基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G500430
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 128216299-128218829
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1463 bp · TkA02G500430|TK1151|cDNA
TGAAGATGTCAGAGGAGGCATATGGCATTCACTGACCTTCATCATTCCGGTGTCGTTTTAGGCTGTGCATTTACGGTTTTCACCAGCTGTGTCTCCTGTCTATTTTCGGCAACTTTCACTGAAAGGCTTCGCCGGAGACACAGCCAAAGCACATGCCAAAACTAGCATGATCGCCGGAGAAGGAGTCAGCAACATTCGAACGATCGCAGCCTTTAATGCCCAAGACAAAATCCTCTCCTTATTCGCCAACGAACTTCGTG...
CDS
下载 CDS FASTA1155 bp · TkA02G500430|TK1151|CDS
ATGATCGCCGGAGAAGGAGTCAGCAACATTCGAACGATCGCAGCCTTTAATGCCCAAGACAAAATCCTCTCCTTATTCGCCAACGAACTTCGTGTCCCCCAGCAGCAAAGCCTTCGCCGAAGTCAAATCTCCGGACTCCTATTCGGCGTCTCCCAACTCGCTCTCTTCGCCTCCGAAGCCCTAATCCTCTGGTACGGCGCACATCTCGTTAAAAACGGTGTCTCCACATTCTCCAAAGTCATCAAAGTATTCGTCGTTTT...
384 aa · TkA02G500430|TK1151|PROTEIN
MIAGEGVSNIRTIAAFNAQDKILSLFANELRVPQQQSLRRSQISGLLFGVSQLALFASEALILWYGAHLVKNGVSTFSKVIKVFVVLVITANSVAETVSLAPEIIRGGEAIGSVFSVLDRSTRIDPDDPDAETVETIRGEIELRHVDFSYPSRPDVIVFKDLSLRIRSGQSQALVGASGCGKSSIIALIERFYDPTGGKVMIDGKDIRRLNLRSLRAKIGLVQQEPALFAASIMENIAYGKDGATEAEVIEAARAANVHV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G500430 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G500430 |
| OH-1004 ID | LXL04_013358 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 30.745覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。
细胞质0.310
溶酶体/液泡0.196
过氧化物酶体0.175
细胞膜0.145
线粒体0.101
LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00664ABC_membrane5-90 aaPF03193RsgA_GTPase146-189 aaPF00005ABC_tran160-308 aaPF13175AAA_15160-210 aaPF20703nSTAND1161-186 aaPF13555AAA_29164-188 aaPF13191AAA_16165-326 aaPF13604AAA_30169-201 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G500430 | PF00664 | ABC_membrane | 5 | 90 | 1.3e-14 | 55.3 |
| TkA02G500430 | PF03193 | RsgA_GTPase | 146 | 189 | 0.034 | 14.7 |
| TkA02G500430 | PF00005 | ABC_tran | 160 | 308 | 3e-33 | 116.1 |
| TkA02G500430 | PF13175 | AAA_15 | 160 | 210 | 0.044 | 14.0 |
| TkA02G500430 | PF20703 | nSTAND1 | 161 | 186 | 0.038 | 14.4 |
| TkA02G500430 | PF13555 | AAA_29 | 164 | 188 | 0.059 | 13.9 |
| TkA02G500430 | PF13191 | AAA_16 | 165 | 326 | 0.0091 | 17.2 |
| TkA02G500430 | PF13604 | AAA_30 | 169 | 201 | 0.066 | 13.7 |
| TkA02G500430 | PF02463 | SMC_N | 170 | 189 | 2e-06 | 28.1 |
| TkA02G500430 | PF13401 | AAA_22 | 170 | 308 | 0.075 | 14.1 |
| TkA02G500430 | PF13304 | AAA_21 | 173 | 192 | 0.011 | 16.4 |
| TkA02G500430 | PF06414 | Zeta_toxin | 174 | 210 | 0.03 | 14.5 |
| TkA02G500430 | PF00004 | AAA | 174 | 331 | 0.038 | 15.1 |
| TkA02G500430 | PF02463 | SMC_N | 198 | 347 | 2e-06 | 28.1 |
| TkA02G500430 | PF09818 | ABC_ATPase | 247 | 310 | 0.015 | 15.1 |
| TkA02G500430 | PF13304 | AAA_21 | 279 | 327 | 0.011 | 16.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LJX0 | 拟南芥 | sp|Q9LJX0|AB19B_ARATH ABC transporter B family member 19 | 84.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9ZR72 | 拟南芥 | sp|Q9ZR72|AB1B_ARATH ABC transporter B family member 1 | 58.500% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SGY1 | 拟南芥 | sp|Q9SGY1|AB10B_ARATH ABC transporter B family member 10 | 58.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8LPK2 | 拟南芥 | sp|Q8LPK2|AB2B_ARATH ABC transporter B family member 2 | 58.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9C7F2 | 拟南芥 | sp|Q9C7F2|AB14B_ARATH ABC transporter B family member 14 | 57.100% | Swiss-Prot | 高置信 |