TkA02G508100 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G508100

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 130397492-130400309 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1781 bp · TkA02G508100|TK1151|cDNA

TTATCTAGAGAGAGAAACATAGAAATAGATAAAGAATTTGAGGGGATAGGTGGGCGGGAGGGGGAGAGAGAGAGAGACAAACAGAAAGGGGAAATGGGAAGAGCTTTTGTGTATGTGATACTTGGTGGAGGCGTCGCTGCCGGTTATGCGGCTCTTGAATTCACCAAGAAAGGTGTCTCTCATGGTGAACTCTGCATCATATCCGAAGAACCTGTGGCTCCTTATGAGAGACCTGCACTCAGCAAAGGCTTTCTACTTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1545 bp · TkA02G508100|TK1151|CDS

TTATCTAGAGAGAGAAACATAGAAATAGATAAAGAATTTGAGGGGATAGGTGGGCGGGAGGGGGAGAGAGAGAGAGACAAACAGAAAGGGGAAATGGGAAGAGCTTTTGTGTATGTGATACTTGGTGGAGGCGTCGCTGCCGGTTATGCGGCTCTTGAATTCACCAAGAAAGGTGTCTCTCATGGTGAACTCTGCATCATATCCGAAGAACCTGTGGCTCCTTATGAGAGACCTGCACTCAGCAAAGGCTTTCTACTTCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

514 aa · TkA02G508100|TK1151|PROTEIN

LSRERNIEIDKEFEGIGGREGERERDKQKGEMGRAFVYVILGGGVAAGYAALEFTKKGVSHGELCIISEEPVAPYERPALSKGFLLPEAPARLPAFHTCVGANEERLTPKWYKEHGIELILGTRVKSADVRRKTLLTATGETISYKYLIIATGARALKLEEFGVSGSDAENVCYLRDVADATRLVDVMQASTGGNAVVIGGGYIGMECAASLVINKINVSMVFPEPHCMGRLFTPKIASYYEDFYKSKGINFVKGTVLSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G508100`
TK1151 ID	TkA02G508100
OH-1004 ID	LXL04_018503
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	72.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 92.802 / OH-1004 99.130 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G508100

位置 Chr02:130397492-130400309 (-)

描述 Similar to MDAR4: Monodehydroascorbate reductase 4, peroxisomal

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g27820`	催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，并在此过程中氧化 NADH。	Arabidopsis peroxisomes possess functionally redundant membrane and matrix isoforms of monodehydroascorbate reductase.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02503.x MONODEHYROASCORBATE REDUCTASE4 is required for seed storage oil hydrolysis and postgerminative growth in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.043992

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0707100`	催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。	暂无已核实直接文献
`Os02g0707000`	催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。	暂无已核实直接文献
`Os09g0567300`	催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018503 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0016656 monodehydroascorbate reductase (NADH) activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G27820

dosa:Os02g0707000

dosa:Os02g0707100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.367

排名 1 · TkA02G508100 · TK1151

过氧化物酶体0.261

排名 2 · TkA02G508100 · TK1151

线粒体0.247

排名 3 · TkA02G508100 · TK1151

细胞核0.149

排名 4 · TkA02G508100 · TK1151

质体0.088

排名 5 · TkA02G508100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07992Pyr_redox_238-352 aa

PF13738Pyr_redox_338-59 aa

PF00070Pyr_redox39-59 aa

PF01266DAO39-59 aa

PF04820Trp_halogenase39-58 aa

PF03486HI0933_like39-58 aa

PF00890FAD_binding_239-59 aa

PF29717AF_1314_N39-57 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G508100	`PF07992`	Pyr_redox_2	38	352	2.8e-57	195.1
TkA02G508100	`PF13738`	Pyr_redox_3	38	59	0.00085	19.4
TkA02G508100	`PF00070`	Pyr_redox	39	59	9.1e-17	62.1
TkA02G508100	`PF01266`	DAO	39	59	0.0027	18.0
TkA02G508100	`PF04820`	Trp_halogenase	39	58	0.015	14.9
TkA02G508100	`PF03486`	HI0933_like	39	58	0.076	13.2
TkA02G508100	`PF00890`	FAD_binding_2	39	59	0.079	12.8
TkA02G508100	`PF29717`	AF_1314_N	39	57	0.31	12.2
TkA02G508100	`PF01134`	GIDA	39	59	6.7	6.4
TkA02G508100	`PF03486`	HI0933_like	111	157	0.076	13.2
TkA02G508100	`PF00070`	Pyr_redox	112	133	9.1e-17	62.1
TkA02G508100	`PF01266`	DAO	113	157	0.0027	18.0
TkA02G508100	`PF01593`	Amino_oxidase	113	162	0.15	12.0
TkA02G508100	`PF04820`	Trp_halogenase	115	162	0.015	14.9
TkA02G508100	`PF01134`	GIDA	130	154	6.7	6.4
TkA02G508100	`PF13738`	Pyr_redox_3	133	320	0.00085	19.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LK94`	拟南芥	sp\|Q9LK94\|MDAR4_ARATH Monodehydroascorbate reductase 4, peroxisomal	77.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q8S3R2`	水稻	sp\|Q8S3R2\|MDAR2_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 2, peroxisomal	70.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q8S3R1`	水稻	sp\|Q8S3R1\|MDAR1_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 1, peroxisomal	62.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q652L6`	水稻	sp\|Q652L6\|MDAR3_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 3, cytosolic	57.500%	Swiss-Prot	高置信

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