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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G510750
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 131123447-131127683 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3302 bp · TkA02G510750|TK1151|cDNA

AATTAGCATCCTAAAATAACATTTCCCATTTGTCTTTTCTCAAATCTGAAGAACACTACCCTACAACCGGACCCCATTGATAATTATGTTGATTAAACACCTCGTCACAGTCACTTCTTCTTCTTCTTGGTCGTCTTCTTCTTCTTCCCTTTAACATCGGTAGCAGCTTTCCATTAAATGCTTCACCATTGTCTTCTTCGGTGCTTCCAACCACCCTCCATAACTTCCACCTCTTTTCTTCCTAATTATTTACAGCAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2322 bp · TkA02G510750|TK1151|CDS

ATGGGGTGGTACTGCTCGAATTTGGTGTTATTCATGCTGTTTCTTTCATGGGGTTTCTTTTTCTCAAGCACACATCAATTACAATCAACTCAAACTCAGGTTCTTCTCCAACTCAGGAAACATTTGGAGTACCCATTGCAATTAAGCAATTGGGAGAATTACAATGGTGATTTTTGTAATTTGGTTTCAAATCCACAAGTTAGCATCAAATGTGAAGGTAATTCGATCTCCGAGCTCAAGATCATGGGAGATAAGCTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

773 aa · TkA02G510750|TK1151|PROTEIN

MGWYCSNLVLFMLFLSWGFFFSSTHQLQSTQTQVLLQLRKHLEYPLQLSNWENYNGDFCNLVSNPQVSIKCEGNSISELKIMGDKLKKVGDFHGYAVQNRTLSKTFSIDSLVVTLARLNTLRVLSLVSLGIWGPFPEKIHRLSSLELLDMSSNFLFGSIPNEISRLVKLRTLTLDGNFFNESIPNWFDSLSNLTILSLKNNKFNGQFPSSIRKITTLAAIALSHNNLNGKLPDLTTLTSLNLLDLRDNHFDSELPFLPKG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G510750
TK1151 IDTkA02G510750
OH-1004 IDLXL04_013223
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G510750
位置Chr02:131123447-131127683 (+)
描述Similar to At3g03770: Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g03770 可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At3g03770。 暂无已核实直接文献
At1g14390 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g14390。 暂无已核实直接文献
At2g02780 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g02780。 暂无已核实直接文献
At5g61350 可能的受体样蛋白激酶 At5g61350。 暂无已核实直接文献
At2g21480 可能的受体样蛋白激酶At2g21480。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013223 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019199 transmembrane receptor protein kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14390
ath:AT2G02780
ath:AT3G03770
ath:AT5G07280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.827
排名 1 · TkA02G510750 · TK1151
内质网0.077
排名 2 · TkA02G510750 · TK1151
细胞质0.066
排名 3 · TkA02G510750 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA02G510750 · TK1151
溶酶体／液泡0.039
排名 5 · TkA02G510750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF248388xMP10-54 aa
PF08263LRRNT_230-60 aa
PF24141LRR_ComC87-172 aa
PF25013LRR_Zer-1102-152 aa
PF23598LRR_14114-221 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL21116-150 aa
PF13855LRR_8120-177 aa
PF00560LRR_1121-141 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G510750PF248388xMP10540.2212.1
TkA02G510750PF08263LRRNT_230600.01116.7
TkA02G510750PF24141LRR_ComC871727.7e-0523.2
TkA02G510750PF25013LRR_Zer-11021520.01915.8
TkA02G510750PF23598LRR_141142211.6e-1144.3
TkA02G510750PF25019LRR_R13L1-DRL211161500.01116.3
TkA02G510750PF13855LRR_81201777e-1658.5
TkA02G510750PF00560LRR_11211418.6e-1655.4
TkA02G510750PF12799LRR_41211591e-0526.3
TkA02G510750PF23211LRR_LRWD11422040.1812.2
TkA02G510750PF00560LRR_11441668.6e-1655.4
TkA02G510750PF12799LRR_41441841e-0526.3
TkA02G510750PF00560LRR_11681908.6e-1655.4
TkA02G510750PF12799LRR_41682021e-0526.3
TkA02G510750PF25019LRR_R13L1-DRL211682230.01116.3
TkA02G510750PF13855LRR_81842277e-1658.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LFN2拟南芥sp|Q8LFN2|Y3037_ARATH Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g0377047.200%Swiss-Prot中等置信
Q9M9S4拟南芥sp|Q9M9S4|Y1143_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1439035.100%Swiss-Prot中等置信
C0LGJ9拟南芥sp|C0LGJ9|Y2278_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g0278035.600%Swiss-Prot低置信
Q9FLJ8拟南芥sp|Q9FLJ8|Y5613_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g6135033.800%Swiss-Prot低置信
Q9SJT0拟南芥sp|Q9SJT0|Y2214_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g2148034.400%Swiss-Prot低置信

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