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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G531170
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 136933490-136943019 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1884 bp · TkA02G531170|TK1151|cDNA

AGTGAATATTTTAGGTAACTCTCTCTGACTGGCCGATCTAATACAGATTTCAGCTCTGGAAAAATAAGGTTGCCCAAAGTAGAAGTACAAACCGACGGCTACATTCTCCTCCCATTGCGGTTTCTTGTCTCAGTATCAAACTGCCACCGTGATCCAACGGCCGGCGACGATCGCCGCTGGATACGCCGATACGGAAAGCTAACATGGGAACAAATAGTGTCAATTGGCATTCAGTTTTAGACAGCGACCAATGGGTTGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1503 bp · TkA02G531170|TK1151|CDS

ATGCGAATCATTAAGAAAGCTAACATGGGAACAAATAGTGTCAATTGGCATTCAGTTTTAGACAGCGACCAATGGGTTGCCCTCCCAGTATCTGGCCAACGACCATCAGCCCGTTATAAGCATGCTGCAGTTATTGCTGATGAAAAGTTATACATTGTTGGTGGAAGTCGTAATGGGAGATACCTATCTGATGTTCAGGCATTTGATTTGAAGAACTTAACCTGGTCCAAAGTTAAACTAACCACAAAATCAGACACTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

500 aa · TkA02G531170|TK1151|PROTEIN

MRIIKKANMGTNSVNWHSVLDSDQWVALPVSGQRPSARYKHAAVIADEKLYIVGGSRNGRYLSDVQAFDLKNLTWSKVKLTTKSDTETDVFPSVSGHSMVKWGNKLIFLGGHSTDISDNVTVRFIDLESHLCGKMETTGKVPEARGGQSVSLVGSKLIMFGGEDKKRQLMNDVHVLDLNTFTWTVLETIQTPPSPRFDHTAAVHANRYLLIFGGCSHSIFFNDLHVLDLETLEWSNPQIQGDLVSPRAGHAAVSIDKNWF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G531170
TK1151 IDTkA02G531170
OH-1004 IDLXL04_012905
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.200 / OH-1004 96.498
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G531170
位置Chr02:136933490-136943019 (-)
描述Similar to ACBP4: Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05420 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins ACBP4 and ACBP5 are subcellularly localized to the cytosol and ACBP4 depletion affects membrane lipid composition.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9392-7
At5g27630 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0835600 以高亲和力结合中链和长链酰基辅酶 A 酯。
The rice acyl-CoA-binding protein gene family: phylogeny, expression and functional analysis.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03546.x
Subcellular localization of rice acyl-CoA-binding proteins (ACBPs) indicates that OsACBP6::GFP is targeted to the peroxisomes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12809
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012905 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0000062 fatty-acyl-CoA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05420
ath:AT5G27630
ddi:DDB_G0268860
dosa:Os03g0835600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.468
排名 1 · TkA02G531170 · TK1151
细胞核0.259
排名 2 · TkA02G531170 · TK1151
高尔基体0.139
排名 3 · TkA02G531170 · TK1151
细胞膜0.110
排名 4 · TkA02G531170 · TK1151
过氧化物酶体0.094
排名 5 · TkA02G531170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25852DUF6242_C11-115 aa
PF13415Beta-prop_FBX4216-150 aa
PF13418Beta-prop_TYW416-185 aa
PF13964Beta-prop_Calicin18-178 aa
PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC720-82 aa
PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR120-148 aa
PF04849HAP1_N21-51 aa
PF13854Kelch_HCF22-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G531170PF25852DUF6242_C111151.1e-0732.5
TkA02G531170PF13415Beta-prop_FBX42161505.4e-64216.3
TkA02G531170PF13418Beta-prop_TYW4161857.5e-1762.8
TkA02G531170PF13964Beta-prop_Calicin181781.7e-0628.0
TkA02G531170PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC720821.8e-71240.7
TkA02G531170PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR1201483e-40139.0
TkA02G531170PF04849HAP1_N21510.03214.1
TkA02G531170PF13854Kelch_HCF222145.8e-33115.3
TkA02G531170PF25210Kelch_FKB9535904.9e-1659.9
TkA02G531170PF24996NANM351191.3e-1454.6
TkA02G531170PF01344Kelch_137781.3e-30105.2
TkA02G531170PF07646Kelch_238791.9e-2588.2
TkA02G531170PF13854Kelch_HCF892645.8e-33115.3
TkA02G531170PF13415Beta-prop_FBX42922175.4e-64216.3
TkA02G531170PF01344Kelch_1951141.3e-30105.2
TkA02G531170PF07646Kelch_2951241.9e-2588.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MA55拟南芥sp|Q9MA55|ACBP4_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 443.400%Swiss-Prot中等置信
Q8RWD9拟南芥sp|Q8RWD9|ACBP5_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 544.400%Swiss-Prot中等置信
Q75LJ4水稻sp|Q75LJ4|ACBP6_ORYSJ Acyl-CoA-binding domain-containing protein 636.500%Swiss-Prot中等置信

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