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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G481520
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 122880381-122881601 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

974 bp · TkA02G481520|TK1151|cDNA

TTTCTCTCCTTCATATTCTTCCCACTTTTCCAACATACCGTACTTAATTTCTTCTTCCACACTTCAATCTCATATTTTAATTCAAACATTCAAATGGGTTTCCATGGGTTCCCCAACGCTGAACTAGTACTGGAGCTAGGCCTTAATTCATCATCCATGGTCGAAACCACCAGAAGACCCACCAAGAAATCTAACCTGATGAGTTTCGATCACCCTCTTGATCAGCCATCGCTAAGCTTGGCTCTTTCCGGTGATTCATG...

CDS

下载 CDS FASTA

849 bp · TkA02G481520|TK1151|CDS

TTTCTCTCCTTCATATTCTTCCCACTTTTCCAACATACCGTACTTAATTTCTTCTTCCACACTTCAATCTCATATTTTAATTCAAACATTCAAATGGGTTTCCATGGGTTCCCCAACGCTGAACTAGTACTGGAGCTAGGCCTTAATTCATCATCCATGGTCGAAACCACCAGAAGACCCACCAAGAAATCTAACCTGATGAGTTTCGATCACCCTCTTGATCAGCCATCGCTAAGCTTGGCTCTTTCCGGTGATTCATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

282 aa · TkA02G481520|TK1151|PROTEIN

FLSFIFFPLFQHTVLNFFFHTSISYFNSNIQMGFHGFPNAELVLELGLNSSSMVETTRRPTKKSNLMSFDHPLDQPSLSLALSGDSCGGAAGGGSSFSNASVKREREVASEDSERGGAIYISGEEGEEDEDGSVNGRKKLRLTKAQSGLLEEAFKLHTTLNPQKKQKLARDLKLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKKCCKRLTDENQRLRREVEEMKTQRVSQPIYMQLSAATLTMCPSCEQIGDTNPASTNI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G481520
TK1151 IDTkA02G481520
OH-1004 IDLXL04_013649
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.007 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G481520
位置Chr02:122880381-122881601 (+)
描述Similar to HAT22: Homeobox-leucine zipper protein HAT22
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37790 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g22800 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g06710 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g60390 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YW03 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013649 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0001217 DNA-binding transcription repressor activity 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22800
ath:AT4G37790
ath:AT5G06710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.979
排名 1 · TkA02G481520 · TK1151
细胞质0.070
排名 2 · TkA02G481520 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA02G481520 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA02G481520 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA02G481520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03367Zn_ribbon_ZPR119-33 aa
PF15753BLOC1S3116-244 aa
PF00046Homeodomain137-191 aa
PF11559ADIP138-179 aa
PF29363ENTR1141-170 aa
PF10234Cluap1144-225 aa
PF27636CCPG1_N152-222 aa
PF05920Homeobox_KN162-189 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G481520PF03367Zn_ribbon_ZPR119330.1212.5
TkA02G481520PF15753BLOC1S31162440.2512.1
TkA02G481520PF00046Homeodomain1371912.5e-1556.7
TkA02G481520PF11559ADIP1381792.88.7
TkA02G481520PF29363ENTR11411700.2411.8
TkA02G481520PF10234Cluap11442250.1612.1
TkA02G481520PF27636CCPG1_N1522220.03815.3
TkA02G481520PF05920Homeobox_KN1621890.0004720.7
TkA02G481520PF07798CCDC90-like1652420.06313.8
TkA02G481520PF25450Rab11-FIP31802260.02315.7
TkA02G481520PF11559ADIP1882262.88.7
TkA02G481520PF18035Bap31_Bap29_C1902240.07713.8
TkA02G481520PF29363ENTR11922300.2411.8
TkA02G481520PF02183HALZ1932256.9e-0936.4
TkA02G481520PF07716bZIP_22002260.1213.1
TkA02G481520PF25143Zn_ribbon_IFT122_C2402500.09213.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P46604拟南芥sp|P46604|HAT22_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT2252.100%Swiss-Prot高置信
P46603拟南芥sp|P46603|HAT9_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT950.900%Swiss-Prot高置信
P46665拟南芥sp|P46665|HAT14_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT1467.500%Swiss-Prot低置信
P46602拟南芥sp|P46602|HAT3_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT361.200%Swiss-Prot低置信
A2YW03水稻sp|A2YW03|HOX27_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX2762.700%Swiss-Prot低置信

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