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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G531140
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 136919769-136922060 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1642 bp · TkA02G531140|TK1151|cDNA

CTTATATACCGTATACGAGTGTTGCATCTCTCTTTGTGTTTTCTCGATTTCCGTGTCAAGCAAGCATCCATTCATCAACTGTGGTTTCTTAACCCACGGGCAATCCATATATCTTCTTTCTCTCTCATCATGTGGACTGTTCCTGTAGTTCACTTGCTTCACCTACAATCCTAATTCTCATGTCTTCTTCTTAATCCTTTTACCAAATTTTCTACTTTTAATTCAGAAAGAGTGAACCCACAAGGTTAATTTCGGTTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1203 bp · TkA02G531140|TK1151|CDS

ATGAGTCATGAATTGACCGTGGCACCACCAGTACAGCCGGCGGCGCCACCACCATCATCGCCACCGCCGACGTCTCTTGCACCTGGATTTCGGTTTCACCCAACCGATGAGGAACTTGTGCGGTATTATCTGAGGCGTAAAGCTTGTGGGAAGCCGTTTCGATTCGAAGCTGTATCAGAAATCGACGTCTACAAATCCGAGCCATGGGAGCTTGCAGATTATTCATCCCTAAAGACGCGAGACCTCGAATGGTACTTCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

400 aa · TkA02G531140|TK1151|PROTEIN

MSHELTVAPPVQPAAPPPSSPPPTSLAPGFRFHPTDEELVRYYLRRKACGKPFRFEAVSEIDVYKSEPWELADYSSLKTRDLEWYFFSPVDRKYGNGSRLNRATGRGYWKATGKDRSVRHKSETIGMKKTLVFHSGRAPDGKRTNWVMHEYRLVDQELVRAGVVQDAFVLCRIFQKSGLGPPNGDRYAPFIEEEWVDDDTAVFVPGGETEDDLTPGDETLPQGNDIVQENPGNMICSQSEAMVNHQTIPFVCKRERSDDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G531140
TK1151 IDTkA02G531140
OH-1004 IDLXL04_012908
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G531140
位置Chr02:136919769-136922060 (+)
描述Similar to NAC052: NAC domain containing protein 52
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g10490 结合靶基因启动子中5′-(C/T)A(C/A)G-3′基序的转录抑制因子。
Two novel NAC transcription factors regulate gene expression and flowering time by associating with the histone demethylase JMJ14.2015 · DOI: 10.1093/nar/gku1382
C-terminal domains of a histone demethylase interact with a pair of transcription factors and mediate specific chromatin association.2015 · DOI: 10.1038/celldisc.2015.3
At3g10480 结合靶基因启动子中5′-(C/T)A(C/A)G-3′基序的转录抑制因子。
Two novel NAC transcription factors regulate gene expression and flowering time by associating with the histone demethylase JMJ14.2015 · DOI: 10.1093/nar/gku1382
C-terminal domains of a histone demethylase interact with a pair of transcription factors and mediate specific chromatin association.2015 · DOI: 10.1038/celldisc.2015.3
At3g10500 通过受调控的膜内蛋白水解（RIP）活化的转录激活因子。
A NAC transcription factor NTL4 promotes reactive oxygen species production during drought-induced leaf senescence in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04932.x
The Arabidopsis NAC transcription factor NTL4 participates in a positive feedback loop that induces programmed cell death under heat stress conditions.2014 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2014.07.003
At5g04410 通过受调控的膜内蛋白水解（RIP）活化的转录激活因子（根据相似性）。 暂无已核实直接文献
At1g32870 通过受调控的膜内蛋白水解（RIP）活化的转录激活因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012908 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009962 regulation of flavonoid biosynthetic process 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010267 ta-siRNA processing 生物过程
GO:0016441 post-transcriptional gene silencing 生物过程
GO:0045814 negative regulation of gene expression, epigenetic 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G10480
ath:AT3G10490
ath:AT5G04410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.955
排名 1 · TkA02G531140 · TK1151
细胞质0.102
排名 2 · TkA02G531140 · TK1151
细胞膜0.038
排名 3 · TkA02G531140 · TK1151
内质网0.028
排名 4 · TkA02G531140 · TK1151
质体0.015
排名 5 · TkA02G531140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365NAM28-153 aa
PF02365NAM225-256 aa
PF27528Znf-C2H2_ZNF142236-246 aa
PF27528Znf-C2H2_ZNF142249-257 aa
PF16888YwqH-like272-308 aa
PF16888YwqH-like348-390 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G531140PF02365NAM281531.8e-47161.5
TkA02G531140PF02365NAM2252561.8e-47161.5
TkA02G531140PF27528Znf-C2H2_ZNF1422362460.3411.6
TkA02G531140PF27528Znf-C2H2_ZNF1422492570.3411.6
TkA02G531140PF16888YwqH-like2723080.3212.0
TkA02G531140PF16888YwqH-like3483900.3212.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SQY0拟南芥sp|Q9SQY0|NAC52_ARATH NAC domain containing protein 5240.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SQX9拟南芥sp|Q9SQX9|NAC50_ARATH NAC domain containing protein 5041.800%Swiss-Prot中等置信
Q949N0拟南芥sp|Q949N0|NAC53_ARATH NAC domain-containing protein 5363.200%Swiss-Prot中等置信
Q84K00拟南芥sp|Q84K00|NAC78_ARATH NAC domain-containing protein 7858.000%Swiss-Prot中等置信
F4IED2拟南芥sp|F4IED2|NAC13_ARATH NAC domain-containing protein 1363.300%Swiss-Prot低置信

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