GO:0051603 proteolysis involved in protein catabolic process 生物过程 GO:0051604 protein maturation 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005874 microtubule 细胞组分 GO:0031252 cell leading edge 细胞组分 GO:0004177 aminopeptidase activity 分子功能 GO:0008236 serine-type peptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	dre:768170 hsa:54878 hsa:91039 mmu:74388 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.719

排名 1 · TkA02G610290 · TK1151

细胞核0.350

排名 2 · TkA02G610290 · TK1151

线粒体0.128

排名 3 · TkA02G610290 · TK1151

细胞膜0.056

排名 4 · TkA02G610290 · TK1151

过氧化物酶体0.044

排名 5 · TkA02G610290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12697Abhydrolase_640-56 aa

PF00930DPPIV_N48-63 aa

PF07676PD4051-82 aa

PF26549Tricorn_N51-79 aa

PF26549Tricorn_N140-179 aa

PF07676PD40148-177 aa

PF00930DPPIV_N150-473 aa

PF26550Tricorn_2nd207-247 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G610290	`PF12697`	Abhydrolase_6	40	56	0.12	13.7
TkA02G610290	`PF00930`	DPPIV_N	48	63	3.5e-81	273.4
TkA02G610290	`PF07676`	PD40	51	82	0.019	14.8
TkA02G610290	`PF26549`	Tricorn_N	51	79	0.061	13.4
TkA02G610290	`PF26549`	Tricorn_N	140	179	0.061	13.4
TkA02G610290	`PF07676`	PD40	148	177	0.019	14.8
TkA02G610290	`PF00930`	DPPIV_N	150	473	3.5e-81	273.4
TkA02G610290	`PF26550`	Tricorn_2nd	207	247	0.0074	15.7
TkA02G610290	`PF07676`	PD40	223	247	0.019	14.8
TkA02G610290	`PF26549`	Tricorn_N	223	249	0.061	13.4
TkA02G610290	`PF20434`	BD-FAE	540	641	0.16	12.2
TkA02G610290	`PF07519`	Tannase	540	663	0.18	11.4
TkA02G610290	`PF00561`	Abhydrolase_1	542	657	0.00012	22.5
TkA02G610290	`PF12697`	Abhydrolase_6	556	669	0.12	13.7
TkA02G610290	`PF00326`	Peptidase_S9	563	761	7.9e-52	176.6
TkA02G610290	`PF12146`	Hydrolase_4	567	663	0.0032	17.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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