TkA02G459740 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G459740

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 117101588-117111711 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2179 bp · TkA02G459740|TK1151|cDNA

GAAACAGCCAATTCTTAAAGTGGATTACCATGTGGCCACTTTTGTTTCTCTTACCATATCGTCTATGATATATCATTCAATATTATAGCTGAACCTACACAAAGATTTCTCTCTTGTTCTTCCTCTTCTCGTCCTCTCTTAATTAAGCTTTAACCCTTTTCTTTATTACATCTAATCTTTTATTTAAAGATCGGAGTTTTATCTGATCAAGAAAATAAATACAACCAAGCAATATTCTTCCCTTTATTTCAATGATGCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1383 bp · TkA02G459740|TK1151|CDS

ATGGTAGAAGAACTGTTATCTTATATTCAATCCGCTACTCCAAGAACATCCCCTTTCTATGTAGCATCCACAAGGCAAGTTGCAACTCGAAACATGACAGTTTATGCGATTGCACAATGTGTTAAAAACATAAGCCAAAGCATTTGTCAAAGTTGCTTGAATACAGCATACAACAATTTACGTGGATGTCCCCCCAACACGGAAGGAAGGGCAATTGACTTTTTTTGTTTTATGAGGTATTCTGATTCTCCATTTTTTCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

460 aa · TkA02G459740|TK1151|PROTEIN

MVEELLSYIQSATPRTSPFYVASTRQVATRNMTVYAIAQCVKNISQSICQSCLNTAYNNLRGCPPNTEGRAIDFFCFMRYSDSPFFQINQTTNILPFLSTGSSSKSGMIAGVSSGVGLFLIILVLWLWYRQRNKSKNVEEEEPGLQGAQGYSYQDLRLATHNFGDEYRVGKGGFGEVFKAIIDDEHVVAVKKLHMSYSSAKLEFDNEVKLISNIQHRNLVRQLGWCSEGHELLLVLEFMPKGSLDNFLWGDKRGILNWEK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G459740`
TK1151 ID	TkA02G459740
OH-1004 ID	LXL04_013972
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	70.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.130 / OH-1004 72.163 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G459740

位置 Chr02:117101588-117111711 (+)

描述 Similar to CRK42: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 42

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g40380`	富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 42。	暂无已核实直接文献
`At1g70530`	富半胱氨酸受体样蛋白激酶3。	暂无已核实直接文献
`At1g70520`	富半胱氨酸受体样蛋白激酶2。	暂无已核实直接文献
`At1g56130`	可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。	暂无已核实直接文献
`At1g56140`	可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013972 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程

GO:0010193 response to ozone 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0052545 callose localization 生物过程

GO:0072593 reactive oxygen species metabolic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G70520

ath:AT1G70530

ath:AT4G28670

ath:AT5G40380

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.878

排名 1 · TkA02G459740 · TK1151

细胞质0.091

排名 2 · TkA02G459740 · TK1151

内质网0.073

排名 3 · TkA02G459740 · TK1151

细胞核0.047

排名 4 · TkA02G459740 · TK1151

高尔基体0.023

排名 5 · TkA02G459740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung3-82 aa

PF15345TMEM51103-142 aa

PF05445Pox_ser-thr_kin154-189 aa

PF00069Pkinase167-430 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr168-431 aa

PF03109ABC1170-195 aa

PF12330Haspin_kinase232-323 aa

PF17667Pkinase_fungal271-334 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G459740	`PF01657`	Stress-antifung	3	82	4.1e-12	47.3
TkA02G459740	`PF15345`	TMEM51	103	142	0.27	11.7
TkA02G459740	`PF05445`	Pox_ser-thr_kin	154	189	0.25	11.0
TkA02G459740	`PF00069`	Pkinase	167	430	9.7e-47	160.3
TkA02G459740	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	168	431	1.8e-46	159.2
TkA02G459740	`PF03109`	ABC1	170	195	0.025	14.5
TkA02G459740	`PF12330`	Haspin_kinase	232	323	0.0019	18.0
TkA02G459740	`PF17667`	Pkinase_fungal	271	334	0.00097	18.7
TkA02G459740	`PF01636`	APH	272	311	0.043	14.3
TkA02G459740	`PF05445`	Pox_ser-thr_kin	277	298	0.25	11.0
TkA02G459740	`PF03109`	ABC1	279	316	0.025	14.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FNE1`	拟南芥	sp\|Q9FNE1\|CRK42_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 42	40.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9CAL2`	拟南芥	sp\|Q9CAL2\|CRK3_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3	40.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9CAL3`	拟南芥	sp\|Q9CAL3\|CRK2_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 2	37.100%	Swiss-Prot	中等置信
`C0LGH2`	拟南芥	sp\|C0LGH2\|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130	44.400%	Swiss-Prot	中等置信
`C0LGH3`	拟南芥	sp\|C0LGH3\|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140	44.600%	Swiss-Prot	中等置信

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