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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G495640
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 126908216-126910118 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1718 bp · TkA02G495640|TK1151|cDNA

CGACAAAAAGCGAATGTAAGCTACAGAAACGTTGTCTGAAAAATCCAAAGAAATATAGAATGGAGGCTAGGGCTTCCCAGTCGGTGAAGGAACTCCGTTATCCGATGACCCCTTCAATAAAACAGCTAACCGATTTCACCATTGAAGATGATCGTCGCTTTGGTAATTCGGTGCAAAAAACATGGGTCGTGAGTGTTTCCTAGCCTGCTAAATCATCGATTCTAGATTGTTGGTTTTAGGTTTTTGAAAAAGATGGTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1326 bp · TkA02G495640|TK1151|CDS

ATGGTCGTAGGGAGCTGCGACGCTTCTGAATCCACTCCAACAAATTCACCTGCTGAATCTTCAACAATTGGTTCAATTTCTTCTCATGATGAAGACGAAGGGAGGCAATTAAGTTATTTTGGGGGAACCAGTTCGAGAAACACCAGCCCAATCGGCCGAGGACTAGGGTTAAGGAACACCAGCCCATCTAAACAGAAGGTAATCAAGACAAAACCCAGAGGTCTAGACGAAGAAACGATCGCAACATTCCCGAAAACTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

441 aa · TkA02G495640|TK1151|PROTEIN

MVVGSCDASESTPTNSPAESSTIGSISSHDEDEGRQLSYFGGTSSRNTSPIGRGLGLRNTSPSKQKVIKTKPRGLDEETIATFPKTPHPEIHMEDDIWAMLPEDLLNEILARVPPFMIFRLRSVCKRWNSILQDNSFLKFHSQVPSHGPCLLTFWKNSQTPQCSVFSLPLKQWYKIPFTFLPQWAFWLVGSSGGLVCFSGLDNLSFKTLICNPLTQTFRTLPSMHYNQQRQLILVVDRKKRCFKVIAASDIYGDRSLPTE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G495640
TK1151 IDTkA02G495640
OH-1004 IDLXL04_024206
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.703 / OH-1004 92.890
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G495640
位置Chr02:126908216-126910118 (+)
描述Similar to At5g15710: F-box/kelch-repeat protein At5g15710
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g15710 F-box/kelch-repeat 蛋白 At5g15710。 暂无已核实直接文献
At1g27340 仅F-box蛋白6。 暂无已核实直接文献
At5g49610 F-box 蛋白 At5g49610。 暂无已核实直接文献
At4g10190 推定的F-box蛋白At4g10190。 暂无已核实直接文献
At3g25460 推定的 F-box 蛋白 At3g25460。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024206 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0009933 meristem structural organization 生物过程
GO:0010074 maintenance of meristem identity 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010928 regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27340
ath:AT1G30950
ath:AT3G61590
ath:AT5G15710
osa:107277138
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.562
排名 1 · TkA02G495640 · TK1151
细胞质0.350
排名 2 · TkA02G495640 · TK1151
细胞膜0.101
排名 3 · TkA02G495640 · TK1151
内质网0.074
排名 4 · TkA02G495640 · TK1151
质体0.056
排名 5 · TkA02G495640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12937F-box-like98-136 aa
PF00646F-box99-139 aa
PF07443HARP126-136 aa
PF03478Beta-prop_KIB1-4166-373 aa
PF08268FBA_3178-250 aa
PF07646Kelch_2193-224 aa
PF07734FBA_1195-296 aa
PF25210Kelch_FKB95204-313 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G495640PF12937F-box-like981362.1e-0731.3
TkA02G495640PF00646F-box991391e-0938.6
TkA02G495640PF07443HARP1261361.98.8
TkA02G495640PF03478Beta-prop_KIB1-41663732.6e-0834.4
TkA02G495640PF08268FBA_31782500.0001222.0
TkA02G495640PF07646Kelch_21932240.008616.7
TkA02G495640PF07734FBA_11952965.4e-0729.6
TkA02G495640PF25210Kelch_FKB952043130.001918.6
TkA02G495640PF01344Kelch_12122240.08913.0
TkA02G495640PF07443HARP2142291.98.8
TkA02G495640PF07443HARP2552721.98.8
TkA02G495640PF07646Kelch_22602710.008616.7
TkA02G495640PF01344Kelch_12602710.08913.0
TkA02G495640PF07646Kelch_22802940.008616.7
TkA02G495640PF07646Kelch_23343700.008616.7
TkA02G495640PF08268FBA_33403670.0001222.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFV5拟南芥sp|Q9LFV5|FK111_ARATH F-box/kelch-repeat protein At5g1571085.500%Swiss-Prot高置信
Q9FZK1拟南芥sp|Q9FZK1|FBX6_ARATH F-box only protein 626.400%Swiss-Prot低置信
Q9FGY4拟南芥sp|Q9FGY4|FB341_ARATH F-box protein At5g4961022.900%Swiss-Prot低置信
O82622拟南芥sp|O82622|FB227_ARATH Putative F-box protein At4g1019026.100%Swiss-Prot低置信
Q9LSV6拟南芥sp|Q9LSV6|FB186_ARATH Putative F-box protein At3g2546027.300%Swiss-Prot低置信

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