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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G578570
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 149243268-149246219 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

737 bp · TkA02G578570|TK1151|cDNA

TTTCTCTTATCGCTGAGGACCGATTGCGTGGAACTTTGGGTTGATTGAATTCCTTTTAACTTTTTAAGACATCATTCTTCCTCGATTTCACTTCTTTTTTCCATTAATCGGTGTGAGAAATGGGGCGATTGTTTCAAGTCACGTTAGAGGGCAAATTTTACACCTGTAAACACTGCAAAACCCATCTTGCTCTTTGCGATGATATCGTTTCAAAGGCCTTTCATTGCAAGGATGGAAAGGCATATCTCTTCAGTAAGGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

396 bp · TkA02G578570|TK1151|CDS

ATGGGGCGATTGTTTCAAGTCACGTTAGAGGGCAAATTTTACACCTGTAAACACTGCAAAACCCATCTTGCTCTTTGCGATGATATCGTTTCAAAGGCCTTTCATTGCAAGGATGGAAAGGCATATCTCTTCAGTAAGGTAGTGAATGTGACTATTGGTGTGAAGGAAGATAGGCTGATGATGACGGGGCTGCACACGGTTGCTGACATTTTTTGTGTTGCATGTGGATCAATTGTTGGATGGACATATGAAACCGCTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

131 aa · TkA02G578570|TK1151|PROTEIN

MGRLFQVTLEGKFYTCKHCKTHLALCDDIVSKAFHCKDGKAYLFSKVVNVTIGVKEDRLMMTGLHTVADIFCVACGSIVGWTYETAHEKSQKYKEGKSVLERGKLRGPDGSSYWVSHEVQAHFGGSDQDDV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G578570
TK1151 IDTkA02G578570
OH-1004 IDLXL04_012249
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G578570
位置Chr02:149243268-149246219 (-)
描述Similar to Protein yippee-like
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g11230 蛋白 yippee 样 At3g11230。 暂无已核实直接文献
At3g08990 蛋白 yippee 样 At3g08990。 暂无已核实直接文献
At3g55890 蛋白 yippee-like At3g55890。 暂无已核实直接文献
At5g53940 类yippee蛋白 At5g53940。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012249 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000151 ubiquitin ligase complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G08990
ath:AT3G11230
ath:AT3G55890
ath:AT5G53940
sot:102577430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.668
排名 1 · TkA02G578570 · TK1151
细胞质0.511
排名 2 · TkA02G578570 · TK1151
细胞膜0.052
排名 3 · TkA02G578570 · TK1151
内质网0.043
排名 4 · TkA02G578570 · TK1151
线粒体0.042
排名 5 · TkA02G578570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26417DUF81126-50 aa
PF22289DmmA-like_C8-25 aa
PF25165DUF782811-29 aa
PF24046At4g0833013-27 aa
PF03226Yippee-Mis1814-106 aa
PF11648RIG-I_C-RD15-85 aa
PF25165DUF782868-89 aa
PF24046At4g0833069-95 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G578570PF26417DUF81126500.1412.5
TkA02G578570PF22289DmmA-like_C8250.3711.5
TkA02G578570PF25165DUF782811290.1113.0
TkA02G578570PF24046At4g0833013270.05314.3
TkA02G578570PF03226Yippee-Mis18141061.6e-1248.2
TkA02G578570PF11648RIG-I_C-RD15850.02615.4
TkA02G578570PF25165DUF782868890.1113.0
TkA02G578570PF24046At4g0833069950.05314.3
TkA02G578570PF22289DmmA-like_C70780.3711.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C777拟南芥sp|Q9C777|YIPL3_ARATH Protein yippee-like At3g1123071.800%Swiss-Prot高置信
Q9SR97拟南芥sp|Q9SR97|YIPL1_ARATH Protein yippee-like At3g0899066.400%Swiss-Prot高置信
Q9LY56拟南芥sp|Q9LY56|YIPL4_ARATH Protein yippee-like At3g5589067.200%Swiss-Prot高置信
Q9FN32拟南芥sp|Q9FN32|YIPL7_ARATH Protein yippee-like At5g5394064.800%Swiss-Prot高置信

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