TkA02G466850 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G466850

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 119071854-119074490 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1495 bp · TkA02G466850|TK1151|cDNA

TGTGGTCAAAAAAACCGCTAAAGCCTAAAAGCCATATGATATGAGAAGGTGATGACGATGTTCTTTATATCCAACATGTCCCCTTTTCAATGATGATATGATTGATGTGTACTGGAGCCGCTGCTATCAACCGCAAGAACACGAATCATCTCCACCACTCTACACCTATTTCAATCAAGATCAAACCCTAGAAAACTTCCATACAGCTTCCTTCTCTCCGCATCAATGGCGGCTTGTTTGGGTTCTGTGTCGGAAATGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1053 bp · TkA02G466850|TK1151|CDS

ATGGCGGCTTGTTTGGGTTCTGTGTCGGAAATGCGTTCCATACGTACGGTTCTCGAAGAACTTGATGAAGAAAAACAAGTCGTCCGACCGGAGACTCCGAATTCAAACCCTAACTCACCGACCTCCACCTCCGCCTCCGTCATGGTGATGCGGCGTAAGGTCGAGAGAATTTTTCCGGTTTATGCACGGGGAAAATTATCTCCAAGATCCGATCCGGCTCTCAATTCGGGTTCGGTTGTAGGGGATTCTATTTGGGATGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

350 aa · TkA02G466850|TK1151|PROTEIN

MAACLGSVSEMRSIRTVLEELDEEKQVVRPETPNSNPNSPTSTSASVMVMRRKVERIFPVYARGKLSPRSDPALNSGSVVGDSIWDAVRVEAKCEAENEPILSSFLYASILSHDCLEKALAFIIANRLQNNTLLETQLMDIFCDVMVQNRGIHRAIRLDLQAFKDRDPSCLSYCSALLYLKGFHSLQTHRVAHALWNQGRKVLALALQSRVSEVFGVDIHPAAKIGEGILLDHGTGLVIGETAVIGDRVSLMQGVTLGGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G466850`
TK1151 ID	TkA02G466850
OH-1004 ID	LXL04_013872
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G466850

位置 Chr02:119071854-119074490 (-)

描述 Similar to SAT4: Serine acetyltransferase 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g35640`	丝氨酸乙酰转移酶4。	暂无已核实直接文献
`At2g17640`	丝氨酸乙酰转移酶2。	暂无已核实直接文献
`At3g13110`	线粒体丝氨酸乙酰基转移酶3。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0133900`	可能的丝氨酸乙酰转移酶2。	暂无已核实直接文献
`Os01g0720700`	可能的丝氨酸乙酰转移酶 1。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013872 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000103 sulfate assimilation 生物过程

GO:0006535 L-cysteine biosynthetic process from L-serine 生物过程

GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009001 serine O-acetyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G55920

ath:AT2G17640

ath:AT4G35640

ath:AT5G56760

dosa:Os03g0133900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.324

排名 1 · TkA02G466850 · TK1151

细胞核0.323

排名 2 · TkA02G466850 · TK1151

质体0.220

排名 3 · TkA02G466850 · TK1151

细胞膜0.094

排名 4 · TkA02G466850 · TK1151

线粒体0.083

排名 5 · TkA02G466850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25084LbH_EIF2B81-98 aa

PF06426SATase_N84-188 aa

PF25087GMPPB_C87-95 aa

PF00132Hexapep217-228 aa

PF25087GMPPB_C217-258 aa

PF14602Hexapep_2237-258 aa

PF00132Hexapep238-258 aa

PF25084LbH_EIF2B241-303 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G466850	`PF25084`	LbH_EIF2B	81	98	0.02	15.6
TkA02G466850	`PF06426`	SATase_N	84	188	4.7e-37	127.2
TkA02G466850	`PF25087`	GMPPB_C	87	95	7.1e-05	23.3
TkA02G466850	`PF00132`	Hexapep	217	228	7.9e-12	45.1
TkA02G466850	`PF25087`	GMPPB_C	217	258	7.1e-05	23.3
TkA02G466850	`PF14602`	Hexapep_2	237	258	0.0036	17.7
TkA02G466850	`PF00132`	Hexapep	238	258	7.9e-12	45.1
TkA02G466850	`PF25084`	LbH_EIF2B	241	303	0.02	15.6
TkA02G466850	`PF00132`	Hexapep	268	301	7.9e-12	45.1
TkA02G466850	`PF25087`	GMPPB_C	268	305	7.1e-05	23.3
TkA02G466850	`PF14602`	Hexapep_2	271	301	0.0036	17.7
TkA02G466850	`PF00132`	Hexapep	342	350	7.9e-12	45.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W2B8`	拟南芥	sp\|Q8W2B8\|SAT4_ARATH Serine acetyltransferase 4	72.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q8S895`	拟南芥	sp\|Q8S895\|SAT2_ARATH Serine acetyltransferase 2	69.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q39218`	拟南芥	sp\|Q39218\|SAT3_ARATH Serine acetyltransferase 3, mitochondrial	51.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q10S58`	水稻	sp\|Q10S58\|SAT2_ORYSJ Probable serine acetyltransferase 2	65.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q8W0E4`	水稻	sp\|Q8W0E4\|SAT1_ORYSJ Probable serine acetyltransferase 1	52.200%	Swiss-Prot	高置信

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