TkA02G427340 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G427340

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 108571548-108572915 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1368 bp · TkA02G427340|TK1151|cDNA

ATGGCTCCTCCTTCTTATCTCTTATTTCTCACTCTTATCTCTATACTCAATCTCTGTATCCCTTCATCTTCTTCACTCGACACCCTCACACTTTCTCTAACCCAACACATTGCACCAGAAACCAACAAACATCCATGGCTGCAGACCATAAACTCCCTCGCGTCATCTTCTATAACCAGAGCGCATCACCTCAAAAACCCCAATTCTTCTTCAACCTCAAAAATCAATCTATTTCCTCAAAGCTATGGCGGATACTCTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1368 bp · TkA02G427340|TK1151|CDS

ATGGCTCCTCCTTCTTATCTCTTATTTCTCACTCTTATCTCTATACTCAATCTCTGTATCCCTTCATCTTCTTCACTCGACACCCTCACACTTTCTCTAACCCAACACATTGCACCAGAAACCAACAAACATCCATGGCTGCAGACCATAAACTCCCTCGCGTCATCTTCTATAACCAGAGCGCATCACCTCAAAAACCCCAATTCTTCTTCAACCTCAAAAATCAATCTATTTCCTCAAAGCTATGGCGGATACTCTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

455 aa · TkA02G427340|TK1151|PROTEIN

MAPPSYLLFLTLISILNLCIPSSSSLDTLTLSLTQHIAPETNKHPWLQTINSLASSSITRAHHLKNPNSSSTSKINLFPQSYGGYSVSLSFGSPPQKLSFVMDTGSSLVWFPCTHRYTCSDCSFPNVNQTNIPKFIPKLSSSAKLIGCKNKKCGWVFGSTDPIQCNGNQMCPAYMLQYGSGSTSGLLLSETLDFNEGDATDFLVGCSILSTRQPSGIAGFGRGSASLPVQMGLKKFSYCLVSHKYDDAPVSSDLILVRSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G427340`
TK1151 ID	TkA02G427340
OH-1004 ID	LXL04_014418
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G427340

位置 Chr02:108571548-108572915 (-)

描述 Similar to nep2: Aspartic proteinase nepenthesin-2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g01300`	天冬氨酰蛋白酶。	暂无已核实直接文献
`At5g36260`	显示天冬氨酸蛋白水解活性。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0448500`	参与绒毡层程序性细胞死亡 (PCD) 的花药特异性天冬氨酸蛋白酶。	EAT1 promotes tapetal cell death by regulating aspartic proteases during male reproductive development in rice.2013 · DOI: 10.1038/ncomms2396

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014418 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006508 proteolysis 生物过程

GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G01300

ath:AT4G16563

dosa:Os03g0186900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.506

排名 1 · TkA02G427340 · TK1151

细胞膜0.204

排名 2 · TkA02G427340 · TK1151

内质网0.125

排名 3 · TkA02G427340 · TK1151

细胞质0.077

排名 4 · TkA02G427340 · TK1151

溶酶体／液泡0.052

排名 5 · TkA02G427340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14543TAXi_N85-243 aa

PF00026Asp85-450 aa

PF13920zf-C3HC4_3104-123 aa

PF23739HTH_72286-312 aa

PF14541TAXi_C290-451 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G427340	`PF14543`	TAXi_N	85	243	3.4e-27	96.5
TkA02G427340	`PF00026`	Asp	85	450	5.4e-22	79.3
TkA02G427340	`PF13920`	zf-C3HC4_3	104	123	0.024	15.1
TkA02G427340	`PF23739`	HTH_72	286	312	0.21	12.3
TkA02G427340	`PF14541`	TAXi_C	290	451	5.3e-37	127.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LNJ3`	拟南芥	sp\|Q9LNJ3\|APF2_ARATH Aspartyl protease family protein 2	30.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q4V3D2`	拟南芥	sp\|Q4V3D2\|ASP36_ARATH Aspartic proteinase 36	26.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q7XV21`	水稻	sp\|Q7XV21\|AP37_ORYSJ Aspartyl protease 37	25.700%	Swiss-Prot	低置信

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