TkA02G471120 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G471120

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 120192211-120193967 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1300 bp · TkA02G471120|TK1151|cDNA

GAAAACAATAAAAAAAACGTTTAATCCCCTTCCCCACGCTTCCCAAGAACAAATGATAAAAACTCACAAACCTAATCTAATTTTCCTTCCGTATCAAATCGGGAATCGATTTCATTTTTTTTTCAATCACGATTCTTCGATTTCATTTTTCTTTCATTCCTTCGTTTCTGATCGAGGGTCTTCAGTAGATTGTTGTTGGGAGGAAGTTCATAGTTCCGTTTCCGATTCTTCATTAATGGCCGCTTATGCGGCCTGTATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

927 bp · TkA02G471120|TK1151|CDS

ATGATAAAAACTCACAAACCTAATCTAATTTTCCTTCCGTATCAAATCGGGAATCGATTTCATTTTTTTTTCAATCACGATTCTTCGATTTCATTTTTCTTTCATTCCTTCGTTTCTGATCGAGGGTCTTCAGTAGATTGTTGTTGGGAGGAAGTTCATAGTTCCGTTTCCGATTCTTCATTAATGGCCGCTTATGCGGCCTGTATTCGGGCCGGAACGAGATTAAGATCCGCCCAGGCCATTAACTCATCGGTTCTCAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

308 aa · TkA02G471120|TK1151|PROTEIN

MIKTHKPNLIFLPYQIGNRFHFFFNHDSSISFFFHSFVSDRGSSVDCCWEEVHSSVSDSSLMAAYAACIRAGTRLRSAQAINSSVLRGVFVPTSHITPSSSLSSSHCDPSYIRFSCRQNSQLVQSNSKRVFLVDTLALVRRLEGQGVPSKQAEAITSAITEVLNDSLENVAQSFVSKGEMQRIEMTQDGNLGKFKSQVQSSQENHFSLLQRETEKLRNDIEKMRSELRYEIDKVTAGQRLDLNLERGRIRDELANQNQET...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G471120`
TK1151 ID	TkA02G471120
OH-1004 ID	LXL04_013801
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 80.195 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G471120`
位置	Chr02:120192211-120193967 (+)
描述	Similar to FMP32: Protein FMP32, mitochondrial (Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_013801` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0033617 mitochondrial respiratory chain complex IV assembly 生物过程 GO:2000214 regulation of L-proline metabolic process 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分 GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	hsa:60492 mmu:66365 rno:308820 sce:YFL046W xtr:448234 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.885

排名 1 · TkA02G471120 · TK1151

细胞质0.073

排名 2 · TkA02G471120 · TK1151

细胞核0.071

排名 3 · TkA02G471120 · TK1151

质体0.038

排名 4 · TkA02G471120 · TK1151

细胞膜0.018

排名 5 · TkA02G471120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04884UVB_sens_prot110-177 aa

PF07798CCDC90-like133-306 aa

PF02601Exonuc_VII_L148-279 aa

PF08702Fib_alpha148-228 aa

PF24643DUF7637150-202 aa

PF14362DUF4407158-282 aa

PF28954SHE10_OSW_C163-280 aa

PF20878REST_helical165-224 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G471120	`PF04884`	UVB_sens_prot	110	177	0.084	13.2
TkA02G471120	`PF07798`	CCDC90-like	133	306	2.2e-60	204.2
TkA02G471120	`PF02601`	Exonuc_VII_L	148	279	0.04	14.1
TkA02G471120	`PF08702`	Fib_alpha	148	228	2.1	9.2
TkA02G471120	`PF24643`	DUF7637	150	202	0.052	14.4
TkA02G471120	`PF14362`	DUF4407	158	282	0.57	10.1
TkA02G471120	`PF28954`	SHE10_OSW_C	163	280	0.059	13.3
TkA02G471120	`PF20878`	REST_helical	165	224	0.0043	17.9
TkA02G471120	`PF06818`	Fez1	180	282	0.078	14.2
TkA02G471120	`PF30150`	YGR130C_N	181	277	0.68	10.2
TkA02G471120	`PF04871`	Uso1_p115_C	186	235	2.1	9.4
TkA02G471120	`PF27241`	CLIP1	190	280	0.14	12.9
TkA02G471120	`PF27944`	CEP162_coil_mid	193	228	0.95	10.2
TkA02G471120	`PF16331`	TolA_bind_tri	195	227	0.14	13.0
TkA02G471120	`PF25802`	WWC1	199	268	0.27	11.9
TkA02G471120	`PF12709`	Fungal_TACC	199	230	1.7	9.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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