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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G594160
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 153310678-153312105 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

870 bp · TkA02G594160|TK1151|cDNA

ATGGATCAAATTTCCAACTCTCTTCTCCACAAATCCATTCCACAAAATCTATCAACTTCTTTCAAGATCATGTTATTTATCCTCCTTAGTTTACTCGCGTCTCTTTTTCTAGTTCAAAACCAAGAAGCTAGCTTTTTAGCGCTTTTTGGTATTGTAATATTTTTCGTTATTTATAAAACTTTTCTTTTATCATCGTCTCCATCAATCTACCTCGTAGATTACTCTTGCTTAAAACCACCGAGCTATTGGAGAGTACCCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

870 bp · TkA02G594160|TK1151|CDS

ATGGATCAAATTTCCAACTCTCTTCTCCACAAATCCATTCCACAAAATCTATCAACTTCTTTCAAGATCATGTTATTTATCCTCCTTAGTTTACTCGCGTCTCTTTTTCTAGTTCAAAACCAAGAAGCTAGCTTTTTAGCGCTTTTTGGTATTGTAATATTTTTCGTTATTTATAAAACTTTTCTTTTATCATCGTCTCCATCAATCTACCTCGTAGATTACTCTTGCTTAAAACCACCGAGCTATTGGAGAGTACCCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

289 aa · TkA02G594160|TK1151|PROTEIN

MDQISNSLLHKSIPQNLSTSFKIMLFILLSLLASLFLVQNQEASFLALFGIVIFFVIYKTFLLSSSPSIYLVDYSCLKPPSYWRVPFSSFLEHSRIVHSLDQESVDFMSKVLGSSGQSQNTCIPPPLHYIPPRSSHDDAINEAQMVLFPVFEDLLSKTQLSPLDIDIIIVNCSGFCPNPSLSSIIVNRYSMREDIKSFNISGMGCSASALAVDMAHNLLKSSSSLWYELAYMEGKERVKEGERVLQLGMGSGPKCISLVW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G594160
TK1151 IDTkA02G594160
OH-1004 IDLXL04_011997
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G594160
位置Chr02:153310678-153312105 (+)
描述Similar to KCS5: 3-ketoacyl-CoA synthase 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68530 有助于角质层蜡和木栓质的生物合成。
CUT1, an Arabidopsis gene required for cuticular wax biosynthesis and pollen fertility, encodes a very-long-chain fatty acid condensing enzyme.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.5.825
Alterations in CER6, a gene identical to CUT1, differentially affect long-chain lipid content on the surface of pollen and stems.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.10.2001
At1g25450 主要介导含26至30个碳原子的超长链脂肪酸（VLCFA）的合成。
Specific and differential inhibition of very-long-chain fatty acid elongases from Arabidopsis thaliana by different herbicides.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0404600101
At1g71160 3-酮酰辅酶 A 合成酶 7。 暂无已核实直接文献
At1g19440 3-酮酰辅酶A合成酶 4。 暂无已核实直接文献
At2g16280 参与C22至C24脂肪酸的延长；这些脂肪酸是角质层蜡、脂肪族木栓质及包括鞘脂和磷脂在内的膜脂的生物合成前体。
Arabidopsis 3-ketoacyl-coenzyme a synthase9 is involved in the synthesis of tetracosanoic acids as precursors of cuticular waxes, suberins, sphingolipids, and phospholipids.2013 · DOI: 10.1104/pp.112.210450

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011997 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000038 very long-chain fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程
GO:0030497 fatty acid elongation 生物过程
GO:0048868 pollen tube development 生物过程
GO:0160062 cutin-based cuticle development 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19440
ath:AT1G25450
ath:AT1G68530
ath:AT2G16280
ath:AT4G34510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.749
排名 1 · TkA02G594160 · TK1151
细胞核0.101
排名 2 · TkA02G594160 · TK1151
细胞质0.079
排名 3 · TkA02G594160 · TK1151
线粒体0.055
排名 4 · TkA02G594160 · TK1151
高尔基体0.049
排名 5 · TkA02G594160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12420DUF36713-58 aa
PF19507DUF604123-73 aa
PF08392FAE1_CUT1_RppA68-222 aa
PF08541ACP_syn_III_C155-170 aa
PF08541ACP_syn_III_C206-261 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G594160PF12420DUF36713581.39.2
TkA02G594160PF19507DUF604123730.03414.9
TkA02G594160PF08392FAE1_CUT1_RppA682229.8e-56189.9
TkA02G594160PF08541ACP_syn_III_C1551700.03115.1
TkA02G594160PF08541ACP_syn_III_C2062610.03115.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XF43拟南芥sp|Q9XF43|KCS6_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 630.000%Swiss-Prot中等置信
Q9C6L5拟南芥sp|Q9C6L5|KCS5_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 551.700%Swiss-Prot中等置信
Q9C992拟南芥sp|Q9C992|KCS7_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 747.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LN49拟南芥sp|Q9LN49|KCS4_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 445.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SIX1拟南芥sp|Q9SIX1|KCS9_ARATH 3-ketoacyl-CoA synthase 940.100%Swiss-Prot中等置信

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