TkA02G525650 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G525650

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 135574826-135576515 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1592 bp · TkA02G525650|TK1151|cDNA

ATAACGATGAGTGCACCATGGATTTCTATTTCTTTATTCATCTTAACAATCATCATCGTAAATTACTACTCAGCCACAGCCCAACCCCCTTTCGATTACCCAAATGCGAATCTTTCCACAACATGGACCAACACCGAATCTCTACCTCACTCCGTCAATTTCACCGATGGCTCAGTGGTCCGAGCCATCCTCCTTAGAGGATCATTCGGACCCAAATTCGCATGTGGATTCTACTGTAACGGAACCTGCACATCTTACCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1419 bp · TkA02G525650|TK1151|CDS

ATGAGTGCACCATGGATTTCTATTTCTTTATTCATCTTAACAATCATCATCGTAAATTACTACTCAGCCACAGCCCAACCCCCTTTCGATTACCCAAATGCGAATCTTTCCACAACATGGACCAACACCGAATCTCTACCTCACTCCGTCAATTTCACCGATGGCTCAGTGGTCCGAGCCATCCTCCTTAGAGGATCATTCGGACCCAAATTCGCATGTGGATTCTACTGTAACGGAACCTGCACATCTTACCTCTTCGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

472 aa · TkA02G525650|TK1151|PROTEIN

MSAPWISISLFILTIIIVNYYSATAQPPFDYPNANLSTTWTNTESLPHSVNFTDGSVVRAILLRGSFGPKFACGFYCNGTCTSYLFAVFIVQTNSGGGIVQPSFGFPQVVWSANRDSPVSYGAILNLTATGDLVLQDANGSAIWSTNTSGKSVVGMNLTDNGNLQLFDVNSSVLWQSFDNPTDCLVPGQNLFQGQQLIPSYSSTNWTAQKDLFSLRVTEKGLFAYVGSNPPQEYYSMSAFRNDTDKGRRYVRYLNGSLSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G525650`
TK1151 ID	TkA02G525650
OH-1004 ID	LXL04_012974
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	96.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 87.500 / OH-1004 46.825 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G525650

位置 Chr02:135574826-135576515 (+)

描述 Similar to SD25: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g24080`	G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。	暂无已核实直接文献
`At5g60900`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RLK1。	暂无已核实直接文献
`At4g21370`	SRK 的截短失活形式，当活性时为自交不亲和性的雌性特异性决定因子。	暂无已核实直接文献
`UniProt: P0DH86`	自交不亲和性的雌性特异性决定因子。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012974 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0048544 recognition of pollen 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能

GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G34300

ath:AT2G19130

ath:AT4G32300

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.413

排名 1 · TkA02G525650 · TK1151

细胞膜0.312

排名 2 · TkA02G525650 · TK1151

内质网0.121

排名 3 · TkA02G525650 · TK1151

细胞质0.079

排名 4 · TkA02G525650 · TK1151

溶酶体／液泡0.039

排名 5 · TkA02G525650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08276PAN_278-84 aa

PF01453B_lectin109-193 aa

PF01453B_lectin277-297 aa

PF00024PAN_1331-346 aa

PF08276PAN_2332-343 aa

PF08276PAN_2369-424 aa

PF00024PAN_1392-426 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G525650	`PF08276`	PAN_2	78	84	0.00051	20.8
TkA02G525650	`PF01453`	B_lectin	109	193	1e-19	71.7
TkA02G525650	`PF01453`	B_lectin	277	297	1e-19	71.7
TkA02G525650	`PF00024`	PAN_1	331	346	0.033	14.8
TkA02G525650	`PF08276`	PAN_2	332	343	0.00051	20.8
TkA02G525650	`PF08276`	PAN_2	369	424	0.00051	20.8
TkA02G525650	`PF00024`	PAN_1	392	426	0.033	14.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FLV4`	拟南芥	sp\|Q9FLV4\|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080	25.700%	Swiss-Prot	低置信
`Q39202`	拟南芥	sp\|Q39202\|RLK1_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase RLK1	24.400%	Swiss-Prot	低置信
`P0DH87`	拟南芥	sp\|P0DH87\|PSRK_ARATH Putative inactive G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SRK	22.600%	Swiss-Prot	低置信
`P0DH86`	拟南芥	sp\|P0DH86\|SRK_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SRK	22.600%	Swiss-Prot	低置信

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