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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G439200
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 111589569-111590054 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

486 bp · TkA02G439200|TK1151|cDNA

ATGACTCCAACAAAAGCAAGTTTTTCTACATATATCAATATCGAACACATATTCATTCTTCTTTGTTTCATTCAAGACACTGTTTTATCTGTATGTTGCTTCATCGGTATCTCTAAACCGATCGAACTCCATCACGACCACCATCATCAAAAAGTACCAGATAACCCTCCTATATCTGCGGTTTTGACTCGAGAGTTCCTCCTGACCAGAAAATTCAAGGACATCATGGGAAATGAATCGAAAGATTGTTCAATATGTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

486 bp · TkA02G439200|TK1151|CDS

ATGACTCCAACAAAAGCAAGTTTTTCTACATATATCAATATCGAACACATATTCATTCTTCTTTGTTTCATTCAAGACACTGTTTTATCTGTATGTTGCTTCATCGGTATCTCTAAACCGATCGAACTCCATCACGACCACCATCATCAAAAAGTACCAGATAACCCTCCTATATCTGCGGTTTTGACTCGAGAGTTCCTCCTGACCAGAAAATTCAAGGACATCATGGGAAATGAATCGAAAGATTGTTCAATATGTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

161 aa · TkA02G439200|TK1151|PROTEIN

MTPTKASFSTYINIEHIFILLCFIQDTVLSVCCFIGISKPIELHHDHHHQKVPDNPPISAVLTREFLLTRKFKDIMGNESKDCSICLDEFEMDDDIRCLTNCRHMFHQKCLDSWMDQIQDSCPLCRNPILPLACQEEYKERLCAVTDLNNSYKRDFVNLDS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G439200
TK1151 IDTkA02G439200
OH-1004 IDLXL04_022621
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)73.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.758 / OH-1004 51.815
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G439200
位置Chr02:111589569-111590054 (-)
描述Similar to BRH1: Brassinosteroid-responsive RING protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61460 可能参与油菜素甾醇信号通路并调节莲座叶的生长发育。
Characterisation of BRH1, a brassinosteroid-responsive RING-H2 gene from Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1007/s00425-001-0723-z
Overexpressed BRH1, a RING finger gene, alters rosette leaf shape in Arabidopsis thaliana.2018 · DOI: 10.1007/s11427-017-9133-8
At3g62690 RING-H2 指蛋白 ATL5。 暂无已核实直接文献
At2g47560 RING-H2 指蛋白 ATL64。 暂无已核实直接文献
At5g46650 RING-H2 指蛋白 ATL30。 暂无已核实直接文献
At2g35910 RING-H2 锌指蛋白 ATL70。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022621 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0047484 regulation of response to osmotic stress 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1901371 regulation of leaf morphogenesis 生物过程
GO:1905421 regulation of plant organ morphogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23980
ath:AT2G01150
ath:AT2G35420
ath:AT3G18930
ath:AT3G61460
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.264
排名 1 · TkA02G439200 · TK1151
内质网0.259
排名 2 · TkA02G439200 · TK1151
细胞质0.253
排名 3 · TkA02G439200 · TK1151
细胞膜0.229
排名 4 · TkA02G439200 · TK1151
细胞核0.178
排名 5 · TkA02G439200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15227zf-C3HC4_410-23 aa
PF14835zf-RING_614-32 aa
PF13923zf-C3HC4_215-25 aa
PF14634zf-RING_516-33 aa
PF14447Prok-RING_421-25 aa
PF15227zf-C3HC4_432-41 aa
PF14446Prok-RING_179-111 aa
PF13920zf-C3HC4_380-129 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G439200PF15227zf-C3HC4_410239.47.1
TkA02G439200PF14835zf-RING_614321.89.2
TkA02G439200PF13923zf-C3HC4_215251.1e-0732.2
TkA02G439200PF14634zf-RING_516331.9e-0731.7
TkA02G439200PF14447Prok-RING_421251.89.2
TkA02G439200PF15227zf-C3HC4_432419.47.1
TkA02G439200PF14446Prok-RING_1791110.01716.0
TkA02G439200PF13920zf-C3HC4_3801298e-0523.1
TkA02G439200PF17120zf-RING_16801230.001618.8
TkA02G439200PF22908PHD_NSD811190.212.7
TkA02G439200PF22191IBR_1811152.48.9
TkA02G439200PF13639zf-RING_2821262.5e-1247.5
TkA02G439200PF17123zf-RING_11821112.3e-1040.7
TkA02G439200PF14634zf-RING_5821261.9e-0731.7
TkA02G439200PF11793FANCL_C821211.210.2
TkA02G439200PF13923zf-C3HC4_2831251.1e-0732.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XF92拟南芥sp|Q9XF92|BRH1_ARATH Brassinosteroid-responsive RING protein 138.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LZJ6拟南芥sp|Q9LZJ6|ATL5_ARATH RING-H2 finger protein ATL551.000%Swiss-Prot低置信
O22255拟南芥sp|O22255|ATL64_ARATH RING-H2 finger protein ATL6447.200%Swiss-Prot低置信
Q9FIR0拟南芥sp|Q9FIR0|ATL30_ARATH RING-H2 finger protein ATL3031.100%Swiss-Prot中等置信
Q8RX29拟南芥sp|Q8RX29|ATL70_ARATH RING-H2 finger protein ATL7040.800%Swiss-Prot低置信

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