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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G450410
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 114582235-114585450 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3186 bp · TkA02G450410|TK1151|cDNA

ATGAAACCTCTTTGCTTTAACCGATTTCTTGTCTTTCTTGCTTTGCTTCGTTGTCTCGCTTATGTTAATGGCGATGTTGGTGAAGCTGAGCAGCTATTGTTGTTTAAATCTTCCCTTCAAACCCCAAATCGGTTACCAGATTGGCTCAAAGGAGCAAATCCTTGCAGTTTCACCGGTGTTTCGTGCAGAAACTCCACGGTTTCGTCCATAGATCTGAGCAATATTGATTTGAGCGCAGATTTGGGACTGGTTTCTTCGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

3186 bp · TkA02G450410|TK1151|CDS

ATGAAACCTCTTTGCTTTAACCGATTTCTTGTCTTTCTTGCTTTGCTTCGTTGTCTCGCTTATGTTAATGGCGATGTTGGTGAAGCTGAGCAGCTATTGTTGTTTAAATCTTCCCTTCAAACCCCAAATCGGTTACCAGATTGGCTCAAAGGAGCAAATCCTTGCAGTTTCACCGGTGTTTCGTGCAGAAACTCCACGGTTTCGTCCATAGATCTGAGCAATATTGATTTGAGCGCAGATTTGGGACTGGTTTCTTCGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1061 aa · TkA02G450410|TK1151|PROTEIN

MKPLCFNRFLVFLALLRCLAYVNGDVGEAEQLLLFKSSLQTPNRLPDWLKGANPCSFTGVSCRNSTVSSIDLSNIDLSADLGLVSSSLLTLPGLESFVAKNCNLTGTVSWGSRSQCSKVLSSVDLSVNKIAGSVSDISSLSGCSKLQSLNLSKNLMEFKGVSKPLGLSLQVIDLSFNRISGPEVMPWILSDGCGELVEFNVSSNNISGTVPESLKSCSSLQLFDISRNNFSGVLPMDTLVNLSSLKTLMLAFNNFVGELP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G450410
TK1151 IDTkA02G450410
OH-1004 IDLXL04_014147
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G450410
位置Chr02:114582235-114585450 (-)
描述Similar to Systemin receptor SR160
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743
Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247
The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903
The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0718300 参与油菜素甾醇（BR）信号转导的受体激酶。
Loss of function of a rice brassinosteroid insensitive1 homolog prevents internode elongation and bending of the lamina joint.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.9.1591
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
OsBRI1 Activates BR Signaling by Preventing Binding between the TPR and Kinase Domains of OsBSK3 via Phosphorylation.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01668
OsREM4.1 Interacts with OsSERK1 to Coordinate the Interlinking between Abscisic Acid and Brassinosteroid Signaling in Rice.2016 · DOI: 10.1016/j.devcel.2016.06.011
Os09g0293500 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014147 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010268 brassinosteroid homeostasis 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G39400
dosa:Os01g0718300
sly:101261320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.886
排名 1 · TkA02G450410 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA02G450410 · TK1151
细胞质0.063
排名 3 · TkA02G450410 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA02G450410 · TK1151
溶酶体／液泡0.023
排名 5 · TkA02G450410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_228-62 aa
PF23952LRR_EndoS65-78 aa
PF24758LRR_At5g5637067-158 aa
PF12799LRR_470-104 aa
PF23598LRR_1481-154 aa
PF23286LRR_1386-152 aa
PF12799LRR_493-130 aa
PF00560LRR_194-108 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G450410PF08263LRRNT_228621.1e-0835.9
TkA02G450410PF23952LRR_EndoS65788.07.4
TkA02G450410PF24758LRR_At5g56370671580.00816.6
TkA02G450410PF12799LRR_4701041.9e-2279.5
TkA02G450410PF23598LRR_14811543e-1350.0
TkA02G450410PF23286LRR_13861520.2511.7
TkA02G450410PF12799LRR_4931301.9e-2279.5
TkA02G450410PF00560LRR_1941082.3e-44140.5
TkA02G450410PF00560LRR_11201402.3e-44140.5
TkA02G450410PF13855LRR_81201791.8e-33114.8
TkA02G450410PF24048LRR_NXF1-51201720.0215.2
TkA02G450410PF13516LRR_61201310.2912.0
TkA02G450410PF12799LRR_41221541.9e-2279.5
TkA02G450410PF24141LRR_ComC1231659e-0626.3
TkA02G450410PF23952LRR_EndoS1262288.07.4
TkA02G450410PF13516LRR_61431540.2912.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22476拟南芥sp|O22476|BRI1_ARATH Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 166.600%Swiss-Prot高置信
Q942F3水稻sp|Q942F3|BRI1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRI168.200%Swiss-Prot中等置信
Q69JN6水稻sp|Q69JN6|BRL1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL160.400%Swiss-Prot中等置信

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