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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G530730
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 136843076-136846586 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2504 bp · TkA02G530730|TK1151|cDNA

GCACAGCATAAAACCAGACAAACCATCCTGACACTTTCTCCATTTTTACGCAACGCTAGGCTTGGTTGGTTTGGCTGCGTCTTGGGATCTTCCGAAATCTGCCAGCCAATCCATCCCTAAAAAGGGGAAGGATTGAATCTTTAAGAATCTATCTTGAATCTAAGATAGAGCTAGATCTCTGTTTATCATCTATATGCTGGCAGGTTTTATAGATTCGTGACCAAATAAACCAATATCGGAGATATCGTTGATAACCGAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1977 bp · TkA02G530730|TK1151|CDS

ATGGGTTTTGTCGCAGAGTCAAATCAGGGGGCTATTGGAAATGGAGGGAGGTCAGGGTTTAGAAGTTTGGTGAGGAGAAAAAGGGTCGATTCGAAATATACAAAGTCATCAGACCCAGGCCATCATCAATTAGCTAAGGAATTATCGATTGCGCATCTTATCGCCATAGGTGTTGGTTCGACAATCGGAGCGGGGGTTTACATCCTTGTGGGTACAGTTGCTAGAGAACATTCTGGCCCTGCTCTCGCGTTTTCCTTCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

658 aa · TkA02G530730|TK1151|PROTEIN

MGFVAESNQGAIGNGGRSGFRSLVRRKRVDSKYTKSSDPGHHQLAKELSIAHLIAIGVGSTIGAGVYILVGTVAREHSGPALAFSFLIAGIAAALSAFCYAELASRCPSAGSAYHYSYICLGEGLAWIIGWALILEYTIGGSAVARGISPNLALLFGGPDSLPFFLARHHIPALGIVVDPCAAFLVFIVTGLLCIGIKESTFVQSVVTTANICAMIFVIIAGGYLGFKSGWIGYKLPVGYFPFGVDGMLAGASTVFFSYI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G530730
TK1151 IDTkA02G530730
OH-1004 IDLXL04_012917
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.960 / OH-1004 87.933
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G530730
位置Chr02:136843076-136846586 (+)
描述Similar to CAT2: Cationic amino acid transporter 2, vacuolar
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g58030 参与阳离子氨基酸运输的渗透酶。 暂无已核实直接文献
At5g36940 渗透酶参与阳离子中性或酸性氨基酸的转运。
Molecular and functional characterization of a family of amino acid transporters from Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.045278
At3g03720 参与阳离子氨基酸运输的渗透酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012917 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006865 amino acid transport 生物过程
GO:0015807 L-amino acid transport 生物过程
GO:0015819 lysine transport 生物过程
GO:0015822 ornithine transport 生物过程
GO:0032006 regulation of TOR signaling 生物过程
GO:0080144 intracellular amino acid homeostasis 生物过程
GO:0089718 amino acid import across plasma membrane 生物过程
GO:0097638 L-arginine import across plasma membrane 生物过程
GO:0097639 L-lysine import across plasma membrane 生物过程
GO:1903352 L-ornithine transmembrane transport 生物过程
GO:1903401 L-lysine transmembrane transport 生物过程
GO:1903810 L-histidine import across plasma membrane 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G58030
ath:AT3G03720
ath:AT5G36940
mmu:11987
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.344
排名 1 · TkA02G530730 · TK1151
溶酶体／液泡0.323
排名 2 · TkA02G530730 · TK1151
内质网0.157
排名 3 · TkA02G530730 · TK1151
细胞质0.139
排名 4 · TkA02G530730 · TK1151
高尔基体0.111
排名 5 · TkA02G530730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25587Rv2743c34-104 aa
PF13906AA_permease_C47-72 aa
PF13520AA_permease_251-430 aa
PF00324AA_permease52-424 aa
PF13906AA_permease_C186-186 aa
PF13906AA_permease_C288-298 aa
PF25587Rv2743c325-339 aa
PF25587Rv2743c375-436 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G530730PF25587Rv2743c341045.17.4
TkA02G530730PF13906AA_permease_C47723.3e-1969.4
TkA02G530730PF13520AA_permease_2514305e-51174.7
TkA02G530730PF00324AA_permease524241.3e-39137.0
TkA02G530730PF13906AA_permease_C1861863.3e-1969.4
TkA02G530730PF13906AA_permease_C2882983.3e-1969.4
TkA02G530730PF25587Rv2743c3253395.17.4
TkA02G530730PF25587Rv2743c3754365.17.4
TkA02G530730PF25587Rv2743c5065575.17.4
TkA02G530730PF13520AA_permease_25155595e-51174.7
TkA02G530730PF00324AA_permease5336071.3e-39137.0
TkA02G530730PF13906AA_permease_C5345523.3e-1969.4
TkA02G530730PF13906AA_permease_C5776273.3e-1969.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ASS7拟南芥sp|Q9ASS7|CAAT2_ARATH Cationic amino acid transporter 2, vacuolar68.500%Swiss-Prot高置信
Q8GYB4拟南芥sp|Q8GYB4|CAAT3_ARATH Cationic amino acid transporter 3, mitochondrial67.500%Swiss-Prot高置信
Q8W4K3拟南芥sp|Q8W4K3|CAAT4_ARATH Cationic amino acid transporter 4, vacuolar62.800%Swiss-Prot高置信

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