TkA02G607970 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G607970

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 156840331-156843903 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2817 bp · TkA02G607970|TK1151|cDNA

TAGGATTCAATACGATTATAATCAACATCAATAATGTAATGCTAACAAAAAATATTATTTAGTAATCAAATAAAATTAATAGGTTTTTATAAGGTCAGGGAGCCAGACAGAATGGACCAAATTCATGAGAGAAGGAGGGTTATAGCCTTATAGGCGCCGCGGTTGTGATGTTCGTCGGTGCTTTTATCTCCACCTTGCTTCAACAGAGTTCCTCCACCGGAAATGGCGGAACAATATTTCACTCCTCCAGCTACAGGTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1887 bp · TkA02G607970|TK1151|CDS

ATGAAGAACAAAAACATTTTTGTATTCTCTGCAATTTTCTTGTTCGGAGCAACTGTATCCCTGGTTGCCGGAGAGCCATTGGAAGATAAGCAGGTTTTAATTAATTTCATTCAAAGCATCACACACAGTCGCGCAATCAACTGGGATATGGGTTCTTCAGCTTGTGCTAACTGGACCGGGATAACATGTAATCATGACGAGTCAAGAATCATCGCCCTTCGTTTGCCGGCGTTTAGTCTTCAGGGTCCTATTCCGCCGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

628 aa · TkA02G607970|TK1151|PROTEIN

MKNKNIFVFSAIFLFGATVSLVAGEPLEDKQVLINFIQSITHSRAINWDMGSSACANWTGITCNHDESRIIALRLPAFSLQGPIPPNTLGQLSDLQILSLRSNGLTGPLPPDFANLRNLTALYLQSNGFYGPLPMKFSKWNNLSILDLSNNGFNGSIPSSISNLTHLTALNLANNSFSGEIPNVSIPSLQALNLSNNNLTGPVPQSLDRFPSSSFAGNNISPLTSPPPVPSPAAQPSSKSSKLGEPAILGIAIGGCALAF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G607970`
TK1151 ID	TkA02G607970
OH-1004 ID	LXL04_011852
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 96.172 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G607970

位置 Chr02:156840331-156843903 (+)

描述 Similar to At4g23740: Probable inactive receptor kinase At4g23740

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g23740`	可能的非活性受体激酶 At4g23740。	暂无已核实直接文献
`At2g26730`	可能失活的受体激酶 At2g26730。	暂无已核实直接文献
`At5g53320`	可能不活跃的受体激酶 At5g53320。	暂无已核实直接文献
`At1g64210`	推定不活性的类受体蛋白激酶 At1g64210。	暂无已核实直接文献
`At5g24100`	失活的富含亮氨酸重复结构受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g24100。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011852 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0042802 identical protein binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G64210

ath:AT2G26730

ath:AT4G23740

ath:AT5G24100

ath:AT5G53320

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.879

排名 1 · TkA02G607970 · TK1151

细胞质0.076

排名 2 · TkA02G607970 · TK1151

内质网0.066

排名 3 · TkA02G607970 · TK1151

细胞核0.058

排名 4 · TkA02G607970 · TK1151

溶酶体／液泡0.019

排名 5 · TkA02G607970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_228-64 aa

PF25019LRR_R13L1-DRL2181-125 aa

PF13855LRR_884-128 aa

PF23598LRR_1486-126 aa

PF24758LRR_At5g5637092-196 aa

PF13516LRR_694-107 aa

PF00560LRR_195-116 aa

PF12799LRR_495-127 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G607970	`PF08263`	LRRNT_2	28	64	8.9e-08	33.0
TkA02G607970	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	81	125	0.048	14.3
TkA02G607970	`PF13855`	LRR_8	84	128	4.6e-14	52.6
TkA02G607970	`PF23598`	LRR_14	86	126	5.8e-08	32.6
TkA02G607970	`PF24758`	LRR_At5g56370	92	196	0.097	13.0
TkA02G607970	`PF13516`	LRR_6	94	107	0.00052	20.6
TkA02G607970	`PF00560`	LRR_1	95	116	3.6e-15	53.5
TkA02G607970	`PF12799`	LRR_4	95	127	8e-09	36.2
TkA02G607970	`PF24141`	LRR_ComC	114	206	0.0033	17.9
TkA02G607970	`PF13516`	LRR_6	116	128	0.00052	20.6
TkA02G607970	`PF00560`	LRR_1	118	139	3.6e-15	53.5
TkA02G607970	`PF23598`	LRR_14	133	193	5.8e-08	32.6
TkA02G607970	`PF13855`	LRR_8	137	176	4.6e-14	52.6
TkA02G607970	`PF00560`	LRR_1	142	164	3.6e-15	53.5
TkA02G607970	`PF12799`	LRR_4	142	177	8e-09	36.2
TkA02G607970	`PF13516`	LRR_6	142	154	0.00052	20.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SUQ3`	拟南芥	sp\|Q9SUQ3\|Y4374_ARATH Probable inactive receptor kinase At4g23740	59.300%	Swiss-Prot	高置信
`O48788`	拟南芥	sp\|O48788\|Y2267_ARATH Probable inactive receptor kinase At2g26730	55.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FK10`	拟南芥	sp\|Q9FK10\|Y5332_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g53320	56.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SH71`	拟南芥	sp\|Q9SH71\|Y1421_ARATH Putative inactive receptor-like protein kinase At1g64210	55.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FL63`	拟南芥	sp\|Q9FL63\|Y5410_ARATH Inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24100	51.500%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情