TkA02G527110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G527110

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 135931948-135934194 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1539 bp · TkA02G527110|TK1151|cDNA

ATGGGGAATTTATGTGGATTCTTTGGATCAATATGGCATTCATTATGGTGGTCCAAATCACCAAATTATATCCAATACGAAAAGCAAAGAGCAAGAAACCAACACCATGATGGACTCAAACATAATAAAGTTACCAAACCTGTCCAAAATACCCCTCCACATATAGTAATCATACCCAATGAAGACCCTAAATTAGCAAGCCAACAAACCAAATCAACACAGAAAAATGCAACAAGTAATCCACACCATAAGAGACAGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1539 bp · TkA02G527110|TK1151|CDS

ATGGGGAATTTATGTGGATTCTTTGGATCAATATGGCATTCATTATGGTGGTCCAAATCACCAAATTATATCCAATACGAAAAGCAAAGAGCAAGAAACCAACACCATGATGGACTCAAACATAATAAAGTTACCAAACCTGTCCAAAATACCCCTCCACATATAGTAATCATACCCAATGAAGACCCTAAATTAGCAAGCCAACAAACCAAATCAACACAGAAAAATGCAACAAGTAATCCACACCATAAGAGACAGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

512 aa · TkA02G527110|TK1151|PROTEIN

MGNLCGFFGSIWHSLWWSKSPNYIQYEKQRARNQHHDGLKHNKVTKPVQNTPPHIVIIPNEDPKLASQQTKSTQKNATSNPHHKRQSTAGLLVDQVLKKNNGNLRDHYAVGSKLGHGQFGTTSICIEKKTGKQFACKSISKRKLVTDDELEDVRREVEVMHHLSGNPNVVSIEGAYEDGYEVHLDEDSVLKAIDFGLSVFFKPGEIFTDLVGSPYYVAPEVLQRFYGPEIDIWSAGVILYVLLSGPTFLWRETEDDVFRE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G527110`
TK1151 ID	TkA02G527110
OH-1004 ID	LXL04_012950
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	88.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G527110

位置 Chr02:135931948-135934194 (+)

描述 Similar to CPK10: Calcium-dependent protein kinase 10

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g38910`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os07g0161600`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os03g0789000`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os04g0584600`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。	暂无已核实直接文献
`Os02g0685900`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012950 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:1900055 regulation of leaf senescence 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G10660

ath:AT5G04870

dosa:Os03g0788500

dosa:Os03g0789000

dosa:Os12g0486600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.381

排名 1 · TkA02G527110 · TK1151

细胞质0.353

排名 2 · TkA02G527110 · TK1151

细胞核0.189

排名 3 · TkA02G527110 · TK1151

高尔基体0.110

排名 4 · TkA02G527110 · TK1151

内质网0.103

排名 5 · TkA02G527110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14788EF-hand_1095-110 aa

PF00069Pkinase108-184 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr111-178 aa

PF04558tRNA_synt_1c_R1128-150 aa

PF00069Pkinase184-307 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr184-259 aa

PF06474LPAM_MltD314-331 aa

PF20742DUF5580_M335-413 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G527110	`PF14788`	EF-hand_10	95	110	0.052	14.3
TkA02G527110	`PF00069`	Pkinase	108	184	3.7e-43	148.5
TkA02G527110	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	111	178	1e-07	32.2
TkA02G527110	`PF04558`	tRNA_synt_1c_R1	128	150	0.23	12.1
TkA02G527110	`PF00069`	Pkinase	184	307	3.7e-43	148.5
TkA02G527110	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	184	259	1e-07	32.2
TkA02G527110	`PF06474`	LPAM_MltD	314	331	0.29	12.0
TkA02G527110	`PF20742`	DUF5580_M	335	413	0.00034	21.3
TkA02G527110	`PF13833`	EF-hand_8	341	382	1.4e-16	60.7
TkA02G527110	`PF12763`	EH	344	375	1.4e-08	35.3
TkA02G527110	`PF10591`	SPARC_Ca_bdg	345	413	0.00012	23.0
TkA02G527110	`PF12763`	EH	347	414	1.4e-08	35.3
TkA02G527110	`PF25825`	SAPC2_N	347	414	0.00012	22.6
TkA02G527110	`PF24082`	SPEF2_C	348	374	0.054	14.0
TkA02G527110	`PF21008`	AIF-1	349	416	6.1e-06	27.3
TkA02G527110	`PF25578`	EF-hand_STIM1	350	378	0.098	13.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZV15`	拟南芥	sp\|Q9ZV15\|CDPKK_ARATH Calcium-dependent protein kinase 20	55.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XIM0`	水稻	sp\|Q7XIM0\|CDPKH_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 17	50.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q852N6`	水稻	sp\|Q852N6\|CDPKB_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 11	56.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FXQ3`	水稻	sp\|Q9FXQ3\|CDPKD_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 13	55.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q0DYK7`	水稻	sp\|Q0DYK7\|CDPK5_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 5	55.900%	Swiss-Prot	高置信

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