TkA02G606580 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G606580

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 156496716-156498939 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2150 bp · TkA02G606580|TK1151|cDNA

ATCACGGGTCCTTTGCCCAAAGTTAACACGAGCACTAACATTGCTCTTGAGTGGTTGGATCTCTCATTCACAAACTCATTAGGAGAACTACCCGACTCAATTGGCCAACTCATATCCCTAGACCACTTGTATCTCTTTGATTCTGGTTTGGTGGGCCCTCTTCCAAAATCCCTAGTCAACCTTAGGCACCTTATTGCTATTGATTTATCATATAACAAGCTTAATGGAACATTGCCTGCTTTCTTGTTCACTCTTCCATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1122 bp · TkA02G606580|TK1151|CDS

ATCACGGGTCCTTTGCCCAAAGTTAACACGAGCACTAACATTGCTCTTGAGTGGTTGGATCTCTCATTCACAAACTCATTAGGAGAACTACCCGACTCAATTGGCCAACTCATATCCCTAGACCACTTGTATCTCTTTGATTCTGGTTTGGTGGGCCCTCTTCCAAAATCCCTAGTCAACCTTAGGCACCTTATTGCTATTGATTTATCATATAACAAGCTTAATGGAACATTGCCTGCTTTCTTGTTCACTCTTCCATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

373 aa · TkA02G606580|TK1151|PROTEIN

ITGPLPKVNTSTNIALEWLDLSFTNSLGELPDSIGQLISLDHLYLFDSGLVGPLPKSLVNLRHLIAIDLSYNKLNGTLPAFLFTLPLIQHINLDENMFSGGLPSEFYNCRSLQLLYLSSNQFNGEINQGSTPPSFVQLINLKFLSLSWNNFTGLWELESLLSSLPKLQTLDLSYSGVSIVTTNATHYHINPGFRGLALASCNLILFPESLQEMKDLEYLDLSNNDIHGEIPHWAGEIGGYRLSGLNLSHNSITGLPQSLW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G606580`
TK1151 ID	TkA02G606580
OH-1004 ID	LXL04_011869
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 51.206 / OH-1004 19.670 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G606580

位置 Chr02:156496716-156498939 (+)

描述 Similar to RLP7: Receptor-like protein 7

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g45616`	受体样蛋白 6。	暂无已核实直接文献
`At4g13810`	受体样蛋白 47。	暂无已核实直接文献
`At2g32680`	参与感知坏死和乙烯诱导肽 1 类蛋白（NLPs），这些蛋白作为胞外信号介导免疫激活。	An RLP23-SOBIR1-BAK1 complex mediates NLP-triggered immunity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.140
`At4g13900`	受体样蛋白 49。	暂无已核实直接文献
`At2g25470`	类受体蛋白 21。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011869 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009791 post-embryonic development 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0051707 response to other organism 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G45616

ath:AT1G47890

ath:AT2G15080

ath:AT3G11010

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.737

排名 1 · TkA02G606580 · TK1151

内质网0.129

排名 2 · TkA02G606580 · TK1151

细胞核0.091

排名 3 · TkA02G606580 · TK1151

细胞质0.086

排名 4 · TkA02G606580 · TK1151

细胞外0.034

排名 5 · TkA02G606580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_815-47 aa

PF23598LRR_1415-82 aa

PF23286LRR_1315-88 aa

PF25019LRR_R13L1-DRL2115-45 aa

PF00560LRR_116-37 aa

PF12799LRR_416-46 aa

PF25013LRR_Zer-116-73 aa

PF13516LRR_619-25 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G606580	`PF13855`	LRR_8	15	47	4.6e-28	97.5
TkA02G606580	`PF23598`	LRR_14	15	82	8.1e-13	48.6
TkA02G606580	`PF23286`	LRR_13	15	88	0.00015	22.3
TkA02G606580	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	15	45	0.18	12.4
TkA02G606580	`PF00560`	LRR_1	16	37	1.7e-30	99.2
TkA02G606580	`PF12799`	LRR_4	16	46	3.8e-20	72.2
TkA02G606580	`PF25013`	LRR_Zer-1	16	73	3e-06	28.1
TkA02G606580	`PF13516`	LRR_6	19	25	3.7e-06	27.3
TkA02G606580	`PF00560`	LRR_1	39	61	1.7e-30	99.2
TkA02G606580	`PF12799`	LRR_4	39	74	3.8e-20	72.2
TkA02G606580	`PF24758`	LRR_At5g56370	52	93	4.7e-07	30.4
TkA02G606580	`PF13855`	LRR_8	56	97	4.6e-28	97.5
TkA02G606580	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	60	94	0.18	12.4
TkA02G606580	`PF13516`	LRR_6	61	75	3.7e-06	27.3
TkA02G606580	`PF24048`	LRR_NXF1-5	61	98	3.4	8.0
TkA02G606580	`PF29247`	LRR_MHP1-HER1-GIP3	62	82	0.0032	17.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C637`	拟南芥	sp\|Q9C637\|RLP6_ARATH Receptor-like protein 6	29.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SVN2`	拟南芥	sp\|Q9SVN2\|RLP47_ARATH Receptor-like protein 47	35.100%	Swiss-Prot	低置信
`O48849`	拟南芥	sp\|O48849\|RLP23_ARATH Receptor like protein 23	33.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SVM3`	拟南芥	sp\|Q9SVM3\|RLP49_ARATH Receptor-like protein 49	33.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SKK2`	拟南芥	sp\|Q9SKK2\|RLP21_ARATH Receptor like protein 21	27.500%	Swiss-Prot	低置信

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