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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G535930
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 138203615-138205976 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1665 bp · TkA02G535930|TK1151|cDNA

GTAAGATTTGATGGCCACGTCTCAAACACGCGAGATTTAAAGCGGAGAGTATATTTCCACGAGTAAAACCCAAGCCATGCGCATCTACAACCCCACTTTCTGCTACGTGGTTGTACGGACGACGATTTTGAGATAGAATCTACAGAATGAGCGTCCTTCACGGCGCGTGCGCATCGACATTCCTTACCTCCACATTCACGCGCCAATTAAGACTCTTCAGCGGAAGTAAACGGCAGCCGTCGCAGCGACTTAAAGGAGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1026 bp · TkA02G535930|TK1151|CDS

ATGAGCGTCCTTCACGGCGCGTGCGCATCGACATTCCTTACCTCCACATTCACGCGCCAATTAAGACTCTTCAGCGGAAGTAAACGGCAGCCGTCGCAGCGACTTAAAGGAGGAGCTATTAGTGCCATGGGTTCTATGTCAGTTACGACAGCGGATGACCAGCGGTTGAAGAAAGGAATAGCAGAGTTCTACGACGAATCATCGGGAGTTTGGGAGAATATATGGGGAGAACACATGCATCACGGATTTTACGACCCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

341 aa · TkA02G535930|TK1151|PROTEIN

MSVLHGACASTFLTSTFTRQLRLFSGSKRQPSQRLKGGAISAMGSMSVTTADDQRLKKGIAEFYDESSGVWENIWGEHMHHGFYDPDAVVQISDHRSAQIRMIEQALVFASVPEESEKKPRSIVDVGCGIGGSSRYLSRKYGAECVGITLSPVQAQRANALAAAQGLANKVSFEVADALNQPFPDGKFDLVWSMESGEHMPDKLKFVSELARVASPGGTIIIVTWCHRDLSPGEESLLPEEKKLLDKICDAFYLPAWCST...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G535930
TK1151 IDTkA02G535930
OH-1004 IDLXL04_012833
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G535930
位置Chr02:138203615-138205976 (-)
描述Similar to VTE4: Probable tocopherol O-methyltransferase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g64970 参与生育酚的合成。
Characterization of an Arabidopsis mutant deficient in gamma-tocopherol methyltransferase.2003 · DOI: 10.1023/b:plan.0000004307.62398.91

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0701600 参与生育酚（维生素E）的合成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012833 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009820 alkaloid metabolic process 生物过程
GO:0009821 alkaloid biosynthetic process 生物过程
GO:0010189 vitamin E biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:1900985 vindoline biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008170 N-methyltransferase activity 分子功能
GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64970
dosa:Os02g0701600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.547
排名 1 · TkA02G535930 · TK1151
线粒体0.436
排名 2 · TkA02G535930 · TK1151
细胞质0.090
排名 3 · TkA02G535930 · TK1151
过氧化物酶体0.044
排名 4 · TkA02G535930 · TK1151
细胞核0.038
排名 5 · TkA02G535930 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12147Methyltransf_20109-181 aa
PF13679Methyltransf_32112-177 aa
PF13489Methyltransf_23115-239 aa
PF01209Ubie_methyltran116-227 aa
PF08003Methyltransf_9116-258 aa
PF00891Methyltransf_2118-224 aa
PF05175MTS119-224 aa
PF01728FtsJ119-191 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G535930PF12147Methyltransf_201091810.2910.9
TkA02G535930PF13679Methyltransf_321121770.001219.5
TkA02G535930PF13489Methyltransf_231152392.9e-1557.1
TkA02G535930PF01209Ubie_methyltran1162271e-0629.0
TkA02G535930PF08003Methyltransf_91162580.004716.7
TkA02G535930PF00891Methyltransf_21182240.04713.7
TkA02G535930PF05175MTS1192240.01315.8
TkA02G535930PF01728FtsJ1191910.02315.4
TkA02G535930PF13847Methyltransf_311212511.2e-1558.3
TkA02G535930PF02353CMAS1212251.4e-1145.0
TkA02G535930PF13649Methyltransf_251232181.1e-2074.8
TkA02G535930PF08241Methyltransf_111242222.1e-2280.3
TkA02G535930PF08242Methyltransf_121242204.2e-1247.4
TkA02G535930PF29244Methyltransf_ANTKMT1251851.9e-0525.8
TkA02G535930PF20922Anamorsin_N1582220.005917.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZSK1拟南芥sp|Q9ZSK1|GTOMC_ARATH Tocopherol O-methyltransferase, chloroplastic71.000%Swiss-Prot高置信
Q6ZIK0水稻sp|Q6ZIK0|GTOMC_ORYSJ Probable tocopherol O-methyltransferase, chloroplastic77.600%Swiss-Prot高置信

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