RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G431940
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 109703552-109709078 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3043 bp · TkA02G431940|TK1151|cDNA

TGGTCTTTACCTCTTTCGGATTATACCCCTAAACTAAAATATTAGGAATTATTCAAACTTTTGGTCTACTTTCCATGTAAGAGTAATCAATTGCTTACAACGGAAGCACAAAAAGCTTCACCTAAAACTCATTTATTAAGTTGTAACCCCCACCATAATAATCATTAATCCCCCTTTCACGCACTTATTATTTTGTTCTTCCCAAATTTCTCCGTAATCCTAAAATTGTTACGAGAACAATTTGCGTGTTGTTTGTTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2127 bp · TkA02G431940|TK1151|CDS

ATGGATTCTGAGAGATTGAAAGAGAATGTCACTGTTACCGTCCGGTTCCGGCCGCTCAGTCCGAGAGAAATACGACAAGGGGAGGAGATTGCATGGTATGCCGACGGAGAAACTATCGTTCGAAATGAGTATACTTCCTCAATAGCTTATGCATATGATCAAGTTTTTGGGCCTACAACCACTACACGCCATGTATATGATACTGCAGCCCAACATGTTGTAAATGGTGCTATGAAAGGCATTAATGGCACTATTTTTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

708 aa · TkA02G431940|TK1151|PROTEIN

MDSERLKENVTVTVRFRPLSPREIRQGEEIAWYADGETIVRNEYTSSIAYAYDQVFGPTTTTRHVYDTAAQHVVNGAMKGINGTIFAYGVTSSGKTHTMHGNQRSPGVIPLAIKHAFSIIQETPCREFLLRLSYLEIYNEVVHDLLNPTGQNLRIREDSQGTFVDGIKEEVVLSPAHALSIIAAGEEQRHVGSTNLNLHSSRSHTIFTLTIESSPCGEDNEDEAVHLSQLNLIDLAGSESSKAETTGIRRKEGSYINKSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G431940
TK1151 IDTkA02G431940
OH-1004 IDLXL04_014387
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 90.355
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G431940
位置Chr02:109703552-109709078 (+)
描述Similar to KIN7K: Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12020 类驱动蛋白KIN-7K，叶绿体型。 暂无已核实直接文献
At5g06670 类动力蛋白KIN-7L，叶绿体型。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0775400 可能的向负端驱动电机蛋白，具有微管增强的 ATP 酶活性。 暂无已核实直接文献
Os04g0434600 类驱动蛋白 KIN-7E，叶绿体定位。 暂无已核实直接文献
Os06g0206700 类驱动蛋白 KIN-7G。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014387 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G12020
ath:AT5G06670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.719
排名 1 · TkA02G431940 · TK1151
细胞核0.255
排名 2 · TkA02G431940 · TK1151
细胞膜0.076
排名 3 · TkA02G431940 · TK1151
溶酶体／液泡0.070
排名 4 · TkA02G431940 · TK1151
高尔基体0.055
排名 5 · TkA02G431940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd7-146 aa
PF00225Kinesin15-328 aa
PF07686V-set296-313 aa
PF16796Microtub_bd302-330 aa
PF01166TSC22335-357 aa
PF28743IPGAL2_N335-361 aa
PF04102SlyX337-364 aa
PF27557CC1_STRIPAK378-389 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G431940PF16796Microtub_bd71462.9e-2073.5
TkA02G431940PF00225Kinesin153288.6e-107357.6
TkA02G431940PF07686V-set2963130.1712.8
TkA02G431940PF16796Microtub_bd3023302.9e-2073.5
TkA02G431940PF01166TSC223353570.004118.0
TkA02G431940PF28743IPGAL2_N3353611.39.5
TkA02G431940PF04102SlyX3373646.28.3
TkA02G431940PF27557CC1_STRIPAK3783893.68.4
TkA02G431940PF07686V-set3864380.1712.8
TkA02G431940PF28743IPGAL2_N5045611.39.5
TkA02G431940PF04102SlyX5095566.28.3
TkA02G431940PF01166TSC225105200.004118.0
TkA02G431940PF00225Kinesin5135948.6e-107357.6
TkA02G431940PF16796Microtub_bd5295492.9e-2073.5
TkA02G431940PF01166TSC225355640.004118.0
TkA02G431940PF27557CC1_STRIPAK5365543.68.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4J8L3拟南芥sp|F4J8L3|KN7K_ARATH Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic50.900%Swiss-Prot高置信
F4K3X8拟南芥sp|F4K3X8|KN7L_ARATH Kinesin-like protein KIN-7L, chloroplastic74.800%Swiss-Prot中等置信
Q6YZ52水稻sp|Q6YZ52|KN7D_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7D, chloroplastic73.200%Swiss-Prot中等置信
B9FFA3水稻sp|B9FFA3|KN7E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7E, chloroplastic65.900%Swiss-Prot中等置信
B9FS33水稻sp|B9FS33|KN7G_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7G47.400%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看