TkA02G581780 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G581780

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 150112049-150114741 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1938 bp · TkA02G581780|TK1151|cDNA

GGGAATATGTAAAACAAACGAGAAGCGCCTTCACCAGACTCAAATGTTTAGGTCTCACTTTACTGACAGACATTCACAATTCACACACACTCACATACCTCTCCCGAAGGTCCGACAATGGCGAATAACTCCACCACCAACAATGAAAATCTGTTTTCTTCGTTAATTTCTGATATCAAAACCTACAATGGGACAGATCCTCTTCTCCCATGGCTCCGAGGCATTAAGAAGATGAACGATTTATTACCTCAACAGCTACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1350 bp · TkA02G581780|TK1151|CDS

ATGGCGAATAACTCCACCACCAACAATGAAAATCTGTTTTCTTCGTTAATTTCTGATATCAAAACCTACAATGGGACAGATCCTCTTCTCCCATGGCTCCGAGGCATTAAGAAGATGAACGATTTATTACCTCAACAGCTACTCAAACAGAAACTTCCTCGGTTTCTTCAAAAGTGCGCTCAAACATTCGAAACAGACCTCCGTTATCGCAATGATTTACGCTACCTTCGTGTCTGGATGAAATTGTTGGATTATGTTTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

449 aa · TkA02G581780|TK1151|PROTEIN

MANNSTTNNENLFSSLISDIKTYNGTDPLLPWLRGIKKMNDLLPQQLLKQKLPRFLQKCAQTFETDLRYRNDLRYLRVWMKLLDYVCDPGAVLEKMKTNHIGNKRSLFYQAYALYYEKLKKFTDAEKMYHLGVQNLAEPQDELQKSFDQFLHRMERHKHKKTRVGLVKDKKVISQSMEDKLDEHAGDNTVVVRFTKTAIGGKPKAEDARHHGLVEPTINTKEAMDAINSMFREPLGPEPSQKYNPQKGKENADSFKVFND...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G581780`
TK1151 ID	TkA02G581780
OH-1004 ID	LXL04_015293
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	36.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 30.735 / OH-1004 35.938 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G581780

位置 Chr02:150112049-150114741 (+)

描述 Similar to BUBR1: Mitotic spindle checkpoint protein BUBR1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g33560`	有丝分裂检查点的必需组分。	Spindle assembly checkpoint protein dynamics reveal conserved and unsuspected roles in plant cell division.2009 · DOI: 10.1371/journal.pone.0006757
`At2g20635`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，在有丝分裂期间执行两个关键功能：它对纺锤体组装检查点信号传导和染色体正确排列都是必不可少的。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015293 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007091 metaphase/anaphase transition of mitotic cell cycle 生物过程

GO:0007094 mitotic spindle assembly checkpoint signaling 生物过程

GO:0045841 negative regulation of mitotic metaphase/anaphase transition 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0051754 meiotic sister chromatid cohesion, centromeric 生物过程

GO:0071459 protein localization to chromosome, centromeric region 生物过程

GO:0000776 kinetochore 细胞组分

GO:0000940 outer kinetochore 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005680 anaphase-promoting complex 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005813 centrosome 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G33560

ddi:DDB_G0292676

hsa:701

mmu:12236

spo:2539219

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.547

排名 1 · TkA02G581780 · TK1151

细胞质0.463

排名 2 · TkA02G581780 · TK1151

细胞膜0.058

排名 3 · TkA02G581780 · TK1151

线粒体0.043

排名 4 · TkA02G581780 · TK1151

内质网0.038

排名 5 · TkA02G581780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08311Mad3_BUB1_I16-133 aa

PF17014Mad3_BUB1_I_269-162 aa

PF22498FKBP-like_N127-147 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G581780	`PF08311`	Mad3_BUB1_I	16	133	8.2e-33	113.7
TkA02G581780	`PF17014`	Mad3_BUB1_I_2	69	162	0.00074	20.3
TkA02G581780	`PF22498`	FKBP-like_N	127	147	0.056	14.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22806`	拟南芥	sp\|O22806\|BUBR1_ARATH Mitotic spindle checkpoint protein BUBR1	31.700%	Swiss-Prot	低置信
`F4IVI0`	拟南芥	sp\|F4IVI0\|BUB1_ARATH Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1	35.700%	Swiss-Prot	低置信

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