TkA02G473800 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G473800

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 120918536-120922485 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1072 bp · TkA02G473800|TK1151|cDNA

GAGGTTGCTGTTTTCTATTTCCATTTCGACGGACTATCTGCAGACTGCAATTCGCCATTTTGACTTGTTTCTAATCCGATTTTGGTTACTTTCAAGTTTCAGCTGTGAATTGAAGAAAACTCTATCGTGCATAGAGAAAAGTTTGGATTGTTAGGTGAAAATGATATCTCAGTTGCTATGAAGCAACATTGCACACATAAGTTTTGAAAGGAAAAAAAAATTAGATATCAAACAGCTTAGAATGACAATCAAGGATTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

528 bp · TkA02G473800|TK1151|CDS

ATGACAATCAAGGATTCAAATTCAGAGCTCGTACCTACTGCATCATCCATTTCTCCACCTAATTCCTATGGATCCGTTGTTCTAGGAGGCACCTTTGACCGCTTACATGATGGTCATCGCCTTTTTCTTAAGACAGCTGCAGAGTTGGCTAGGAATCGAGTCGTAGTTGGCATTCTTGACGGCCCTATGTTGTTCAAAAAACAGTTTGCCCATCTTATTACGCCTATTGAACAGCGAAAACAAGTTGTTGAAGATTACAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

175 aa · TkA02G473800|TK1151|PROTEIN

MTIKDSNSELVPTASSISPPNSYGSVVLGGTFDRLHDGHRLFLKTAAELARNRVVVGILDGPMLFKKQFAHLITPIEQRKQVVEDYIKSIKPNLEVQVEHITDPYGPSVVDKNLEAIVVSQETLSGGLSVNKKRAERGLSHLKVEVVNLVSDESSGEKLSSTTLRKREAHIAGKL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G473800`
TK1151 ID	TkA02G473800
OH-1004 ID	LXL04_007178
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	77.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 75.429 / OH-1004 14.815 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G473800

位置 Chr02:120918536-120922485 (+)

描述 Similar to COAD: Phosphopantetheine adenylyltransferase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g18250`	可逆地将腺苷基基团从 ATP 转移至 4'-磷酸泛酰乙胺，产生去磷酸辅酶 A 和焦磷酸。	4'-phosphopantetheine and coenzyme A biosynthesis in plants.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m306321200 The coenzyme a biosynthetic enzyme phosphopantetheine adenylyltransferase plays a crucial role in plant growth, salt/osmotic stress resistance, and seed lipid storage.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.124057

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os07g0179400`	可逆地将腺苷基从ATP转移到4'-磷酸泛酰胺，生成去磷酸辅酶A（dPCoA）和焦磷酸。	暂无已核实直接文献
`Os02g0134000`	可逆地将腺苷基从ATP转移到4'-磷酸泛酰胺，生成去磷酸辅酶A（dPCoA）和焦磷酸。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007178 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0015937 coenzyme A biosynthetic process 生物过程

GO:0019915 lipid storage 生物过程

GO:0080020 regulation of coenzyme A biosynthetic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0004140 dephospho-CoA kinase activity 分子功能

GO:0004595 pantetheine-phosphate adenylyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G18250

dosa:Os02g0134000

dosa:Os07g0179400

hsa:9205

mcf:101867372

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.528

排名 1 · TkA02G473800 · TK1151

细胞核0.248

排名 2 · TkA02G473800 · TK1151

线粒体0.156

排名 3 · TkA02G473800 · TK1151

质体0.092

排名 4 · TkA02G473800 · TK1151

过氧化物酶体0.081

排名 5 · TkA02G473800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06574FAD_syn22-76 aa

PF01467CTP_transf_like27-167 aa

PF06574FAD_syn142-162 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G473800	`PF06574`	FAD_syn	22	76	0.0034	17.9
TkA02G473800	`PF01467`	CTP_transf_like	27	167	6.3e-14	53.0
TkA02G473800	`PF06574`	FAD_syn	142	162	0.0034	17.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZPV8`	拟南芥	sp\|Q9ZPV8\|COAD_ARATH Phosphopantetheine adenylyltransferase	72.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q6ZLC4`	水稻	sp\|Q6ZLC4\|COAD1_ORYSJ Phosphopantetheine adenylyltransferase 1	65.600%	Swiss-Prot	高置信
`B9F2L1`	水稻	sp\|B9F2L1\|COAD2_ORYSJ Phosphopantetheine adenylyltransferase 2	61.900%	Swiss-Prot	高置信

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