TkA02G487150 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G487150

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 124621558-124622003 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

312 bp · TkA02G487150|TK1151|cDNA

ATGGCCTTCCCCGATGCGATTCACGCATTTAAACCAAACCCTAAATCGCACATCCAGGAAGACAGGAGAATTCTCGATTTCCTGTCCCACCATCCGGAAAGCTTAAACACCATGAAATTCTGGCTCGATGATGTTGGCATCCTCTTAATTTTTTTTATAATCATCTTAGGTCTGTCAAATTTAATCATGGGTTTCTATTTGGGAAATCCAACACACGAACACAAAGGGTTTGCTAAATTTATCTTACATTCTGGCCTGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

312 bp · TkA02G487150|TK1151|CDS

ATGGCCTTCCCCGATGCGATTCACGCATTTAAACCAAACCCTAAATCGCACATCCAGGAAGACAGGAGAATTCTCGATTTCCTGTCCCACCATCCGGAAAGCTTAAACACCATGAAATTCTGGCTCGATGATGTTGGCATCCTCTTAATTTTTTTTATAATCATCTTAGGTCTGTCAAATTTAATCATGGGTTTCTATTTGGGAAATCCAACACACGAACACAAAGGGTTTGCTAAATTTATCTTACATTCTGGCCTGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

103 aa · TkA02G487150|TK1151|PROTEIN

MAFPDAIHAFKPNPKSHIQEDRRILDFLSHHPESLNTMKFWLDDVGILLIFFIIILGLSNLIMGFYLGNPTHEHKGFAKFILHSGLLIAIIFNLGFQTISENE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G487150`
TK1151 ID	TkA02G487150
OH-1004 ID	LXL04_013575
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G487150

位置 Chr02:124621558-124622003 (+)

描述 Similar to CAT2: Catalase-2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g35090`	催化过氧化物酶体氧化酶产生的过氧化氢 (H2O2) 分解为水和氧，从而保护细胞免受过氧化氢的毒性影响。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: P0C549`	几乎存在于所有需氧呼吸生物中，能够保护细胞免受过氧化氢的毒性影响。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013575 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009648 photoperiodism 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程

GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G35090

dosa:Os02g0115700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.270

排名 1 · TkA02G487150 · TK1151

线粒体0.160

排名 2 · TkA02G487150 · TK1151

质体0.153

排名 3 · TkA02G487150 · TK1151

高尔基体0.136

排名 4 · TkA02G487150 · TK1151

细胞质0.125

排名 5 · TkA02G487150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00199Catalase1-47 aa

PF04834Adeno_E3_14_522-65 aa

PF13800Sigma_reg_N39-72 aa

PF13800Sigma_reg_N87-96 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G487150	`PF00199`	Catalase	1	47	8.5e-08	32.4
TkA02G487150	`PF04834`	Adeno_E3_14_5	22	65	0.025	15.8
TkA02G487150	`PF13800`	Sigma_reg_N	39	72	0.4	11.7
TkA02G487150	`PF13800`	Sigma_reg_N	87	96	0.4	11.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P25819`	拟南芥	sp\|P25819\|CATA2_ARATH Catalase-2	72.300%	Swiss-Prot	低置信
`P0C549`	水稻	sp\|P0C549\|CATA1_ORYSI Catalase isozyme A	70.200%	Swiss-Prot	低置信

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