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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G447090
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 113668610-113670716 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1518 bp · TkA02G447090|TK1151|cDNA

CTGCAAAGGTAAAGGACGGACACCTGTGAGACCCATTTCACCTGGATCCTACACGTCGTCATCATGAATCATGATGCAGCTCCAGTTTAATTTTCTTCATATCGGAAATGGAGTCGATTCTCGTGTTCTTCCGACTTCGATTTAACGGATAACACCAGTTCCTCAGTGTTTGTGATGCGAACTAGAACTACTGTAGCTCTTTCCTGGCGCATACTGGCCAATAAGTCGTTCAGTTCGTTTTCCGTGACGCCAAATCGTTT...

1071 bp · TkA02G447090|TK1151|CDS

ATGCGAACTAGAACTACTGTAGCTCTTTCCTGGCGCATACTGGCCAATAAGTCGTTCAGTTCGTTTTCCGTGACGCCAAATCGTTTAGTCAAGTCCTCTTTTGGTTGCCTAGACCGCCCTGATATATGGTGTCCCTCTCCATTGCCGTCTGGAGTTTCTTCGCATCTTAGACACGCCTATAATGAGCATACAGCAGCCGAAATTGATGGGAAATCGATTGCCAATGAAATTAAAGCTACATTAGCGACCGAAGTTTGTAA...

356 aa · TkA02G447090|TK1151|PROTEIN

MRTRTTVALSWRILANKSFSSFSVTPNRLVKSSFGCLDRPDIWCPSPLPSGVSSHLRHAYNEHTAAEIDGKSIANEIKATLATEVCNMKNSIGKVPGLGLILVGKRKDSLSFVRIKKKTCEQVRNASVIIQLPEDCTQDEVLNVISTLNHKESVHGILVQLPLPNHLCEEKIIKSVNVEKDVDGFHPVNMGNLAMTGREPLFVPCASRGCIEVLNRCNVEILGKKAVVIGRSMIGGLPTSLLLQRHHATVTVVHAFTKNP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G447090
TK1151 IDTkA02G447090
OH-1004 IDLXL04_014216
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 84.146
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G447090
位置Chr02:113668610-113670716 (+)
描述Similar to FOLD1: Bifunctional protein FolD 1, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38660 催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 暂无已核实直接文献
At4g00620 催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 暂无已核实直接文献
At3g12290 催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 暂无已核实直接文献
At4g00600 催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_014216 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0000105 L-histidine biosynthetic process 生物过程
GO:0006164 purine nucleotide biosynthetic process 生物过程
GO:0009086 methionine biosynthetic process 生物过程
GO:0009853 photorespiration 生物过程
GO:0035999 tetrahydrofolate interconversion 生物过程
GO:0046653 tetrahydrofolate metabolic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004477 methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity 分子功能
GO:0004488 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38660
ath:AT3G12290
ath:AT4G00600
ath:AT4G00620
lmo:lmo1360
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

线粒体0.861
排名 1 · TkA02G447090 · TK1151
细胞质0.084
排名 2 · TkA02G447090 · TK1151
质体0.064
排名 3 · TkA02G447090 · TK1151
细胞核0.052
排名 4 · TkA02G447090 · TK1151
细胞膜0.015
排名 5 · TkA02G447090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00763THF_DHG_CYH68-183 aa
PF18213SUB1_ProdP9107-152 aa
PF02882THF_DHG_CYH_C204-349 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G447090PF00763THF_DHG_CYH681831e-35123.2
TkA02G447090PF18213SUB1_ProdP91071520.00417.6
TkA02G447090PF02882THF_DHG_CYH_C2043493.4e-49166.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A2RVV7拟南芥sp|A2RVV7|FOLD1_ARATH Bifunctional protein FolD 1, mitochondrial55.700%Swiss-Prot高置信
O65271拟南芥sp|O65271|FOLD4_ARATH Bifunctional protein FolD 4, chloroplastic56.900%Swiss-Prot高置信
Q9LHH7拟南芥sp|Q9LHH7|FOLD2_ARATH Bifunctional protein FolD 249.800%Swiss-Prot中等置信
O65269拟南芥sp|O65269|FOLD3_ARATH Bifunctional protein FolD 3, chloroplastic49.700%Swiss-Prot中等置信

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